ERCC1、TNF-α單核苷酸多態(tài)性與廣西壯族人群肝癌易感性的關(guān)系研究
發(fā)布時間:2018-02-24 11:28
本文關(guān)鍵詞: ERCC1 TNF-α 原發(fā)性肝細(xì)胞癌 單核苷酸多態(tài)性 易感性 出處:《廣西醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:目的目前,在肝癌相關(guān)基因位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性與肝癌易感性的關(guān)系研究中,DNA修復(fù)基因是一大研究熱點(diǎn),切除修復(fù)交叉互補(bǔ)基因1(excision repair cross-complementation group 1,ERCC1)為核苷酸切除修復(fù)途徑中的關(guān)鍵基因之一,其基因中不同位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性可能會影響到DNA切除修復(fù)的功能差異,導(dǎo)致包括腫瘤等各種惡性疾病的發(fā)生。在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中,大多數(shù)患者伴隨著慢性炎癥,且炎癥慢性遷延影響腫瘤的病情。因此,炎癥中的細(xì)胞因子也是肝癌發(fā)生和發(fā)展的重要因素,在這些較熱門的細(xì)胞因子中,腫瘤壞死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)是其中之一。本次研究主要探討ERCC1-4533/-8092、TNF-α-238/-308共四個基因位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性及全血ERCC1 m RNA表達(dá)水平、血清TNF-α含量水平與廣西壯族人群肝癌易感性的關(guān)系及其臨床意義。方法采用1:1病例對照的研究方法,其中肝癌組為80例新發(fā)未經(jīng)治療的原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者,對照組為同期入院的,其年齡、性別與肝癌組匹配的非腫瘤疾病患者共80例。用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-restrietion fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技術(shù)檢測ERCC1-4533/-8092、TNF-α-238/-308共四個位點(diǎn)的單核苷多態(tài)性,以實(shí)時定量熒光逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(Quantitative Real-time PCR,q RT-PCR)方法檢測外周血ERCC1 m RNA表達(dá)水平,運(yùn)用雙抗體夾芯酶聯(lián)免疫吸附法(Enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)檢測血清TNF-α含量水平。數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析使用SPSS17.0軟件。哈迪-溫伯格遺傳平衡(Hardy-Weinberg equilibrium)定律檢驗(yàn)用于判斷對照組研究對象的基因型分布是否具有群體代表性及可比性。獨(dú)立樣本T檢驗(yàn)統(tǒng)計分析研究對象基本信息,方差分析方法統(tǒng)計分析單核苷酸多態(tài)性分型和等位基因在肝癌組和對照組之間的分布差異,秩和檢驗(yàn)統(tǒng)計分析單核苷酸多態(tài)性分型與基因表達(dá)之間的關(guān)系,非條件性Logistic回歸方法統(tǒng)計分析校正性別、年齡、飲酒、吸煙、HBs Ag陽性和血清AFP含量水平等混雜因素,計算相對危險度(odds ration,OR)及其95%可信區(qū)間(confidence interval,95%CI)。當(dāng)P0.05時,差別認(rèn)為具有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)果1.肝癌組ERCC1-4533和8092,TNF-α-238和308位點(diǎn)的基因分型分布頻率均符合采用哈迪-溫伯格遺傳平衡定律(P0.05)。2.ERCC1的單核苷酸多態(tài)性及其基因表達(dá)水平與肝癌易感性的統(tǒng)計分析結(jié)果:ERCC1-4533位點(diǎn)的基因分型和等位基因頻率在肝癌組和對照組的頻數(shù)分布差異不具有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。而ERCC1-8092位點(diǎn)的基因分型在肝癌組和對照組的頻數(shù)分布差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。ERCC1-4533位點(diǎn)的基因突變與肝癌易感易感性無相關(guān)性(OR=1.574,95%CI:0.495-5.003)。與攜帶ERCC1-8092 CC基因型的個體相比,基因分型為ERCC1-C8092 CA/AA的個體的肝癌易感性更高(OR=3.255,95%CI:1.954-11.105)。ERCC1-8092位點(diǎn)的等位基因頻率亦在肝癌組和對照組的頻數(shù)分布差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。肝癌組的全血ERCC1 m RNA表達(dá)水平高于對照組(P0.05),ERCC1的m RNA表達(dá)水平與基因分型無關(guān)(P0.05)。3.TNF-α的單核苷酸多態(tài)性及其基因表達(dá)與肝癌易感性的統(tǒng)計分析結(jié)果:TNF-α-238位點(diǎn)的基因分型和等位基因頻率在肝癌組和對照組的頻數(shù)分布差異不具有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。而TNF-α-308位點(diǎn)的基因分型在肝癌組和對照組的頻數(shù)分布具有統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05)。TNF-α-238位點(diǎn)的基因突變與肝癌易感易感性無相關(guān)性(OR=0.831,95%CI:0.180-3.824)。與攜帶TNF-α-308 GG基因型的個體相比,攜帶TNF-α-308位點(diǎn)GA/AA基因型的個體具的肝癌易感性更高(OR=5.288,95%CI:1.287-21.734)。肝癌組中原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者血清TNF-α水平顯著高于對照組(P0.05),TNF-α-308 GA/AA基因分型的血清含量TNF-α水平較TNF-αGG基因分型高(P0.05)。結(jié)論原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者的全血ERCC1 m RNA和血清TNF-α含量水平高于正常對照組。ERCC1-8092、TNF-α-308位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性可能與廣西地區(qū)壯族人群原發(fā)性肝細(xì)胞癌易感性有關(guān)。
[Abstract]:Objective To investigate the relationship between single nucleotide polymorphism of ERCC1 - 4533 / -8092 and TNF - 偽 - 238 / -308 and its clinical significance . In the course of development of tumor , there were 80 cases of non - tumor diseases , such as ERCC1 - 4533 / -8092 , TNF - 偽 - 238 / -308 , and TNF - 偽 - 238 / -308 . Relative risk ( odds ration , OR ) and 95 % confidence interval ( 95 % CI ) were calculated by confounding factors such as age , alcohol consumption , smoking , HBsAg positive and serum AFP level . Results : The frequencies of ERCC1 - 4533 and ERCC1 - 8092 were significantly higher than those in control group ( P0.05 ) .
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R735.7
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號:1530072
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