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基于網絡藥理學和分子對接探討腫節(jié)風的活性成分及藥效機制

發(fā)布時間:2020-10-17 06:35
   目的:運用網絡藥理學方法預測中藥腫節(jié)風的藥效物質基礎與潛在機制。方法:選用TCMSP等數(shù)據庫搜集腫節(jié)風的化學成分,并篩選活性成分;預測活性成分潛在的靶點;應用CTD匹配靶點對應的疾病;采用Cytoscape構建和分析網絡;采用STRING進行靶點蛋白質相互作用(PPI)分析;應用GlueGO行基因本體(GO)及京都基因組百科全書(KEGG)通路富集分析;采用iGEMDOCK進行分子對接。結果:篩選出22個腫節(jié)風活性成分,可作用于116個靶點治療18類疾病。淫羊藿素、苯二甲酸等8種活性成分為腫節(jié)風的主要藥效物質基礎;ALB、EGFR、CASP3及MAPK8等為其關鍵靶點;分子對接驗證了大部分關鍵活性成分能與關鍵靶點緊密結合;腫瘤、心血管及消化系統(tǒng)疾病是其主要針對的疾病。靶點富集到92個GO條目和43個KEGG通路上,功能涉及激素相關通路、VEGF信號通路和血小板功能等。結論:本研究運用網絡藥理學方法探究了腫節(jié)風的藥效物質基礎及其多維藥理作用機制,為推廣其臨床應用和進一步的研究提供了思路。
【部分圖文】:

分子對接,富集


ALB-beta-sitosterol分子對接

網絡圖,活性成分,靶點


度值指網絡中某一節(jié)點與其他節(jié)點的連接數(shù)目,一個節(jié)點的度值越大,其影響力越大,超過網絡平均度值的節(jié)點有重要地位[6]。圖1網絡中所有活性成分的平均度值為14.82,超過平均度值的節(jié)點共8個,分別是淫羊藿苷、苯二甲酸、金粟蘭內酯A、β-谷甾醇、谷甾醇、咖啡酸、金粟蘭內酯B及6,7-二甲氧基香豆素,它們是腫節(jié)風的藥效物質基礎,活性成分對應度值見表1。對于靶點而言,超過平均度值2.47的靶點有44個,意味著有44個靶點均有至少3個活性成分與之對應,說明腫節(jié)風活性成分間有普遍的協(xié)同效應。圖2 靶點-疾。═-D)網絡圖

網絡圖,靶點,網絡圖,疾病


靶點-疾。═-D)網絡圖
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