目的:通過網(wǎng)絡藥理學的方法,以分子對接篩選2015版藥典中中藥的活性靶點,研究不同歸經(jīng)中藥生物學基礎,并通過已知的活性靶點與疾病的關(guān)系,挖掘不同歸經(jīng)中藥的適應癥。利用網(wǎng)絡藥理學初步探索歸經(jīng)理論的生物學基礎,為歸經(jīng)理論的進一步研究提供理論基礎。方法:本研究首先通過對2015版藥典的整理,收集了藥典中中藥及其歸經(jīng)信息,并通過現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫和文獻的收集整理,得到中藥與化學成分數(shù)據(jù);通過drug bank數(shù)據(jù)庫收集人類蛋白靶點名稱,并從PDB數(shù)據(jù)庫上下載人類蛋白靶點結(jié)構(gòu),通過TTD網(wǎng)站呢收集蛋白靶點與疾病的關(guān)系。然后通過分子對接的方法,篩選中藥的活性成分和潛在蛋白靶點。通過活性蛋白靶點挖掘中藥的適應癥,統(tǒng)計各歸經(jīng)中藥在不同疾病中出現(xiàn)的頻率,探索不同歸經(jīng)中藥可能治療的適應癥,并尋找各歸經(jīng)中藥的共同作用靶點,通過在Gene Ontology網(wǎng)站上富集分析,分析不同歸經(jīng)中藥可能的生物學基礎。結(jié)果:(1)通過對2015版《中國藥典》的整理收集到615味中藥的歸經(jīng)信息,通過數(shù)據(jù)庫及文獻整理收集到相關(guān)化學成分13144個,drugBank上收集到人類蛋白靶點名稱936個,下載到蛋白結(jié)構(gòu)198個,通過分子對接篩選出361味中藥的1227個活性分子,86個活性蛋白靶點,篩選出了在歸經(jīng)中90%味中藥都存在的蛋白靶點。其中肝經(jīng)20個,肺經(jīng)15個,胃經(jīng)16個,脾經(jīng)15個,腎經(jīng)22個,心經(jīng)23個,大腸經(jīng)19個,膀胱經(jīng)18個,膽經(jīng)25個,小腸經(jīng)23個,心包經(jīng)39個,三焦經(jīng)25個。(2)利用活性靶點和疾病的關(guān)系,統(tǒng)計中藥在不同歸經(jīng)和疾病中的分布,大腸經(jīng)中藥在肌肉骨骼系統(tǒng)和結(jié)締組織疾病、消化系統(tǒng)疾病、血液及造血器官疾病和涉及免疫機制的某些疾患中有較高的分布頻率。肺經(jīng)中藥在眼和附器類疾病、呼吸系統(tǒng)疾病、精神和行為障礙疾病上有較高頻率的分布。肝經(jīng)中藥在皮和皮膚下疾病、呼吸系統(tǒng)疾病、泌尿生殖系統(tǒng)疾病、內(nèi)分泌、營養(yǎng)、代謝類疾病中有較高頻率的分布。膽經(jīng)中藥在呼吸系統(tǒng)疾病、皮和皮膚下疾病、精神和行為障礙疾病上有較高頻率分布。脾經(jīng)中藥在呼吸系統(tǒng)疾病皮和皮膚下疾病、精神和行為障礙疾病上有較高頻率的分布。腎經(jīng)中藥在血液及造血器官疾病和涉及免疫機制的某些疾患、呼吸系統(tǒng)疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病上有較高分布。胃經(jīng)中藥在眼和附器類疾病、血液及造血器官疾病、皮和皮膚下的疾病有較高的頻率分布。小腸經(jīng)中藥在皮和皮膚下疾病、呼吸系統(tǒng)疾病、精神和行為障礙疾病上有較高的頻率分布。心經(jīng)中藥在精神和行為障礙疾病、眼和附器類疾病、呼吸系統(tǒng)疾病、血液及造血器官疾病和涉及免疫機制的某些疾患中有較高的分布頻率。(3)通過基因富集分析,在分子功能上,肝經(jīng)中藥主要影響催化活性和抗氧化活性;心經(jīng)中藥主要影響結(jié)合功能、催化活性、及抗氧化活性,脾經(jīng)中藥主要影響催化活性和通道調(diào)節(jié)活性;肺經(jīng)中藥主要影響抗氧化活性和通道調(diào)節(jié)活性;腎經(jīng)中藥主要影響通道調(diào)節(jié)活性和催化活性;大腸經(jīng)中藥主要影響通道調(diào)節(jié)活性功能、催化活性功能和結(jié)合功能;膀胱經(jīng)中藥主要影響分子轉(zhuǎn)導活性、催化活性和酶活性的調(diào)節(jié);胃經(jīng)中藥主要影響通路調(diào)節(jié)活性和催化活性。在生物過程中,肝經(jīng)中藥主要影響生物體的代謝、信號、應激過程的調(diào)節(jié);心經(jīng)中藥主要會影響生物體的細胞,信號、應激、多細胞過程的調(diào)節(jié);脾經(jīng)中藥主要會影響生物體的細胞、信號、應激、定位過程的調(diào)節(jié);肺經(jīng)中藥主要影響應激反應;腎經(jīng)中藥主要影響生物體信號、細胞、代謝、應激的調(diào)節(jié)過程;大腸經(jīng)中藥主要影響信號、細胞和應激的調(diào)節(jié)過程;膀胱經(jīng)中藥主要影響發(fā)育、細胞、應激、移動、細胞增殖、信號和多細胞生物過程;胃經(jīng)中藥主要影響通路調(diào)節(jié)活性和催化活性。(4)通過對歸經(jīng)與疾病共同靶點的頻率分析發(fā)現(xiàn):肝經(jīng)中藥蛋白主要分布在精神和行為障礙疾病,血液及造血器官疾病和涉及免疫機制的某些疾患和妊娠、分娩和產(chǎn)褥期相關(guān)疾病上;心經(jīng)中藥的蛋白靶點主要集中于精神和行為障礙疾病,某些傳染病和寄生蟲病和泌尿生殖系統(tǒng)疾病上;脾經(jīng)中藥的蛋白主要集中在內(nèi)分泌、營養(yǎng)和代謝疾病,眼和附器疾病和耳和乳突疾病;肺經(jīng)中藥的蛋白主要集中在精神和行為障礙,呼吸系統(tǒng)疾病和循環(huán)系統(tǒng)疾病;腎經(jīng)中藥的蛋白主要集中在精神和行為障礙疾病,眼和附器疾病和泌尿生殖系統(tǒng)疾病;大腸經(jīng)中藥的蛋白主要集中在精神和行為障礙疾病,眼和附器疾病和泌尿生殖系統(tǒng)疾病;膀胱經(jīng)中藥的蛋白主要集中在精神和行為障礙疾病,妊娠、分娩和產(chǎn)褥期相關(guān)疾病,血液及造血器官疾病和涉及免疫機制的某些疾患;胃經(jīng)中藥的蛋白主要集中在精神和行為障礙疾病,妊娠、分娩和產(chǎn)褥期相關(guān)疾病,眼和附器疾病。
【學位單位】：北京中醫(yī)藥大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2018
【中圖分類】：R285
【部分圖文】：

基于網(wǎng)絡藥理學研究中藥歸經(jīng)與治療疾病的關(guān)系??如圖３．１．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６軟件從Ｒｅａｃｔｏｍｅ數(shù)據(jù)庫中導入１８８味肝經(jīng)??中藥的２０個共同活性靶點相互作用蛋白網(wǎng)絡，獲得了?４１９個肝經(jīng)中藥的潛在活??性靶點。??圖３．１．１：肝經(jīng)中藥靶點網(wǎng)絡圖??＊＂＊Ｗ?■？?ｎｉｌ?Ｊｅｗｓ＇＂０＊??：：一??－一一？華－?鑛－＊麟??ｒ?：：二二?二二二二－：－??賴酬灌嫌醬賴偷騰??３．２心經(jīng)中藥－耙點網(wǎng)絡??如圖３．２．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６軟件從Ｒｅａｃｔｏｍｅ數(shù)據(jù)庫中導入７２味心經(jīng)中??藥的２３個共同活性靶點相互作用蛋白網(wǎng)絡，獲得了?４９１個心經(jīng)中藥的潛在活性??靶點。??圖３．２．１?：心經(jīng)中藥靶點網(wǎng)絡圖??０＝ｚ?ｒ；＊－．?＾??＿?猶??—－??祕一?－－－??－ｗ??３．３脾經(jīng)中藥－耙點網(wǎng)絡??如圖３．３．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６軟件Ｒｅａｃｔｏｍｅ數(shù)據(jù)庫中導入脾經(jīng)中藥的１５??個共同活性靶點相互作用蛋白網(wǎng)絡，獲得了?４１３個肺經(jīng)中藥的潛在活性靶點。??３２??

基于網(wǎng)絡藥理學研宄中藥歸經(jīng)與治療疾病的關(guān)系??圖３．３．１：脾經(jīng)中藥靶點網(wǎng)絡圖??ｎｍ??？＜＊？??峨?？？?？？??馨ｔ??？二?？々＿?？事？篇??髮－藝??？％．?＂＾ｍ０ｍ??＿細??麵??．?＿??Ｘ－Ｌ－??擊?難猜＿?賺聰?－??ｒ?嫌?＿?＊＊＊?－??＿雜德德—??３．４肺經(jīng)中藥－祀點網(wǎng)絡??如圖３．４．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６軟件從Ｒｅａｃｔｏｍｅ數(shù)據(jù)庫中導入１４４味肺經(jīng)??中藥的１５個共同活性靶點相互作用蛋白網(wǎng)絡，獲得了?３７９個肺經(jīng)中藥的潛在活??性靶點??圖３．４．１：肺經(jīng)中藥－靶點網(wǎng)絡圖??＿ｒ＞ｒ－—－—－??＊２．?？麵?ｍｍｒｎｍｍｍ?一＊＂＜＂＞?＇?＇?ｗｍ

基于網(wǎng)絡藥理學研究中藥歸經(jīng)與治療疾病的關(guān)系??如圖３．５．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６軟件從Ｒｅａｃｔｏｍｅ數(shù)據(jù)庫中導入９８味腎經(jīng)中??藥的１６個共同活性靶點相互作用蛋白網(wǎng)絡，獲得了?４５９個腎經(jīng)中藥的潛在活性??靶點。??圖３．５．］：腎經(jīng)中藥靶點網(wǎng)絡圖??％？?．??：?＜?１??供?＊＊°?嫌??＿?一：??ｒｓ．＂＂?一??＊？?■??：Ｚ－Ｓｒ??－？＊？供?ｍ你?ｍｍ供?ｊｍｃ供供樣?條??＊？?嫌？＂＇ｍ?＊＊??３．６膽經(jīng)中藥－耙點網(wǎng)絡??如圖３．６．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６軟件從Ｒｅａｃｔｏｍｅ數(shù)據(jù)庫中導入２０味膽經(jīng)中??藥的２５個共同活性靶點相互作用蛋白網(wǎng)絡，獲得了?５２２個膽經(jīng)中藥的潛在活性??靶點。??圖３．６．１：膽經(jīng)中藥靶點網(wǎng)絡圖??．?ｒ？－？－?一?辦?＇??？??士—－參－：一＿＾
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本文編號：2884370