基于“血脈雙治”理論的中藥復(fù)方XXT分子藥理學(xué)和代謝組學(xué)研究
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R285.5
【圖文】:
圖 3.1 總 RNA 提取后甲醛變性瓊脂糖凝膠電泳圖ig. 3.1 The formaldehyde-induced agarose gel electrophoresis (SDS-PAGafter total RNA extraction異基因篩選及聚類分析實(shí)驗(yàn)通過(guò)比較芯片 cy5 和 cy3 的 Ratio 值并結(jié)合各生物學(xué)重復(fù) Ratio 的出表達(dá)基因,篩選差異表達(dá) 2 倍以上的基因?yàn)椴町惢。模型組與正 N)相比,有 435 個(gè)基因差異表達(dá),其中 373 條基因出現(xiàn)顯著表達(dá)上因出現(xiàn)顯著表達(dá)下調(diào);而給藥組與模型組相比(Y vs M),有 501 個(gè)表達(dá),其中 307 條基因出現(xiàn)顯著表達(dá)上調(diào),194 條基因出現(xiàn)顯著表達(dá)下表達(dá)基因進(jìn)行層次聚類,如圖 3.2 所示。圖中的四張芯片分別是 M1 vs2、Y1 vs M1、Y2 vs M2。圖中的差異基因主要可以分成四個(gè)區(qū)域,
圖 3.2 差異表達(dá)基因與樣本芯片的二維聚類Fig. 3.2 Hierarchical clustering of the differentially expressed genes.注:圖中的橫向 4 列為芯片樣本進(jìn)行聚類,編號(hào)為樣本名稱,縱向?yàn)椴钜蜻M(jìn)行聚類。標(biāo)注為不同顏色表示的上調(diào)及下調(diào)基因及其差異倍率.3 差異基因功能分析及 pathway 分類對(duì)差異基因進(jìn)行功能分析發(fā)現(xiàn),血瘀模型中 8 個(gè)表達(dá)上調(diào)的基因在 XX出現(xiàn)表達(dá)下調(diào)。3 個(gè)血瘀模型中出現(xiàn)表達(dá)下調(diào)的基因在 XXT 治療后出調(diào),見表 3.6。我們分析了這些基因的功能,發(fā)現(xiàn)許多基因與凝血相關(guān)a1, Car1 和 Tbxa2r。使用 David 數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)表達(dá)顯著差異的基因(Fold ch進(jìn)行 KEGG 及 GO pathway 富集分析。其中差異表達(dá)基因主要涉及細(xì)胞周
圖 3.3 F13a1, Car1 及 Tbxa2r 的 mRNA 表達(dá)水平Fig. 3.3 The mRNA expression of F13a1, Car1 and Tbxa2r芯片,又稱 DNA 芯片(DNA Chips)、DNA 微陣列(DNA Microa因探針或基因片段按特定的排列方式固定在硅片、玻璃、塑料或,形成致密有序的 DNA 分子點(diǎn)陣,按堿基配對(duì)的特性與樣品 D過(guò)計(jì)算機(jī)進(jìn)行解讀和分析獲取大量信息,實(shí)現(xiàn)對(duì)生物樣品高效醫(yī)學(xué)診斷,是綜合微電子學(xué)、物理學(xué)、生化技術(shù)及生命科學(xué)等眾綜合的高新科技;蛐酒蚱渚哂锌焖、高效、大規(guī)模、高容等特點(diǎn),被廣泛的推廣使用;蛐酒夹g(shù)的原理是先將已知核
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