MiR-144-451基因簇與食管癌發(fā)病關(guān)系研究
本文關(guān)鍵詞: 食管癌 miR-144-451 基因簇 腫瘤生物標(biāo)志物 出處:《東南大學(xué)》2016年碩士論文 論文類(lèi)型:學(xué)位論文
【摘要】:miRNA可以與mRNA的3'UTR區(qū)結(jié)合,調(diào)控相應(yīng)編碼蛋白表達(dá),在基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中發(fā)揮重要作用。miRNA調(diào)控異常可致機(jī)體細(xì)胞功能異常,研究發(fā)現(xiàn)miRNA異常表達(dá)與腫瘤發(fā)生密切相關(guān), miRNA可能成為腫瘤診斷的重要分子標(biāo)志物。部分miRNA的編碼基因在染色體上位置緊鄰,成簇排列形成miRNA基因簇,研究發(fā)現(xiàn)這些成簇排列的miRNA在表達(dá)和功能上具有較高的相關(guān)性,miRNA基因簇可能作為一個(gè)功能單位,整體調(diào)控生物信號(hào)傳導(dǎo)通路。作為潛在的生物標(biāo)志物,miRNA基因簇能夠更好的反映miRNA對(duì)機(jī)體復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控,因而更加靈敏、可靠。本研究在江蘇省淮安食管癌患者食管癌組織和癌旁組織中分析了miR-144-451基因簇的表達(dá)特征,探討了miR-144-451基因簇異常表達(dá)與食管癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系;并進(jìn)一步在miR-144-451基因簇的穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞模型中初步探討了miR-144-451基因簇在食管癌發(fā)生發(fā)展中的生物學(xué)功能及調(diào)控機(jī)制。一、miR-144-451基因簇與食管癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的病例對(duì)照研究招募淮安市第一人民醫(yī)院2011~2012年101例病理確診食管癌患者。使用QRT-PCR技術(shù)分別檢測(cè)食管癌組織和配對(duì)癌旁組織中miR-144-451基因簇單一miRNA(miR-144-3p、miR-144-5p、miR-451a、miR-4732、miR-4732-5p)的表達(dá),與癌旁組織相比,食管癌組織中miR-144-3p、miR-144-5p、miR-451a顯著低表達(dá),其表達(dá)量2-△△CT分別是癌旁組織的37.6%、46.7%、44.3%,miR-4732-5p、miR-4732-3p的表達(dá)在癌組織和癌旁組織中沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。應(yīng)用單純病例研究分析環(huán)境因素與miR-144-3p、miR-144-5p、miR-451a表達(dá)改變之間的關(guān)系,結(jié)果顯示miR-144-3p、miR-144-5p的異常表達(dá)與喜食硬食有交互作用,miR-144-5p、miR-451a異常表達(dá)與飲水類(lèi)型有交互作用(P0.05)�;趍iR-144-451基因簇內(nèi)的miRNAs可能存在共表達(dá)的特征,對(duì)各miRNA表達(dá)量經(jīng)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換后進(jìn)行Pearson相關(guān)性分析,結(jié)果顯示5種miRNA兩兩之間表達(dá)相關(guān)性均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.001),其中miR-4732-5p與miR-144-5p表達(dá)高度相關(guān)(P0.731)。進(jìn)一步應(yīng)用主成分Logistic回歸分析,識(shí)別了miR-144-451基因簇中的兩個(gè)代表性miRNAs: miR-144-3p和miR-144-5p,兩者的低表達(dá)可增加食管癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。二、miR-144-451基因簇對(duì)食管癌細(xì)胞生物行為影響1使用miRNA mimics轉(zhuǎn)染EC9706細(xì)胞,分別獲得miR-144-3p、miR-144-5p、 miR-451a、miR-4732-3p、miR-4732-5p過(guò)表達(dá)細(xì)胞模型,研究分析基因簇中各miRNA對(duì)細(xì)胞凋亡、周期、遷移、侵襲、和凋亡能力的影響。(1)使用流式細(xì)胞術(shù)(Annexin V-FITC標(biāo)記)檢測(cè)miRNA mimic轉(zhuǎn)染48h后細(xì)胞的凋亡率,miR-144-3p過(guò)表達(dá)細(xì)胞早期凋亡率為(18.70±2.11)%,較對(duì)照組(9.00±1.15)%明顯升高(P0.05)。miR-144-5p、miR-451a、miR-4732-3p、miR-4732-5p過(guò)表達(dá)細(xì)胞凋亡率分別為(8.43+3.26)%、(10.00±0.90)%、(9.73±0.64)%、(9.40±0.61)%,與對(duì)照組相比凋亡率差異均沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。(2)使用流式細(xì)胞技術(shù)(PI染色)檢測(cè)miRNA mimic轉(zhuǎn)染48h后細(xì)胞的周期分布。miR-451a過(guò)表達(dá)細(xì)胞中G2期所占比例為(22.84+0.97)%,與對(duì)照組(18.20±1.12)%相比增加了25%。miR-144-3p過(guò)表達(dá)細(xì)胞中(32期所占比例(14.62±1.41)%與對(duì)照組(18.20±1.12)%相比下降了20%。(3)使用Transwell小室檢測(cè)細(xì)胞的遷移能力,miR-144-3p、miR-451a、miR-4732-3p可以抑制EC9706細(xì)胞的遷移能力,其對(duì)應(yīng)轉(zhuǎn)染組穿膜細(xì)胞數(shù)分別為15.63±1.00、21.27±1.70、26.97±3.47,較對(duì)照組(36.67±3.58)穿膜細(xì)胞數(shù)均有明顯降低。miR-144-3p、 miR-451a、miR-4732-3p穿膜細(xì)胞中結(jié)晶紫OD值低于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。(4)使用Transwell小室檢測(cè)細(xì)胞侵襲能力,miR-144-3p過(guò)表達(dá)細(xì)胞穿膜數(shù)為12.07±1.10,明顯低于對(duì)照組穿膜細(xì)胞數(shù)(25.90±2.26)。miR-144-5p、miR-451a、 miR-4732-3p、miR-4732-5p過(guò)表達(dá)對(duì)細(xì)胞的侵襲能力無(wú)影響。(5)使用EdU染色成像法檢測(cè)細(xì)胞增殖能力,miR-144-3p、miR-144-5p、miR-451a、 miR-4732-3p過(guò)表達(dá)細(xì)胞增殖率分別分別為(34.18±.83)%、(33.56±3.94)%、(34.15±2.94)%、(31.50±2.01)%,與對(duì)照組(41.16±2.13)%相比,四組細(xì)胞增殖率均降低。2構(gòu)建pri-miR-144-451過(guò)表達(dá)載體,使用慢病毒包裝并轉(zhuǎn)染,經(jīng)抗生素篩選獲得穩(wěn)定表達(dá)pri-miR-144-451細(xì)胞。分別檢測(cè)穩(wěn)定表達(dá)pri-miR-144-451 EC9706細(xì)胞的凋亡、周期、遷移、侵襲、增殖能力,以評(píng)價(jià)miR-144-451基因簇整體對(duì)食管癌細(xì)胞影響。結(jié)果顯示miR-144-451基因簇可以導(dǎo)致EC9706細(xì)胞周期阻滯于S和G2期,發(fā)揮抑癌基因作用;miR-144-51基因簇可以明顯抑制EC9706細(xì)胞的侵襲能力,與對(duì)照細(xì)胞相比pri-miR-144-451過(guò)表達(dá)并沒(méi)有引起細(xì)胞凋亡、侵襲、增殖能力的改變。三、miR-144-451基因簇在EC9706中調(diào)控通路分析1使用Targetscan、miRanda、miRDB、PICTAR預(yù)測(cè)miR-144-3p、miR-144-5p、 miR-451a的靶基因,對(duì)預(yù)測(cè)的靶基因使用DAVID Bioinformatics Resources 6.7進(jìn)行生物學(xué)功能富集分析,結(jié)果顯示miR-144-3p的靶基因最多富集在轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能,其次為細(xì)胞形態(tài)功能omiR-144-5p的靶基因最多富集在轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能,其次為轉(zhuǎn)錄功能。miR-451a的靶基因最多富集于增殖調(diào)控功能。2使用Western Blot分別檢測(cè)miRNA mimic(miR-144-3p、miR-144-5p、miR-451a、 miR-4732-3p、miR-4732-5p、miR-control)轉(zhuǎn)染細(xì)胞、pri-miR-144-451穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞(pri-miRNA、pri-control)中相應(yīng)蛋白的表達(dá)。蛋白的相對(duì)表達(dá)量A=目的蛋白IOD/內(nèi)參IOD。(1) miRNA mimic轉(zhuǎn)染組和pri-miRNA組β-Catenin總蛋白、非磷酸化β-Catenin蛋白表達(dá)無(wú)改變,miR-144-3p、miR-144-5p、miR-451a、miR-4732-3p、miR-4732-5p處理組細(xì)胞中磷酸化β-Cateriin的表達(dá)與miR-control對(duì)照組相比略有增加。與對(duì)照組相比,pri-miRNA組磷酸化β-Catenin表達(dá)增加。(2)與對(duì)照相比miR-144-3p處理組c-Myc總蛋白表達(dá)降低,miR-144-5p處理組c-Myc總蛋白表達(dá)升高;與pri-control組相比pri-miRNA組細(xì)胞中c-Myc總蛋白表達(dá)升高。miR-144-3p組細(xì)胞磷酸化c-Myc蛋白表達(dá)降低,pri-miRNA組磷酸化c-Myc表達(dá)升高。(3)不同處理組間PTEN和ERK1/2表達(dá)無(wú)差異。miR-144-3p、miR-451a、 miR-4732-3p組磷酸化ERKl/2表達(dá)較miR-control組降低;pri-miRNA組磷酸化ERK1/2表達(dá)低于pri-control組。(4) miR-4732-5p處理組p53表達(dá)明顯升高; pri-miRNA組p53蛋白表達(dá)較pri-control組升高。miR-144-3p過(guò)表達(dá)組非活化Caspase3表達(dá)較miR-control組表達(dá)降低。(5)與miR-control組相比, miR-144-3p、miR-4732-5p轉(zhuǎn)染組細(xì)胞MMP9表達(dá)降低;pri-miR-144-451穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞中MMP9呈低表達(dá)。(6) miR-144-3p、miR-144-5p過(guò)表達(dá)細(xì)胞磷酸化cdc2表達(dá)較miR-control組表達(dá)降低。pri-miRNA組磷酸化Cdc2表達(dá)則明顯增加。四、主要結(jié)論:(1)miR-144-451基因簇成員miRNA在食管癌和癌旁組織中表達(dá)高度相關(guān),miR-144-451基因簇中miR-144-3p、miR-144-5p低表達(dá)可增加食管癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),是食管癌的危險(xiǎn)因素。(2)miR-144-451基因簇可以抑制食管癌細(xì)胞的侵襲能力,使食管癌細(xì)胞G2、S期細(xì)胞增加,G1期細(xì)胞減少。其中miR-144-3p可以促進(jìn)食管癌細(xì)胞早期凋亡;miR-451a可以使細(xì)胞周期阻滯于G2期;miR-144-3p、miR-451a、miR-4732-3p抑制細(xì)胞遷移;miR-144-3p可以抑制食管癌細(xì)胞侵襲能力;miR-144-3p、miR-144-5p、miR-451a、 miR-4732-3p可以抑制細(xì)胞增殖能力。(3)miR-144-451基因簇可以抑制Wnt通路、MAPK/ERK/c-Myc信號(hào)通路。miR-144-451基因簇過(guò)表達(dá)導(dǎo)致MMP9被抑制,周期相關(guān)蛋白的p-cdc2表達(dá)升高,食管癌細(xì)胞周期、侵襲抑制可能與此有關(guān)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:東南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:R735.1
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前7條
1 張群;羅艷;張士璀;;MiR-183基因簇對(duì)動(dòng)物感覺(jué)器官功能和發(fā)育及腫瘤發(fā)生的調(diào)控[J];中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào);2012年07期
2 胡志浩,陶美鳳,,鮑鍇,周秀芬,周啟,鄧子新;一個(gè)巨大的抗真菌抗生素基因簇及其與植物生物技術(shù)的潛在關(guān)系[J];高技術(shù)通訊;1996年06期
3 李福才,婁毅,孫開(kāi)來(lái);檢測(cè)人二倍體淋巴細(xì)胞rDNA基因簇變化及活性AgNOR[J];中國(guó)醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);1998年06期
4 于宇;張淑蘭;;miR-17-92基因簇研究進(jìn)展[J];國(guó)際婦產(chǎn)科學(xué)雜志;2014年02期
5 焦豫良;王梁華;董曉毅;宗英;高云;任娜;郭愛(ài)蕓;張興群;焦炳華;;新型聚酮合酶基因簇的分離與部分鑒定[J];中國(guó)抗生素雜志;2008年03期
6 林小娟;陶澤新;劉桂芳;王敏;宋立志;王素婷;紀(jì)峰;王海巖;徐愛(ài)強(qiáng);;山東省腦膜炎和腦炎病例中�?刹《�6型的基因特征分析[J];病毒學(xué)報(bào);2014年02期
7 ;[J];;年期
相關(guān)會(huì)議論文 前6條
1 柯細(xì)松;陸璐;劉德培;梁植權(quán);;人HOX基因簇上的Alu元件的分析[A];中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)七屆一次青年研討會(huì)暨上海高校模式生物E——研究院第一屆模式生物學(xué)術(shù)研討會(huì)論文匯編[C];2005年
2 張成;夏立秋;張有明;黃科學(xué);;粉蝶霉素功能基因簇研究與導(dǎo)向化合物的產(chǎn)生[A];2008年中國(guó)微生物學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2008年
3 鐘星宇;田宇清;譚華榮;;圈卷產(chǎn)色鏈霉菌隱性基因簇的調(diào)控與激活的研究[A];2012年第五屆全國(guó)微生物遺傳學(xué)學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要集[C];2012年
4 邵志會(huì);高瑾;趙國(guó)屏;焦瑞身;;Amycolatopsis mediterranei U-32硝酸鹽同化基因簇的鑒定及部分功能研究[A];第二屆中國(guó)青年學(xué)者微生物遺傳學(xué)學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2006年
5 江舸;徐豐;金由辛;王德寶;;水稻U14snoRNA基因簇的鑒定[A];中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì)第八屆會(huì)員代表大會(huì)暨全國(guó)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2001年
6 張翠英;吳志紅;劉紅;蔡軻;李越中;;橙色粘球菌發(fā)育和社會(huì)性運(yùn)動(dòng)相關(guān)新基因簇的克隆與分析[A];第二屆中國(guó)青年學(xué)者微生物遺傳學(xué)學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2006年
相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條
1 陳麗平;miRNA-17-92基因簇在非糖尿病性巨大兒發(fā)生中的作用及其機(jī)制研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2016年
2 滕蔓;Mid基因簇miRNAs在馬立克病病毒致病中的潛在功能研究[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2017年
3 沈文靜;Pseudomonas putida DLL-E4對(duì)硝基苯酚代謝基因簇的克隆、功能分析和表達(dá)調(diào)控的研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年
4 王廣林;基于保守性AHBA基因簇的安莎類(lèi)抗生素篩選[D];南京林業(yè)大學(xué);2010年
5 蓋忠輝;一株鞘氨醇桿菌代謝咔唑的分子機(jī)制研究[D];上海交通大學(xué);2011年
6 龍菊英;水稻黃單胞Xanthomonas oryzae pv. oryzicola RS105 LPS合成基因簇的功能分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年
7 丁銳;類(lèi)芽孢桿菌B69中脂肽類(lèi)化合物Pelgipeptins的分離鑒定及相關(guān)基因簇分析[D];浙江大學(xué);2011年
8 蘇中靜;選擇性轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)和反義RNA調(diào)控人DHRS4基因簇的轉(zhuǎn)錄[D];汕頭大學(xué);2011年
9 王恒安;吸水鏈霉菌10-22的cvh基因簇和hmr19基因的生物學(xué)特征[D];上海交通大學(xué);2006年
10 劉偉;固氮斯氏假單胞菌A1501電子傳遞復(fù)合體基因簇(rnf)的功能研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2008年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前9條
1 錢(qián)正一;鏈霉菌LC6和LZ35中兩個(gè)隱性次級(jí)代謝基因簇的激活及生物合成研究[D];山東大學(xué);2015年
2 張娟;產(chǎn)酶溶桿菌Lsp蛋白質(zhì)與NRPS/PKS基因簇的功能研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
3 胡翠;粘球菌中mts基因簇調(diào)控胞外多糖產(chǎn)生及細(xì)胞表面粘附力的分子機(jī)制的研究[D];山東大學(xué);2016年
4 高志奎;MiR-144-451基因簇與食管癌發(fā)病關(guān)系研究[D];東南大學(xué);2016年
5 王玨;假單胞菌DLL-E4中pnp基因簇LysR家族調(diào)控因子分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
6 許鑫;維吉尼亞鏈霉菌IBL14中sviscsn基因簇功能分析[D];安徽大學(xué);2017年
7 龔熹;真菌新snoRNA基因簇Ⅱ的鑒定與表達(dá)分析[D];南昌大學(xué);2006年
8 張群;文昌魚(yú)miR-183和miR-216基因簇的表達(dá)模式和保守性研究[D];中國(guó)海洋大學(xué);2012年
9 滕毅;類(lèi)芽孢桿菌B69羊毛硫抗生素elgicins的分離鑒定及相關(guān)基因簇的分析[D];浙江大學(xué);2012年
本文編號(hào):1482404
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/zlx/1482404.html