目的:基于網(wǎng)絡藥理學的方法研究金花葵抗心肌缺血的作用機制。方法:通過查找文獻挖掘金花葵中有效成分,利用數(shù)據(jù)庫(PubChem、Swiss Target Prediction)搜集整理化合物并根據(jù)口服生物利用度(OB)、類藥性(DL)值進行篩選,用Gene Cards、Drug Bank篩選心肌缺血的靶點,利用Venn diagram做出"化合物-靶點-疾病"間的韋恩圖,進一步利用Cytoscape 3.2.1構建"活性成分-靶點"之間的網(wǎng)絡關系圖。構建蛋白質與蛋白質相互作用(PPI)網(wǎng)絡,進行基因本體論(GO)功能、京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路的富集分析,進行分子對接驗證。結果:金花葵中化合物共72個,有效成分18個,共預測出83個金花葵抗心肌缺血的共同作用靶點,GO功能富集分析顯示金花葵有效成分潛在作用靶點多分布于膜筏和膜微區(qū)中,KEGG富集通路共66條,其中神經(jīng)信號傳遞通路、糖尿病并發(fā)癥中晚期糖基化終末產(chǎn)物-晚期糖基化終末產(chǎn)物受體(AGE-RAGE)信號通路、Rap1信號通路、鈣信號通路、腫瘤壞死因子(TNF)信號通路等通路對抗心肌缺血有明顯作用,分子對接中表明發(fā)揮抗心...

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【部分圖文】：

圖1 化合物有效成分靶點與疾病靶點交集

檢索現(xiàn)有有關金花葵成分的文獻[15～20]得到金花葵化合物共72個(表1)，在此基礎上根據(jù)OB(≥10%)、DL(≥0.1)值篩選出有良好生物活性的金花葵有效成分18個(表2)，包括柏木腦、槲皮素、楊梅素、葛根素等。經(jīng)TCMSP數(shù)據(jù)庫及PubChem數(shù)據(jù)庫共同檢索到與上述成分有關....

圖2 金花葵化合物與共同靶點網(wǎng)絡圖

由圖3可知，構建的蛋白相互作用的PPI網(wǎng)絡中包含81個節(jié)點及249條邊。該網(wǎng)絡平均度值為6.15，平均局部聚類系數(shù)為0.521，根據(jù)網(wǎng)絡拓撲學參數(shù)，共篩選出20個核心關鍵靶蛋白，其中白細胞介素6(IL-6)、血管內皮生長因子A(VEGFA)、半胱氨酸天冬氨酸特異性蛋白酶(CASP....

圖3 STRING靶蛋白互作PPI網(wǎng)絡

圖2金花葵化合物與共同靶點網(wǎng)絡圖圖4PPI網(wǎng)絡核心靶點

圖4 PPI網(wǎng)絡核心靶點

圖3STRING靶蛋白互作PPI網(wǎng)絡2.4GO和KEGG通路富集結果與分析

本文編號：4036129