肝臟局灶性結(jié)節(jié)性增生的全外顯子測序研究
本文關(guān)鍵詞: 肝臟局灶性結(jié)節(jié)性增生 全外顯子組測序 TRPS1 出處:《北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院》2015年博士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:背景肝臟局灶性結(jié)節(jié)性增生(Focal nodular hyperplasia, FNH)是臨床中第二高發(fā)的良性肝臟腫瘤,僅次于肝血管瘤,女性人群的發(fā)病率明顯高于男性,男/女比例在1:8-1:12,并且女性患者的年齡主要分布于30至50歲之間。大多數(shù)FNH患者無明顯臨床癥狀,相應(yīng)病灶通常是在腹部影像學(xué)篩查時偶然發(fā)現(xiàn),即使部分患者有腹痛癥狀,但其與病變本身是否有直接關(guān)系目前尚無定論。經(jīng)典FNH組織病理學(xué)特點為:以纖維瘢痕為中心,由呈放射狀的纖維板性隔膜分割而成的無包膜性肝細(xì)胞增生性結(jié)節(jié)。中央纖維瘢痕區(qū)通常含有管徑大小不同的異常血管以及增生膽小管。而非典型FNH約占到總病例數(shù)的20%,共同特點為無中央纖維瘢痕性結(jié)構(gòu),其中包含三種亞型分別為毛細(xì)血管擴張型(Telangiectatic FNH, tFNH)、增生腺瘤混合型和非典型細(xì)胞型。FNH的病生理機制考慮是由已有的血管結(jié)構(gòu)紊亂所致的增生性改變,目前認(rèn)為其本身并無潛在惡變風(fēng)險。分子生物學(xué)方面的研究認(rèn)為100%典型FNH具有多克隆性,75-100% tFNH與100%肝細(xì)胞腺瘤具有單克隆性。臨床上,非典型FNH與肝細(xì)胞腺瘤、纖維板層狀肝細(xì)胞肝癌較難鑒別。二代測序技術(shù)是新一代高通量測序技術(shù),具有高靈敏度、高測序效率、相對低成本的優(yōu)勢。全外顯子組測序基于二代測序技術(shù)平臺,可以全面篩查具有編碼蛋白功能的全外顯子組內(nèi)的突變情況,對腫瘤學(xué)研究有重要的突破作用。實驗?zāi)康耐ㄟ^全外顯子測序技術(shù),對FNH病變的全外顯子組進行全面篩查,期望可以發(fā)現(xiàn)特異的突變,對FNH的病因、病生理機制、生物學(xué)特性或者與其他肝臟病變的鑒別中有一定提示作用。FNH雖為第二高發(fā)的肝臟良性腫瘤,但其發(fā)病率仍相對較低。少見腫瘤中可能會發(fā)現(xiàn)特異的基因突變。以少見腫瘤的特異突變?yōu)榍腥朦c,研究特異基因的功能,進而推廣到其他腫瘤中驗證該基因在腫瘤發(fā)生機制中的作用,期望對腫瘤學(xué)機制研究能有一定的提示作用。實驗材料和方法1.病例收集2011年至2014年由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院腹部肝膽外科手術(shù)切除肝臟局灶病變,術(shù)后病理診斷為FNH的病例5例。收集相應(yīng)腫瘤組織標(biāo)本及對照全血標(biāo)本。2.全外顯子組測序?qū)嶒灨鶕?jù)全外顯子組測序的規(guī)范流程,完成gDNA提取、配對驗證、建立DNA文庫、外顯子富集、上級測序、生物信息學(xué)分析的實驗步驟。3.數(shù)據(jù)分析通過復(fù)習(xí)文獻,根據(jù)生物學(xué)功能、突變頻率等因素進一步總結(jié)選出感興趣的候選基因。4.驗證對候選基因進行PCR/Sanger驗證。實驗結(jié)果全外顯子組測序生物信息分析結(jié)果顯示5例FNH標(biāo)本中發(fā)現(xiàn)158個突變,選出4個候選基因:ARID2、EGFR、TRPS1、DAXX,其中TRPS1在2例標(biāo)本中檢測到2個不同突變。對這5個突變進行了PCR/Sanger驗證,得到了其中4個突變的陽性驗證結(jié)果,包括ARID2基因14號外顯子的錯義突變、EGFR基因6號外顯子的移碼突變、TRPS1基因3號外顯子的錯義突變及其5號外顯子的終止密碼子獲得突變。結(jié)論TRPS1基因在2例標(biāo)本中均發(fā)現(xiàn)突變,突變頻率較高,與FNH發(fā)病機制相關(guān)可能性大。相關(guān)研究提示TRPS1基因的表達具有抗纖維化的作用,而典型FNH的主要病理表現(xiàn)是中央纖維瘢痕,兩者之間可能存在相關(guān)性,需進一步擴大樣本量以及相關(guān)功能學(xué)研究進行作證。
[Abstract]:Background : Focal nodular hyperplasia ( FNH ) is a benign liver tumor with high sensitivity , high sequencing efficiency and low cost . The results of PCR / Sanger analysis showed that there were 158 mutations in 5 cases of FNH , 4 candidate genes were identified as AR2 , EGFR , TRl and DAXX .
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R735.7
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5 王楷[,
本文編號:1492060
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