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基于網(wǎng)絡藥理學探討斑蝥素抗小細胞肺癌的分子機制研究

發(fā)布時間:2021-01-27 06:13
  目的:基于網(wǎng)絡藥理學探討斑蝥素抗小細胞肺癌的關(guān)鍵靶點。方法:斑蝥素靶點通過Swiss Target Prediction進行篩選,采用Genecards和CTD數(shù)據(jù)庫篩選小細胞肺癌靶點,通過FunRich軟件獲得共有靶點,用GeneMANIA進行基因富集分析,對關(guān)鍵靶點進行相互作用分析(STRING),采用分子對接對關(guān)鍵靶點進行驗證分析。結(jié)果:獲得24個靶點,富集分析發(fā)現(xiàn):共表達(co-expression)占35.49%、物理相關(guān)性(Physical Interactions)占34.86%、預測(Predicted)占20.20%,EGFR、PTGS2和TLR4為關(guān)鍵靶點;通過分子對接發(fā)現(xiàn):斑蝥素與PTGS2有較好的結(jié)合。結(jié)論:初步明確斑蝥素可能通過調(diào)節(jié)EGFR、PTGS2和TLR4抗小細胞肺癌,其中主要靶點為PTGS2。 

【文章來源】:中醫(yī)藥信息. 2020,37(05)

【文章頁數(shù)】:4 頁

【部分圖文】:

基于網(wǎng)絡藥理學探討斑蝥素抗小細胞肺癌的分子機制研究


化學成分-疾病靶點

蛋白,相互作用,靶點,遺傳相關(guān)


24個靶點基于GeneMANIA分析靶蛋白的相互作用,其中共定位(co-localization)占0.98%、共表達(co-expression)占35.49%、物理相關(guān)性(Physical Interactions)占34.86%、預測(Predicted)占20.20%、蛋白結(jié)構(gòu)域(Shated protein domains)占4.65%、遺傳相關(guān)性(Genetic Interactions)占1.86%,見圖2。2.3 關(guān)鍵靶點分析

靶點,分子對接


基于STRING結(jié)合Cytoscape通過degree篩選,選擇degree大于12的為關(guān)鍵靶點,EGFR、PTGS2和TLR4為關(guān)鍵靶點,見圖3。2.4 iGEMDOCK分子對接結(jié)果

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3002580

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