血管新生是一個(gè)涉及多個(gè)步驟的動(dòng)態(tài)過(guò)程,現(xiàn)已知大約有70種疾病與血管新生紊亂相關(guān)。作者前期文獻(xiàn)調(diào)研中發(fā)現(xiàn)苦參黃酮類成分有抑制血管新生的作用,但其藥效物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)制尚未明確。分子對(duì)接技術(shù)可用于尋找和挖掘新的先導(dǎo)化合物。本研究應(yīng)用分子對(duì)接技術(shù),對(duì)苦參黃酮抑制血管新生的活性成分進(jìn)行虛擬篩選,并結(jié)合中藥化學(xué)成分分離對(duì)其結(jié)果進(jìn)行了驗(yàn)證。搜集現(xiàn)已分離鑒定的142個(gè)苦參黃酮類化合物作為配體數(shù)據(jù)庫(kù),選擇VEGF-a、KDR和FLT1等9個(gè)與血管新生密切相關(guān)的靶點(diǎn)作為受體數(shù)據(jù)庫(kù),應(yīng)用Discovery Studio 2.5（DS2.5）軟件的LibDock模塊進(jìn)行分子對(duì)接,以DrugBank中對(duì)各靶點(diǎn)有抑制作用并已上市的小分子藥物（Approved drugs）為參照,設(shè)定各靶點(diǎn)的已上市小分子藥物最低打分為閾值,虛擬篩選出打分高于閾值且排名前10%的化合物共42個(gè),并對(duì)比分析了原配體、已上市藥物和苦參黃酮作用于各靶點(diǎn)的主要活性殘基,初步發(fā)現(xiàn)并揭示了苦參黃酮抑制血管新生的物質(zhì)基礎(chǔ)及作用機(jī)制�；谔摂M篩選的結(jié)果,對(duì)苦參黃酮類成分進(jìn)行了分離、鑒定和富集,并選擇分離得到的苦參黃酮化合物Kuraridin進(jìn)行了... 

【文章來(lái)源】：廣東藥科大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】：96 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

血管新生過(guò)程

廣東藥科大學(xué)碩士研究生畢業(yè)論文困難，這也是許多初學(xué)者放棄對(duì)其深究的原因之一。套計(jì)算信息學(xué)的軟件，結(jié)合了分子模擬和計(jì)算化學(xué)的環(huán)境個(gè)功能模塊，如 FlexX 快速精準(zhǔn)的柔性對(duì)接工具、FlexS。Studio 2.5（DS2.5），Accerlrys 公司旗下著名的分子建模功能模塊集成（見(jiàn)圖 1-2 ），允許多線程同時(shí)運(yùn)行，可LibDock 是 DS2.5 中最快速的高通量對(duì)接技術(shù)模塊，其根定義作用熱區(qū)（Hotspots），然后將配體分子構(gòu)象對(duì)接到]，該模塊能快速的高通量的運(yùn)行多個(gè)對(duì)接線程，也兼顧了

物和6000多個(gè)在研階段的藥物。本文各靶點(diǎn)對(duì)應(yīng)的已上市小分子化合物（即集）均來(lái)自此數(shù)據(jù)庫(kù)。（數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址：https://www.drugbank.ca/）UD數(shù)據(jù)庫(kù)（A Directory of Useful Decoys，DUD）[81]，是一個(gè)為虛擬篩選提子（Decoys）的數(shù)據(jù)庫(kù)，可測(cè)試對(duì)接方法的可靠性，但該數(shù)據(jù)庫(kù)提供的靶點(diǎn)，只提供40個(gè)靶點(diǎn)總共2950種活性化合物的數(shù)據(jù)。本文部分靶點(diǎn)的驗(yàn)證來(lái)自。（數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址：http://dud.docking.org/index.html）究方法于抑制血管新生活性成分的虛擬篩選，實(shí)際就是通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬，尋找能與靶點(diǎn)作用的小分子化合物，本文采用的模擬手段為分子對(duì)接。子對(duì)接的基本流程為：受體結(jié)構(gòu)的搜集和準(zhǔn)備，及配體結(jié)構(gòu)的搜集和準(zhǔn)備體導(dǎo)入DS，調(diào)用LibDock對(duì)接模塊，再按照下圖2-1對(duì)接原理進(jìn)行操作，設(shè)置行分子對(duì)接。Generate conformations of ligands Define a receptor

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]動(dòng)脈粥樣硬化早期管壁微血管新生的相關(guān)機(jī)制及通絡(luò)干預(yù)研究[D]. 劉美之.河北醫(yī)科大學(xué) 2015
[2]VEGF和PDGFB受體酪氨酸激酶抑制劑對(duì)小鼠角膜新生血管抑制作用的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 張朝然.復(fù)旦大學(xué) 2008

碩士論文
[1]幾種黃酮類化合物的抗氧化性研究[D]. 吳肖虎.廣西師范學(xué)院 2014
[2]血管新生相關(guān)因子在煙霧病發(fā)病機(jī)制中的作用[D]. 王強(qiáng).南方醫(yī)科大學(xué) 2013
[3]一種新黃酮類化合物（（2S）-8-異戊烯基-7，2’,4’-三羥基5-甲氧基二氫黃酮）的抗血管生成作用及其機(jī)制研究[D]. 張秀莉.蘭州大學(xué) 2010
[4]苦參總黃酮的提取純化及其片劑的制備[D]. 吳亞紅.天津大學(xué) 2009
[5]苦參化學(xué)成分及生物活性研究[D]. 曹美愛(ài).蘭州大學(xué) 2007



本文編號(hào)：3495503