目的運用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法探討二陳湯治療慢性阻塞性肺�。–OPD）的作用機(jī)制。方法通過中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫（TCMSP）對二陳湯所包含的中藥進(jìn)行可能的活性成分和靶點預(yù)測;并通過相關(guān)數(shù)據(jù)庫檢索COPD的相關(guān)靶點。將二陳湯與COPD的共同靶點用Cytoscape 3.7.2建立成分-疾病-靶點作用網(wǎng)絡(luò),然后使用STRING網(wǎng)站進(jìn)行化合物-疾病共同靶點蛋白互作分析、運用Cytoscape 3.7.2進(jìn)行可視化;利用DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行基因本體（GO）分析和京都基因與基因組百科全書（KEGG）通路富集分析。結(jié)果篩選出112個二陳湯的有效成分和142個預(yù)測靶點,COPD靶點共計509個;二陳湯與COPD的共同靶點45個;富集分析共得到得到生物學(xué)進(jìn)程17個,細(xì)胞學(xué)組分2個,分子功能2個,7條KEGG通路。結(jié)果顯示二陳湯作用于COPD的機(jī)制中,其主要信號通路為TNF信號通路和HIF-1信號通路。主要涉及了氧化應(yīng)激、脂多糖介導(dǎo)的信號通路、一氧化氮合成、基因表達(dá)、血管生成、趨化因子生成、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞增殖、RNA轉(zhuǎn)錄等多個生物學(xué)進(jìn)程,多個生物學(xué)進(jìn)程涉及了IL6、TNF、EGFR、IL1B、MAPK14、... 

【文章來源】：時珍國醫(yī)國藥. 2020,31(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

二陳湯治療COPD的KEGG通路分析

利用 TCMSP數(shù)據(jù)庫進(jìn)行活性成分的靶點預(yù)測,并將所獲得的預(yù)測靶點導(dǎo)入Uniprot數(shù)據(jù)庫進(jìn)行基因標(biāo)準(zhǔn)化,刪除重復(fù)值后共得到作用靶點142個。將上述藥物、成分及靶點導(dǎo)入Cytoscape軟件進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)可視化。圖中藍(lán)色六邊形代表藥物二陳湯,橙色菱形代表二陳湯成分節(jié)點,綠色倒三角形代表成分預(yù)測靶點,節(jié)點之間的邊表示成分與靶點之間的相互作用關(guān)系。其中預(yù)測靶點按degree值進(jìn)行分析,Degree值越大,表示與其他的靶點聯(lián)系越密切。結(jié)果見圖 1。2.3 COPD靶點預(yù)測

將二陳湯的預(yù)測靶點與COPD的預(yù)測靶點共同導(dǎo)入EXCEL表格查找重復(fù)值并取交集,共得到45個共同作用靶點。將此45個共同預(yù)測靶點導(dǎo)入 STRING 數(shù)據(jù)庫,構(gòu)建蛋白質(zhì)—蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系(Protein-Protein Interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)圖,以此來尋找靶點和靶點間直接及間接作用關(guān)系。用圓圈的大小表示自由度(degree值)的大小,圓圈越大,degree值越大,參與的生物功能越多。如圖2所示,圖中包含45個節(jié)點,448條邊,其中最小自由度2,最大自由度36,平均自由度20。關(guān)鍵靶點為: IL6,TP53,VEGFA,ILB1,MAPK1,PTGS2,TNF,CCL2,EGFR,EGF等。2.5 GO功能富集分析與KEGG分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]二陳湯加味對慢性阻塞性肺疾病大鼠VEGF,VEGFR2,IL-4,ET-1的影響[J]. 謝文英,王俊月,包永生,尚立芝,李進(jìn)京,吳珂,張良芝,李亮,王肖艷,宋倩紅.  中國實驗方劑學(xué)雜志. 2019(23)
[2]IL-6R表達(dá)及IL-6基因突變與慢性阻塞性肺疾病的相關(guān)性[J]. 梁志華,高炎超.  中國老年學(xué)雜志. 2019(16)
[3]二陳湯加味對慢性阻塞性肺疾病大鼠β2AR/β-arrestin2信號通路的影響[J]. 謝文英,王俊月,包永生,尚立芝,吳珂,李亮,王肖艷,陳曉輝,李曉芳,宋倩紅.  中國實驗方劑學(xué)雜志. 2019(23)
[4]二陳湯研究進(jìn)展[J]. 包永生,謝文英,王俊月.  中國實驗方劑學(xué)雜志. 2019(23)
[5]慢性阻塞性肺疾病的發(fā)病機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李鋒,周新.  中國呼吸與危重監(jiān)護(hù)雜志. 2019(01)
[6]歐前胡素通過TGF-β1/Smad3和PI3K/Akt信號通路對哮喘小鼠氣道重塑模型的影響[J]. 咸哲民,王重陽,樸玉華,李俊峰,姜京植,趙雨喆,李良昌,樸紅梅,延光海.  中國藥理學(xué)通報. 2018(12)
[7]淫羊藿治療股骨頭壞死的分子機(jī)制分析[J]. 梁學(xué)振,許波,李剛,駱帝,蓋帥帥,閻博昭,李嘉程,夏聰敏.  中國實驗方劑學(xué)雜志. 2018(14)
[8]血清Hs-CRP、IL-6及血漿FIB聯(lián)合檢測在COPD中的應(yīng)用價值[J]. 季豐,葛明坤,葉健.  海南醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2016(22)
[9]慢性阻塞性肺疾病患者肺組織中缺氧誘導(dǎo)因子1α的表達(dá)變化[J]. 魏文婷,李冰,賈曄然,陳淼,張紅璇.  中國病理生理雜志. 2013(09)
[10]紅景天對低氧條件下內(nèi)皮細(xì)胞HIF-1α、HIF-1β和VEGF表達(dá)的影響[J]. 高秀芳,施海明,山纓,虞勇,王宣春.  中華中醫(yī)藥雜志. 2010(04)

碩士論文
[1]芪蛭益肺顆粒治療慢性阻塞性肺疾病的機(jī)制研究[D]. 凌書策.北京中醫(yī)藥大學(xué) 2019
[2]HIF-1、VEGF在慢性阻塞性肺疾病中的表達(dá)及臨床意義[D]. 汪迎.南昌大學(xué) 2019



本文編號：3245459