本試驗旨在探究黃芪多糖（APS）對小鼠間充質干細胞C3H10T1/2細胞棕色脂肪化過程中長鏈非編碼RNA（lncRNA）表達譜的影響。試驗以C3H10T1/2細胞為研究對象,在成脂誘導分化培養(yǎng)液中添加0.4 g/L的APS,以誘導分化1.5 d的細胞構建文庫后測序,篩選差異m RNAs和差異lncRNAs,并對差異m RNAs和差異lncRNAs的順式及共表達作用預測的靶基因進行了功能分析。通過熒光定量PCR隨機分析了3個lncRNAs和3個m RNAs的表達水平,驗證了測序結果的準確性。研究結果表明,本次測序共得到13 450個lncRNAs和57 776個m RNAs。通過對其表達量、長度、外顯子個數(shù)和成對重復性檢驗分析證明了測序數(shù)據(jù)的可靠性較好。篩選共得到153個差異表達的lncRNAs和1 238個差異表達的m RNAs。結果表明,差異m RNAs主要基因本體（GO）注釋富集在53個功能分類中,京都基因與基因組百科全書（KEGG）分析富集在343條通路中。差異lncRNAs順式及共表達作用預測的靶基因GO注釋分別富集在34和33個功能分類中,在分子功能中條目一致。KEGG分析顯... 

【文章來源】：激光生物學報. 2020,29(04)

【文章頁數(shù)】：12 頁

【部分圖文】：

新lncRNAs轉錄本和數(shù)據(jù)質量分析

為了驗證測序數(shù)據(jù)的準確性，本研究使用q RT-PCR對隨機選擇的3個lncRNAs和3個m RNAs進行定量驗證。測序結果中FC值>1或<1分別代表基因的上調或下調和表達量的升高或降低。結果表明q RT-PCR表達趨勢與測序結果一致，lncRNAs(ENSMUST00000152125、ENSMUST00000191042、TCONS＿00033926）及m RNAs(ENSMUST000000109-74、ENSMUST00000031327）在熒光定量PCR與測序結果中都上調，而m RNA(ENSMUST00000165806）下調（圖7）。這證明了本次測序結果的可靠性。圖6 DElncRNAs與DEGs的共表達網(wǎng)絡互作圖

DElncRNAs與DEGs的共表達網(wǎng)絡互作圖

【參考文獻】：
期刊論文
[1]12種植物粗多糖的體外抗肥胖及抗氧化活性研究[J]. 李鑫鑫,王一棠,陳琛,劉祥,鄭紅星,張小鶯.  食品科技. 2018(02)
[2]黃芪多糖對3T3-L1前脂肪細胞增殖和分化的影響[J]. 劉毅,王文健,陳偉華,應健.  中西醫(yī)結合學報. 2007(04)



本文編號：3578746