模擬微重力環(huán)境對(duì)牙齦卟啉單胞菌全基因表達(dá)影響研究
發(fā)布時(shí)間:2017-08-30 08:11
本文關(guān)鍵詞:模擬微重力環(huán)境對(duì)牙齦卟啉單胞菌全基因表達(dá)影響研究
更多相關(guān)文章: 牙齦卟啉單胞菌 模擬微重力 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
【摘要】:目的:本課題通過(guò)觀察牙周致病菌牙齦卟啉單胞菌ATCC33277在模擬微重力環(huán)境下細(xì)菌生長(zhǎng)和全基因表達(dá),研究相關(guān)差異基因在牙齦卟啉單胞菌模擬微重力環(huán)境中參與應(yīng)答、代謝過(guò)程的變化,旨在揭示模擬微重力環(huán)境對(duì)牙齦卟啉單胞菌增殖、全基因表達(dá)的影響,為指導(dǎo)和維護(hù)航天員的口腔健康提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。材料和方法:本研究使用美國(guó)NASA研發(fā)的旋轉(zhuǎn)細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng)RCCS-4地面模擬系統(tǒng)模擬微重力環(huán)境以牙齦卟啉單胞菌.ATCC33277為研究對(duì)象,設(shè)為實(shí)驗(yàn)組(模擬微重力)和對(duì)照組,分別培養(yǎng)、記錄生長(zhǎng)曲線,利用高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的方法根據(jù)有生物學(xué)重復(fù)實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)設(shè)定padj0.05為閾值篩選差異表達(dá)的基因,分析差異基因聚類和GO、KEGG富集功能集團(tuán)。結(jié)果:1.模擬系統(tǒng)模擬微重力環(huán)境下牙齦卟啉單胞菌生長(zhǎng)曲線,靜止期和平臺(tái)期實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組變化無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期兩組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),實(shí)驗(yàn)組較對(duì)照組細(xì)菌增殖加快。2.轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn),實(shí)驗(yàn)組71個(gè)基因差異表達(dá),12個(gè)上調(diào)的基因包括參與編碼血細(xì)胞凝集素HagA的基因,編碼結(jié)合轉(zhuǎn)座子TraG的基因等。59個(gè)下調(diào)的基因有包括編碼細(xì)菌鞭毛fimA、fimC、fimD、fimE、mfal的基因等。3.通過(guò)對(duì)差異基因的富集和GO、KEEG聚類分析發(fā)現(xiàn)在模擬微重力環(huán)境下,牙齦卟啉單胞菌通過(guò)調(diào)整DNA復(fù)制、氧化物/超氧化物代謝活性、宿主間和細(xì)胞間的信號(hào)傳播和運(yùn)動(dòng)、ATP酶跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)活動(dòng)。結(jié)論:1.構(gòu)建了模擬微重力環(huán)境下牙齦卟啉單胞菌的培養(yǎng)模型2.模擬微重力環(huán)境對(duì)牙齦卟啉單胞菌全基因組表達(dá)的影響為雙向調(diào)節(jié)基因差異表達(dá)多與牙齦卟啉單胞菌粘附和侵入牙齦上皮以及生物膜形成相關(guān);3.根據(jù)本實(shí)驗(yàn)基因檢測(cè)結(jié)果初步推斷,模擬微重力環(huán)境下牙齦卟啉單胞菌的定植、生物膜形成和氧化應(yīng)激等能力減弱,人侵牙齦上皮的能力、毒力因子轉(zhuǎn)移和環(huán)境響應(yīng)等能力增強(qiáng)。
【關(guān)鍵詞】:牙齦卟啉單胞菌 模擬微重力 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R852.22
【目錄】:
- 中文摘要5-7
- 英文摘要7-9
- 前言9-11
- 第一部分:構(gòu)建模擬微重力環(huán)境牙齦卟啉單胞菌培養(yǎng)模型11-19
- 1.1 實(shí)驗(yàn)材料11-12
- 1.2 方法12-13
- 1.3 結(jié)果13-15
- 1.4 討論15-19
- 第二部分:模擬微重力環(huán)境牙齦卟啉單胞菌全基因表達(dá)的初步研究19-66
- 2.1 實(shí)驗(yàn)材料19-20
- 2.2 方法20-26
- 2.3 結(jié)果26-60
- 2.4 討論60-66
- 全文總結(jié)66-67
- 參考文獻(xiàn)67-77
- 文獻(xiàn)綜述77-86
- 參考文獻(xiàn)83-86
- 附錄86-88
- 個(gè)人簡(jiǎn)歷86
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表文章情況86-88
- 致謝88
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 祝昊丹;顧宏偉;陸承平;;體內(nèi)表達(dá)新基因trag在豬鏈球菌的分布及其免疫反應(yīng)性分析[J];微生物學(xué)報(bào);2008年12期
,本文編號(hào):758174
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