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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接探討腫節(jié)風(fēng)的活性成分及藥效機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2020-10-17 06:35
   目的:運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法預(yù)測(cè)中藥腫節(jié)風(fēng)的藥效物質(zhì)基礎(chǔ)與潛在機(jī)制。方法:選用TCMSP等數(shù)據(jù)庫搜集腫節(jié)風(fēng)的化學(xué)成分,并篩選活性成分;預(yù)測(cè)活性成分潛在的靶點(diǎn);應(yīng)用CTD匹配靶點(diǎn)對(duì)應(yīng)的疾病;采用Cytoscape構(gòu)建和分析網(wǎng)絡(luò);采用STRING進(jìn)行靶點(diǎn)蛋白質(zhì)相互作用(PPI)分析;應(yīng)用GlueGO行基因本體(GO)及京都基因組百科全書(KEGG)通路富集分析;采用iGEMDOCK進(jìn)行分子對(duì)接。結(jié)果:篩選出22個(gè)腫節(jié)風(fēng)活性成分,可作用于116個(gè)靶點(diǎn)治療18類疾病。淫羊藿素、苯二甲酸等8種活性成分為腫節(jié)風(fēng)的主要藥效物質(zhì)基礎(chǔ);ALB、EGFR、CASP3及MAPK8等為其關(guān)鍵靶點(diǎn);分子對(duì)接驗(yàn)證了大部分關(guān)鍵活性成分能與關(guān)鍵靶點(diǎn)緊密結(jié)合;腫瘤、心血管及消化系統(tǒng)疾病是其主要針對(duì)的疾病。靶點(diǎn)富集到92個(gè)GO條目和43個(gè)KEGG通路上,功能涉及激素相關(guān)通路、VEGF信號(hào)通路和血小板功能等。結(jié)論:本研究運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探究了腫節(jié)風(fēng)的藥效物質(zhì)基礎(chǔ)及其多維藥理作用機(jī)制,為推廣其臨床應(yīng)用和進(jìn)一步的研究提供了思路。
【部分圖文】:

分子對(duì)接,富集


ALB-beta-sitosterol分子對(duì)接

網(wǎng)絡(luò)圖,活性成分,靶點(diǎn)


度值指網(wǎng)絡(luò)中某一節(jié)點(diǎn)與其他節(jié)點(diǎn)的連接數(shù)目,一個(gè)節(jié)點(diǎn)的度值越大,其影響力越大,超過網(wǎng)絡(luò)平均度值的節(jié)點(diǎn)有重要地位[6]。圖1網(wǎng)絡(luò)中所有活性成分的平均度值為14.82,超過平均度值的節(jié)點(diǎn)共8個(gè),分別是淫羊藿苷、苯二甲酸、金粟蘭內(nèi)酯A、β-谷甾醇、谷甾醇、咖啡酸、金粟蘭內(nèi)酯B及6,7-二甲氧基香豆素,它們是腫節(jié)風(fēng)的藥效物質(zhì)基礎(chǔ),活性成分對(duì)應(yīng)度值見表1。對(duì)于靶點(diǎn)而言,超過平均度值2.47的靶點(diǎn)有44個(gè),意味著有44個(gè)靶點(diǎn)均有至少3個(gè)活性成分與之對(duì)應(yīng),說明腫節(jié)風(fēng)活性成分間有普遍的協(xié)同效應(yīng)。圖2 靶點(diǎn)-疾。═-D)網(wǎng)絡(luò)圖

網(wǎng)絡(luò)圖,靶點(diǎn),網(wǎng)絡(luò)圖,疾病


靶點(diǎn)-疾病(T-D)網(wǎng)絡(luò)圖
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