基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接探討密蒙花顆粒劑治療干眼的作用機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2023-04-05 17:48
目的運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法和分子對(duì)接技術(shù)探究密蒙花顆粒劑治療干眼可能的作用機(jī)制。方法通過(guò)運(yùn)用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(TCMSP)篩選出密蒙花顆粒劑口服生物利用度≥30%和類(lèi)藥性≥0.18的化合物作為候選藥效成分,根據(jù)TCMSP的"Related Targets"對(duì)密蒙花顆粒劑的活性成分的作用靶點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè),采用Cytoscape 3.6.0軟件構(gòu)建化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)。通過(guò)OMIM、DisGeNET數(shù)據(jù)庫(kù)查找干眼相關(guān)基因,通過(guò)STRING數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用分析。通過(guò)Venny圖將密蒙花顆粒劑活性成分靶點(diǎn)與干眼疾病靶點(diǎn)取交集,得到密蒙花顆粒劑有效活性成分治療干眼的關(guān)鍵靶點(diǎn),構(gòu)建藥物-活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)。使用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行GO功能注釋和KEGG通路富集。運(yùn)用AutoDock vina 1.1.2軟件對(duì)選取的密蒙花顆粒劑主要活性成分與關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接。結(jié)果得到密蒙花顆粒劑對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)的活性成分46個(gè),預(yù)測(cè)作用靶點(diǎn)248個(gè),干眼相關(guān)基因237個(gè),密蒙花顆粒劑治療干眼的關(guān)鍵靶點(diǎn)18個(gè),靶點(diǎn)參與的功能主要有細(xì)胞增殖調(diào)控、基因表達(dá)的調(diào)控、細(xì)胞凋亡、蛋白磷酸化、免疫反應(yīng)、...
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 藥物活性成分及靶蛋白的篩選
1.2 干眼相關(guān)基因查詢
1.3 獲取密蒙花顆粒劑治療干眼的關(guān)鍵靶點(diǎn)
1.4 構(gòu)建藥物-活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)
1.5 GO功能富集分析
1.6 KEGG通路富集分析
1.7 密蒙花顆粒劑主要活性成分與干眼主要靶點(diǎn)分子對(duì)接
2 結(jié)果
2.1 密蒙花顆粒劑活性成分及相應(yīng)的靶蛋白
2.2 干眼基因蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.3 密蒙花顆粒劑治療干眼的關(guān)鍵靶點(diǎn)
2.4 藥物-活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.5 GO功能富集分析
2.6 KEGG通路富集分析
2.7 密蒙花顆粒劑主要活性成分與干眼主要靶點(diǎn)分子對(duì)接
3 討論
本文編號(hào):3783849
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1 資料與方法
1.1 藥物活性成分及靶蛋白的篩選
1.2 干眼相關(guān)基因查詢
1.3 獲取密蒙花顆粒劑治療干眼的關(guān)鍵靶點(diǎn)
1.4 構(gòu)建藥物-活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)
1.5 GO功能富集分析
1.6 KEGG通路富集分析
1.7 密蒙花顆粒劑主要活性成分與干眼主要靶點(diǎn)分子對(duì)接
2 結(jié)果
2.1 密蒙花顆粒劑活性成分及相應(yīng)的靶蛋白
2.2 干眼基因蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.3 密蒙花顆粒劑治療干眼的關(guān)鍵靶點(diǎn)
2.4 藥物-活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.5 GO功能富集分析
2.6 KEGG通路富集分析
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