基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的半夏抗炎活性成分及作用機制研究
發(fā)布時間:2023-11-24 20:15
目的構(gòu)建半夏抗炎的"成分-靶點-通路"網(wǎng)絡(luò),探究半夏可能活性成分及其潛在作用機制。方法通過文獻(xiàn)和TCMSP數(shù)據(jù)庫查找半夏化學(xué)成分,采用類藥性(DrugLikeness,DL)以及口服生物利用度(Oral Bioactivity,OB)評估篩選活性成分;通過Drugbank、Pharmmappe數(shù)據(jù)庫篩選半夏活性成分潛在靶點基因,通過GeneCards和MalaCards數(shù)據(jù)庫得到炎癥相關(guān)基因靶點;將活性成分的潛在靶點基因與炎癥相關(guān)基因進(jìn)行比對,得到半夏抗炎的潛在靶點基因;使用DAVID數(shù)據(jù)庫對靶點基因功能進(jìn)行GO富集,KOBAS 3.0數(shù)據(jù)庫對相關(guān)通路進(jìn)行KEGG通路注釋;采用Cytoscape 3.6.1軟件構(gòu)建半夏抗炎作用的"成分-靶點-通路"網(wǎng)絡(luò);將篩選得到的部分活性成分和關(guān)鍵靶點進(jìn)行分子對接。結(jié)果從半夏中共篩選出11個活性成分,涉及包括MAPK14、TEK、IGF1、AKT1等53個基因靶點,影響了與炎癥相關(guān)的TNF signaling pathway、PI3K-Akt signaling pathway及Ras signaling pathway等32條信號通路;分子對接試驗...
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 成分庫的構(gòu)建
1.2 活性成分的篩選
1.3 化合物靶點篩選
1.4 疾病靶點篩選
1.5 靶點通路注釋分析
1.6 構(gòu)建“成分-靶點-通路”網(wǎng)絡(luò)
1.7 分子對接驗證
2 結(jié)果
2.1 活性成分篩選
2.2 潛在靶點篩選
2.3 靶點功能與通路分析
2.4 活性成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.5 活性成分-靶點蛋白對接
3 討論
本文編號:3866521
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 成分庫的構(gòu)建
1.2 活性成分的篩選
1.3 化合物靶點篩選
1.4 疾病靶點篩選
1.5 靶點通路注釋分析
1.6 構(gòu)建“成分-靶點-通路”網(wǎng)絡(luò)
1.7 分子對接驗證
2 結(jié)果
2.1 活性成分篩選
2.2 潛在靶點篩選
2.3 靶點功能與通路分析
2.4 活性成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.5 活性成分-靶點蛋白對接
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