目的:基于計(jì)算機(jī)平臺(tái)構(gòu)建活血化瘀中藥3D結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫,以期為研究者提供一個(gè)直觀的活血化瘀中藥小分子配體庫。方法:基于TCSMP數(shù)據(jù)庫信息結(jié)合PubChem數(shù)據(jù)庫得到活血化瘀中藥化學(xué)成分。基于SYBYL2.1.1對(duì)活血化瘀中藥小分子加氫、加電荷及能量?jī)?yōu)化處理。所有活血化瘀中藥化合物3D結(jié)構(gòu)的生成通過SYBYL2.1.1中能量最小化模塊實(shí)現(xiàn)。根據(jù)Lipinski規(guī)則篩選活血化瘀中藥關(guān)鍵活性成分。結(jié)果:基于TCMSP收集活血化瘀中藥化學(xué)成分1 162個(gè)。從1 162個(gè)活血化瘀中藥化學(xué)成分共篩選出145個(gè)化學(xué)成分,符合Lipinski規(guī)則,具備氫鍵受體數(shù)(HBD)<10,分子量(MW)<500,氫鍵供體數(shù)(HBA)<5,生物利用度(OB)>30%,類藥性(DL)>0.18,脂水分配系數(shù)(AlogP)<5。結(jié)論:初步建立活血化瘀中藥小分子配體庫,可為研究者發(fā)現(xiàn)心血管疾病的先導(dǎo)化合物提供理論依據(jù)。 

【文章來源】：中醫(yī)藥信息. 2020年04期 第36-39頁

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

活血化瘀中藥小分子疊合圖

活血化瘀中藥小分子網(wǎng)絡(luò)模型

【參考文獻(xiàn)】：
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