以分子對(duì)接法探索中草藥七葉一枝花治療新型冠狀病毒SARS-CoV-2的活性化合物。SARS-CoV-2主要通過(guò)其S蛋白與人體細(xì)胞表面的Angiotensin-converting enzyme 2(ACE2)受體結(jié)合。本研究通過(guò)分子對(duì)接模擬預(yù)測(cè)了七葉一枝花中富含的3種重樓皂苷(Ⅰ、Ⅵ、Ⅶ)與ACE2的結(jié)合親和力。結(jié)果表明:三種重樓皂苷均能夠與ACE2結(jié)合,結(jié)合自由能均低于-8 kcal/mol。三種化合物共同結(jié)合的氨基酸殘基包括:Pro-346、Thr-347、Ala-348、Asp-350、Asn-394、His-401、Glu-402。三種藥物結(jié)合以上位點(diǎn)的結(jié)構(gòu)主要是共同的母核結(jié)構(gòu)起著關(guān)鍵作用。另外,重樓皂苷Ⅰ與ACE2結(jié)合所需能量最低,而重樓皂苷Ⅵ與靶蛋白作用的關(guān)鍵氨基酸數(shù)量最多及形成的氫鍵數(shù)量最多。因此,基于這三種有效成分進(jìn)行結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)有望獲得高效的SARS-CoV-2抑制劑,以期為COVID-19治療藥物發(fā)現(xiàn)提供研究基礎(chǔ)。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
2 結(jié)果
    2.1 重樓皂苷I與SARS-CoV-2受體ACE2存在結(jié)合作用
    2.2 重樓皂苷VI與SARS-CoV-2受體ACE2存在結(jié)合作用
    2.3 重樓皂苷VII與SARS-CoV-2受體ACE2存在結(jié)合作用
3 討論



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