目的構(gòu)建半夏抗炎的"成分-靶點(diǎn)-通路"網(wǎng)絡(luò),探究半夏可能活性成分及其潛在作用機(jī)制。方法通過(guò)文獻(xiàn)和TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)查找半夏化學(xué)成分,采用類藥性(DrugLikeness,DL)以及口服生物利用度(Oral Bioactivity,OB)評(píng)估篩選活性成分;通過(guò)Drugbank、Pharmmappe數(shù)據(jù)庫(kù)篩選半夏活性成分潛在靶點(diǎn)基因,通過(guò)GeneCards和MalaCards數(shù)據(jù)庫(kù)得到炎癥相關(guān)基因靶點(diǎn);將活性成分的潛在靶點(diǎn)基因與炎癥相關(guān)基因進(jìn)行比對(duì),得到半夏抗炎的潛在靶點(diǎn)基因;使用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)靶點(diǎn)基因功能進(jìn)行GO富集,KOBAS 3.0數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)相關(guān)通路進(jìn)行KEGG通路注釋;采用Cytoscape 3.6.1軟件構(gòu)建半夏抗炎作用的"成分-靶點(diǎn)-通路"網(wǎng)絡(luò);將篩選得到的部分活性成分和關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接。結(jié)果從半夏中共篩選出11個(gè)活性成分,涉及包括MAPK14、TEK、IGF1、AKT1等53個(gè)基因靶點(diǎn),影響了與炎癥相關(guān)的TNF signaling pathway、PI3K-Akt signaling pathway及Ras signaling pathway等32條信號(hào)通路;分子對(duì)接試驗(yàn)...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 成分庫(kù)的構(gòu)建
    1.2 活性成分的篩選
    1.3 化合物靶點(diǎn)篩選
    1.4 疾病靶點(diǎn)篩選
    1.5 靶點(diǎn)通路注釋分析
    1.6 構(gòu)建“成分-靶點(diǎn)-通路”網(wǎng)絡(luò)
    1.7 分子對(duì)接驗(yàn)證
2 結(jié)果
    2.1 活性成分篩選
    2.2 潛在靶點(diǎn)篩選
    2.3 靶點(diǎn)功能與通路分析
    2.4 活性成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
    2.5 活性成分-靶點(diǎn)蛋白對(duì)接
3 討論



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