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光譜法和分子模擬研究替尼類藥物與生物大分子的相互作用

發(fā)布時(shí)間:2017-05-17 07:05

  本文關(guān)鍵詞:光譜法和分子模擬研究替尼類藥物與生物大分子的相互作用,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:本文通過多種光譜法結(jié)合分子模擬研究了吉非替尼與脫氧核糖核酸(DNA)的相互作用以及吉非替尼、拉帕替尼、蘇尼替尼與BSA的相互作用,通過宏觀光譜實(shí)驗(yàn)和微觀分子模擬相結(jié)合研究替尼類藥物與生物大分子的結(jié)合模式、結(jié)合作用力以及結(jié)合前后藥物對生物大分子二級結(jié)構(gòu)的影響。在模擬生理環(huán)境下通過紫外光譜法、熒光光譜法和粘度法等探討吉非替尼與小牛胸腺DNA的相互作用。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明在298 K時(shí)吉非替尼易結(jié)合在DNA的小溝區(qū),且結(jié)合常數(shù)為6.44×103 mol/L;結(jié)合作用過程中焓變(ΔH0)和熵變(ΔS0)的符號和大小表明二者主要作用力為范德華力和氫鍵作用力;圓二色譜結(jié)果表明吉非替尼與DNA作用后不會改變B型DNA的二級結(jié)構(gòu);分子模擬結(jié)果表明吉非替尼在與DNA結(jié)合前后分子結(jié)構(gòu)有明顯的改變,改變后的分子結(jié)構(gòu)能更好的進(jìn)入DNA分子中,吉非替尼分子結(jié)構(gòu)的靈活可變性在與DNA的相互作用起到了很大的作用。在研究吉非替尼、拉帕替尼及蘇尼替尼與牛血清白蛋白(BSA)的相互作用過程中,主要采用了熒光光譜法、同步熒光光譜法、圓二色光譜法和分子模擬法等實(shí)驗(yàn)方法。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明吉非替尼、拉帕替尼和蘇尼替尼的加入會導(dǎo)致BSA熒光發(fā)生猝滅;并且三種替尼類藥物與BSA的結(jié)合位點(diǎn)數(shù)均為1;藥物與BSA作用過程中的焓變(ΔH0)和熵變(ΔS0)表明三種藥物與BSA作用過程中的主要作用力均為范德華力和氫鍵作用力;圓二色譜和同步熒光結(jié)果表明三種替尼類藥物與BSA結(jié)合后不會引起B(yǎng)SA二級結(jié)構(gòu)的改變;熒光競爭結(jié)果表明吉非替尼和蘇尼替尼結(jié)合與保泰松競爭結(jié)合BSA的site I位點(diǎn),拉帕替尼與布洛芬競爭結(jié)合BSA的site II位點(diǎn);分子對接的結(jié)果從微觀水平印證了光譜法得到的結(jié)果。
【關(guān)鍵詞】:脫氧核糖核酸 牛血清白蛋白 吉非替尼 拉帕替尼 蘇尼替尼 光譜法 分子模擬
【學(xué)位授予單位】:浙江工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R914
【目錄】:
  • 摘要4-5
  • ABSTRACT5-10
  • 符號說明10-11
  • 第一章 緒論11-22
  • 1.1 兩種生物大分子的結(jié)構(gòu)和組成11-13
  • 1.1.1 脫氧核糖核酸(DNA)11
  • 1.1.2 血清白蛋白(ALB)11-13
  • 1.2 替尼類藥物的結(jié)構(gòu)和特征13-15
  • 1.3 藥物小分子與生物大分子相互作用的方式15-17
  • 1.3.1 藥物小分子與DNA的相互作用方式15-16
  • 1.3.2 藥物小分子與BSA的相互作用方式16-17
  • 1.4 研究方法17-20
  • 1.4.1 紫外-可見吸收光譜法17-18
  • 1.4.2 熒光光譜法18-19
  • 1.4.3 同步熒光光譜法19
  • 1.4.4 圓二色光譜法19
  • 1.4.5 分子模擬法19-20
  • 1.5 課題的研究意義及現(xiàn)狀20-22
  • 第二章 光譜法結(jié)合分子模擬研究吉非替尼與ct-DNA的相互作用22-37
  • 2.1 引言22
  • 2.2 實(shí)驗(yàn)部分22-25
  • 2.2.1 儀器及試劑22-23
  • 2.2.2 儲備液的配置23
  • 2.2.3 紫外可見分光光度法23-24
  • 2.2.4 粘度實(shí)驗(yàn)24
  • 2.2.5 熒光光譜法24
  • 2.2.6 圓二光譜法24
  • 2.2.7 分子模擬法24-25
  • 2.3 結(jié)果與討論25-36
  • 2.3.1 紫外光譜法25-26
  • 2.3.2 結(jié)合常數(shù)和作用力26-28
  • 2.3.3 離子強(qiáng)度的影響28-29
  • 2.3.4 粘度測定29-30
  • 2.3.5 競爭結(jié)合作用30-32
  • 2.3.6 圓二色譜32-33
  • 2.3.7 分子模擬33-36
  • 2.4 本章小結(jié)36-37
  • 第三章 光譜法結(jié)合分子模擬研究替尼類藥物與BSA的相互作用37-64
  • 3.1 引言37
  • 3.2 實(shí)驗(yàn)部分37-40
  • 3.2.1 儀器及試劑37-38
  • 3.2.2 儲備液的配制38
  • 3.2.3 熒光光譜測定38-39
  • 3.2.4 同步熒光光譜測定39
  • 3.2.5 圓二色譜測定39
  • 3.2.6 分子模擬法39-40
  • 3.3 結(jié)果與討論40-58
  • 3.3.1 藥物對BSA的熒光猝滅及其機(jī)理40-44
  • 3.3.2 表觀結(jié)合常數(shù)、結(jié)合位點(diǎn)數(shù)及主要作用力44-49
  • 3.3.3 結(jié)合位點(diǎn)49-52
  • 3.3.4 BSA構(gòu)象表征52-56
  • 3.3.5 藥物分子與BSA之間的能量轉(zhuǎn)移56-58
  • 3.4 分子模擬法58-62
  • 3.5 本章小結(jié)62-64
  • 第四章 結(jié)論與展望64-66
  • 4.1 結(jié)論64
  • 4.2 展望64-66
  • 參考文獻(xiàn)66-72
  • 致謝72-73
  • 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄73

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