microRNA在彌漫性大B細胞淋巴瘤中的表達及其意義
本文關(guān)鍵詞: 彌漫性大B細胞淋巴瘤 micro RNA miR-17-5p miR-20a-5p 靶基因 出處:《大理大學(xué)》2016年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:【研究背景】淋巴瘤是起源于淋巴造血系統(tǒng)的惡性腫瘤,是免疫系統(tǒng)的實體腫瘤[1]。淋巴瘤可分為霍奇金淋巴瘤(Hodgkin’s lymphoma,HL)和非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin’s lymphoma,NHL),其中,約90%的淋巴瘤都是NHL[1,2]。根據(jù)淋巴細胞起源的不同,NHL可以分為B細胞、T細胞和NK細胞淋巴瘤。大多數(shù)NHL為B細胞淋巴瘤,約占總數(shù)70%~85%。彌漫性大B細胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)是其中最常見、異質(zhì)性較大的侵襲性B細胞淋巴瘤,臨床表現(xiàn)及病理類型復(fù)雜。通過基因芯片和免疫組化檢測,可將DLBCL分為3種分子亞型:生發(fā)中心型(GCB)、活化B細胞樣(ABC)以及第三型(暫時不能確定)[7,8],后兩者又可稱為非生發(fā)中心型(non-GCB)。目前雖然經(jīng)過標準化R-CHOP治療,有50%患者能夠獲得治愈,但是仍有40%的患者死于復(fù)發(fā)[3]。微小RNA(micro RNA,mi RNA)是一類長度約為20-24個核苷酸的內(nèi)源性非編碼單鏈小分子RNA。mi RNA通?勺饔糜谝粋或多個信使RNA(m RNA),在轉(zhuǎn)錄后水平通過降解m RNA或在翻譯水平抑制蛋白質(zhì)合成,而達到調(diào)控基因表達的目的。mi RNA的主要功能是調(diào)節(jié)生物體生長、發(fā)育和疾病發(fā)生過程中有關(guān)基因的表達,參與人類細胞增殖、分化、凋亡等多種生物學(xué)過程的調(diào)控,近年來研究發(fā)現(xiàn),mi RNA的異常表達與包括腫瘤在內(nèi)的多種疾病有關(guān),發(fā)揮著類似于癌基因或抑癌基因的功能[7-9],是腫瘤發(fā)生發(fā)展的重要影響因素,mi RNA已成為現(xiàn)階段腫瘤臨床基礎(chǔ)研究的熱點!灸康摹坎捎胢iRNA芯片等方法檢測并分析彌漫性大B細胞淋巴瘤中miRNA表達譜,篩選出差異表達的mi RNA,并進行Real-time PCR驗證,預(yù)測可能與DLBCL發(fā)生發(fā)展有關(guān)的靶基因,結(jié)合臨床病理資料分析其意義,研究mi RNA在DLBCL調(diào)控中的作用,使之成為腫瘤診斷、治療及預(yù)后判斷的潛在靶標提供實驗依據(jù)!静牧虾头椒ā课覀兪占颇鲜《嗉裔t(yī)院2010年12月-2013年2月術(shù)后確診為DLBCL的石蠟包埋組織標本10例作為腫瘤組,反應(yīng)性增生淋巴結(jié)(RH)組織標本8例作為良性病變組,根據(jù)是否感染HIV,將DLBCL分為HIV-DLBCL組織標本6例和non-HIV-DLBCL組織標本4例,RH分為HIV-RH的組織標本4例和non-HIV-RH組織標本4例,通過mi RNA芯片雜交技術(shù)對上述各組(HIV-DLBCL vs non-HIV-DLBCL,HIV-RH vs non-HIV-RH,腫瘤組vs良性病變組)進行差異性mi RNA分析,由于mi RNA芯片分析的樣本量較少,可能存在個體差異影響,為了篩選出表達差異更為可靠的mi RNA,對三組結(jié)果取交集,得到在三組比較中同時具有差異性表達的mi RNA。利用實時熒光定量PCR(Real-time PCR)對現(xiàn)國內(nèi)外已有文獻報道的差異表達的mi RNA進行驗證,結(jié)合臨床資料分析部分mi RNA與臨床病理因素的相關(guān)性。應(yīng)用生物信息學(xué)軟件(Targetscan,Miranda和Mirbase)進行靶基因預(yù)測,取至少2個軟件預(yù)測得到的基因作為靶基因,并結(jié)合Gene Ontology(GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)數(shù)據(jù)庫和相關(guān)文獻報道分析靶基因的功能!窘Y(jié)果】1、腫瘤組與良性病變組比較:共篩選出119個表達差異具有統(tǒng)計學(xué)意義的mi RNA:53個mi RNA表達上調(diào),66個mi RNA表達下調(diào)。2、HIV-DLBCL組與HIV-RH組比較:共篩選出106個表達差異具有統(tǒng)計學(xué)意義的mi RNA:58個mi RNA表達上調(diào),48個mi RNA表達下調(diào)。3、non-HIV-DLBCL組與non-HIV-RH組比較:共篩選出58個表達差異具有統(tǒng)計學(xué)意義的mi RNA:18個mi RNA表達上調(diào),40個mi RNA表達下調(diào)。4、對上述三組結(jié)果取交集,得到10個交集mi RNA:其中5個mi RNA表達上調(diào)(mi R-3648,mi R-17-5p,mi R-20a-5p,mi R-106a-5p,mi R-3116),5個mi RNA表達下調(diào)(mi R-3691-5p,mi R-4489,mi R-4423-3p,mi R-10b-5p,let-7c-5p)。5、Real-time PCR結(jié)果顯示,DLBCL組中的mi R-17-5p、mi R-106a-5p和mi R-20a-5p顯著上調(diào);而mi R-10b-5p與let-7c-5p明顯下調(diào),與mi RNA芯片結(jié)果一致。6、mi R-17-5p和mi R-20a-5p具有顯著相關(guān)性(P0.001)。7、mi R-17-5p和mi R-20a-5p的表達水平與DLBCL的免疫表型、臨床分期有關(guān)。GCB型DLBCL組織中mi R-20a-5p的表達量高于non-GCB型DLBCL(P=0.015)。Ⅲ、Ⅳ進展期,mi R-17-5p和mi R-20a-5p的相對表達量增高(P=0.041,P=0.043)。8、利用Targetscan,Miranda和Mirbase基因庫及GO、Pathway軟件分析,篩選出受mi R-17-5p和mi R-20a-5p的共同調(diào)控、與DLBCL發(fā)生發(fā)展相關(guān)的三條靶基因CHD5、TRIM3、PTEN!窘Y(jié)論】1、mi R-17-5p、mi R-106a-5p和mi R-20a-5p在DLBCL中表達上調(diào),mi R-10b-5p與let-7c-5p在DLBCL中表達下調(diào),與DLBCL的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。2、mi R-17-5p和mi R-20a-5p的表達具有較高的相關(guān)性,且與臨床分期呈正相關(guān),提示二者在DLBCL中發(fā)揮著類似癌基因的功能;GCB型DLBCL中mi R-20a-5p的表達顯著高于non-GCB型DLBCL,提示mi R-20a-5p可能與DLBCL生發(fā)中心形成有關(guān)。3、研究結(jié)果提示高表達的mi R-17-5p和mi R-20a-5p在DLBCL中發(fā)揮協(xié)同調(diào)控作用,可能通過抑制共同的靶基因CHD5、TRIM3、PTEN,促進DLBCL的進展過程,mi R-17-5p和mi R-20a-5p有可能作為DLBCL臨床分期的分子標志物。4、本研究篩選出的DLBCL中差異表達的mi RNA及靶基因值得進一步深入研究,有望成為DLBCL的治療新靶點。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:大理大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R733.1
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