基于網(wǎng)絡藥理學探討斑蝥素抗小細胞肺癌的分子機制研究
發(fā)布時間:2021-01-27 06:13
目的:基于網(wǎng)絡藥理學探討斑蝥素抗小細胞肺癌的關(guān)鍵靶點。方法:斑蝥素靶點通過Swiss Target Prediction進行篩選,采用Genecards和CTD數(shù)據(jù)庫篩選小細胞肺癌靶點,通過FunRich軟件獲得共有靶點,用GeneMANIA進行基因富集分析,對關(guān)鍵靶點進行相互作用分析(STRING),采用分子對接對關(guān)鍵靶點進行驗證分析。結(jié)果:獲得24個靶點,富集分析發(fā)現(xiàn):共表達(co-expression)占35.49%、物理相關(guān)性(Physical Interactions)占34.86%、預測(Predicted)占20.20%,EGFR、PTGS2和TLR4為關(guān)鍵靶點;通過分子對接發(fā)現(xiàn):斑蝥素與PTGS2有較好的結(jié)合。結(jié)論:初步明確斑蝥素可能通過調(diào)節(jié)EGFR、PTGS2和TLR4抗小細胞肺癌,其中主要靶點為PTGS2。
【文章來源】:中醫(yī)藥信息. 2020,37(05)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
化學成分-疾病靶點
24個靶點基于GeneMANIA分析靶蛋白的相互作用,其中共定位(co-localization)占0.98%、共表達(co-expression)占35.49%、物理相關(guān)性(Physical Interactions)占34.86%、預測(Predicted)占20.20%、蛋白結(jié)構(gòu)域(Shated protein domains)占4.65%、遺傳相關(guān)性(Genetic Interactions)占1.86%,見圖2。2.3 關(guān)鍵靶點分析
基于STRING結(jié)合Cytoscape通過degree篩選,選擇degree大于12的為關(guān)鍵靶點,EGFR、PTGS2和TLR4為關(guān)鍵靶點,見圖3。2.4 iGEMDOCK分子對接結(jié)果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]全球肝癌流行概況[J]. 魏礦榮,彭俠彪,梁智恒,岑惠珊. 中國腫瘤. 2015(08)
[2]基于分子對接技術(shù)的常用降糖中藥有效成分虛擬篩選[J]. 林桂源,姚華聰,鄭細娜,李曉金,陳超樂,趙肅清,鄭杰. 中國實驗方劑學雜志. 2015(15)
[3]斑蝥素及其衍生物抗腫瘤研究近況[J]. 周杰,吳敬波. 西南軍醫(yī). 2014(03)
[4]中藥斑蝥研究進展[J]. 劉亞楠. 中藥與臨床. 2013(04)
[5]斑蝥素及其衍生物的作用機制和臨床應用[J]. 趙良中,李妍. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2010(21)
[6]中藥斑蝥的現(xiàn)代研究進展[J]. 趙麗娜,張振凌. 中國民族民間醫(yī)藥. 2010(09)
[7]斑蝥素及其衍生物抗腫瘤作用機制的研究進展[J]. 施秀青,徐瑞榮. 浙江中西醫(yī)結(jié)合雜志. 2007(12)
[8]斑蝥素抑制人宮頸癌Hela細胞增殖的研究[J]. 王曉華,馬萍,尹元琴,張衛(wèi)東,姜又紅. 中國醫(yī)科大學學報. 2007(02)
[9]斑蝥素誘導人胰腺癌細胞凋亡的實驗研究[J]. 周季蘭,姚瑋艷,章永平,喬敏敏,袁耀宗. 胰腺病學. 2006(06)
[10]斑蝥合劑對H22肝癌小鼠的抑瘤及免疫調(diào)節(jié)作用[J]. 周阿高,張勇,孔德云,王穎,張惠珍,王樹軍,蕢綱,洪聲,葛海良,任秋華,毛旭明,董佳容. 中西醫(yī)結(jié)合學報. 2006(05)
本文編號:3002580
【文章來源】:中醫(yī)藥信息. 2020,37(05)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
化學成分-疾病靶點
24個靶點基于GeneMANIA分析靶蛋白的相互作用,其中共定位(co-localization)占0.98%、共表達(co-expression)占35.49%、物理相關(guān)性(Physical Interactions)占34.86%、預測(Predicted)占20.20%、蛋白結(jié)構(gòu)域(Shated protein domains)占4.65%、遺傳相關(guān)性(Genetic Interactions)占1.86%,見圖2。2.3 關(guān)鍵靶點分析
基于STRING結(jié)合Cytoscape通過degree篩選,選擇degree大于12的為關(guān)鍵靶點,EGFR、PTGS2和TLR4為關(guān)鍵靶點,見圖3。2.4 iGEMDOCK分子對接結(jié)果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]全球肝癌流行概況[J]. 魏礦榮,彭俠彪,梁智恒,岑惠珊. 中國腫瘤. 2015(08)
[2]基于分子對接技術(shù)的常用降糖中藥有效成分虛擬篩選[J]. 林桂源,姚華聰,鄭細娜,李曉金,陳超樂,趙肅清,鄭杰. 中國實驗方劑學雜志. 2015(15)
[3]斑蝥素及其衍生物抗腫瘤研究近況[J]. 周杰,吳敬波. 西南軍醫(yī). 2014(03)
[4]中藥斑蝥研究進展[J]. 劉亞楠. 中藥與臨床. 2013(04)
[5]斑蝥素及其衍生物的作用機制和臨床應用[J]. 趙良中,李妍. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2010(21)
[6]中藥斑蝥的現(xiàn)代研究進展[J]. 趙麗娜,張振凌. 中國民族民間醫(yī)藥. 2010(09)
[7]斑蝥素及其衍生物抗腫瘤作用機制的研究進展[J]. 施秀青,徐瑞榮. 浙江中西醫(yī)結(jié)合雜志. 2007(12)
[8]斑蝥素抑制人宮頸癌Hela細胞增殖的研究[J]. 王曉華,馬萍,尹元琴,張衛(wèi)東,姜又紅. 中國醫(yī)科大學學報. 2007(02)
[9]斑蝥素誘導人胰腺癌細胞凋亡的實驗研究[J]. 周季蘭,姚瑋艷,章永平,喬敏敏,袁耀宗. 胰腺病學. 2006(06)
[10]斑蝥合劑對H22肝癌小鼠的抑瘤及免疫調(diào)節(jié)作用[J]. 周阿高,張勇,孔德云,王穎,張惠珍,王樹軍,蕢綱,洪聲,葛海良,任秋華,毛旭明,董佳容. 中西醫(yī)結(jié)合學報. 2006(05)
本文編號:3002580
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