光譜法和分子模擬研究替尼類藥物與生物大分子的相互作用
本文關(guān)鍵詞:光譜法和分子模擬研究替尼類藥物與生物大分子的相互作用,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:本文通過多種光譜法結(jié)合分子模擬研究了吉非替尼與脫氧核糖核酸(DNA)的相互作用以及吉非替尼、拉帕替尼、蘇尼替尼與BSA的相互作用,通過宏觀光譜實(shí)驗(yàn)和微觀分子模擬相結(jié)合研究替尼類藥物與生物大分子的結(jié)合模式、結(jié)合作用力以及結(jié)合前后藥物對生物大分子二級結(jié)構(gòu)的影響。在模擬生理環(huán)境下通過紫外光譜法、熒光光譜法和粘度法等探討吉非替尼與小牛胸腺DNA的相互作用。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明在298 K時(shí)吉非替尼易結(jié)合在DNA的小溝區(qū),且結(jié)合常數(shù)為6.44×103 mol/L;結(jié)合作用過程中焓變(ΔH0)和熵變(ΔS0)的符號和大小表明二者主要作用力為范德華力和氫鍵作用力;圓二色譜結(jié)果表明吉非替尼與DNA作用后不會改變B型DNA的二級結(jié)構(gòu);分子模擬結(jié)果表明吉非替尼在與DNA結(jié)合前后分子結(jié)構(gòu)有明顯的改變,改變后的分子結(jié)構(gòu)能更好的進(jìn)入DNA分子中,吉非替尼分子結(jié)構(gòu)的靈活可變性在與DNA的相互作用起到了很大的作用。在研究吉非替尼、拉帕替尼及蘇尼替尼與牛血清白蛋白(BSA)的相互作用過程中,主要采用了熒光光譜法、同步熒光光譜法、圓二色光譜法和分子模擬法等實(shí)驗(yàn)方法。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明吉非替尼、拉帕替尼和蘇尼替尼的加入會導(dǎo)致BSA熒光發(fā)生猝滅;并且三種替尼類藥物與BSA的結(jié)合位點(diǎn)數(shù)均為1;藥物與BSA作用過程中的焓變(ΔH0)和熵變(ΔS0)表明三種藥物與BSA作用過程中的主要作用力均為范德華力和氫鍵作用力;圓二色譜和同步熒光結(jié)果表明三種替尼類藥物與BSA結(jié)合后不會引起B(yǎng)SA二級結(jié)構(gòu)的改變;熒光競爭結(jié)果表明吉非替尼和蘇尼替尼結(jié)合與保泰松競爭結(jié)合BSA的site I位點(diǎn),拉帕替尼與布洛芬競爭結(jié)合BSA的site II位點(diǎn);分子對接的結(jié)果從微觀水平印證了光譜法得到的結(jié)果。
【關(guān)鍵詞】:脫氧核糖核酸 牛血清白蛋白 吉非替尼 拉帕替尼 蘇尼替尼 光譜法 分子模擬
【學(xué)位授予單位】:浙江工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R914
【目錄】:
- 摘要4-5
- ABSTRACT5-10
- 符號說明10-11
- 第一章 緒論11-22
- 1.1 兩種生物大分子的結(jié)構(gòu)和組成11-13
- 1.1.1 脫氧核糖核酸(DNA)11
- 1.1.2 血清白蛋白(ALB)11-13
- 1.2 替尼類藥物的結(jié)構(gòu)和特征13-15
- 1.3 藥物小分子與生物大分子相互作用的方式15-17
- 1.3.1 藥物小分子與DNA的相互作用方式15-16
- 1.3.2 藥物小分子與BSA的相互作用方式16-17
- 1.4 研究方法17-20
- 1.4.1 紫外-可見吸收光譜法17-18
- 1.4.2 熒光光譜法18-19
- 1.4.3 同步熒光光譜法19
- 1.4.4 圓二色光譜法19
- 1.4.5 分子模擬法19-20
- 1.5 課題的研究意義及現(xiàn)狀20-22
- 第二章 光譜法結(jié)合分子模擬研究吉非替尼與ct-DNA的相互作用22-37
- 2.1 引言22
- 2.2 實(shí)驗(yàn)部分22-25
- 2.2.1 儀器及試劑22-23
- 2.2.2 儲備液的配置23
- 2.2.3 紫外可見分光光度法23-24
- 2.2.4 粘度實(shí)驗(yàn)24
- 2.2.5 熒光光譜法24
- 2.2.6 圓二光譜法24
- 2.2.7 分子模擬法24-25
- 2.3 結(jié)果與討論25-36
- 2.3.1 紫外光譜法25-26
- 2.3.2 結(jié)合常數(shù)和作用力26-28
- 2.3.3 離子強(qiáng)度的影響28-29
- 2.3.4 粘度測定29-30
- 2.3.5 競爭結(jié)合作用30-32
- 2.3.6 圓二色譜32-33
- 2.3.7 分子模擬33-36
- 2.4 本章小結(jié)36-37
- 第三章 光譜法結(jié)合分子模擬研究替尼類藥物與BSA的相互作用37-64
- 3.1 引言37
- 3.2 實(shí)驗(yàn)部分37-40
- 3.2.1 儀器及試劑37-38
- 3.2.2 儲備液的配制38
- 3.2.3 熒光光譜測定38-39
- 3.2.4 同步熒光光譜測定39
- 3.2.5 圓二色譜測定39
- 3.2.6 分子模擬法39-40
- 3.3 結(jié)果與討論40-58
- 3.3.1 藥物對BSA的熒光猝滅及其機(jī)理40-44
- 3.3.2 表觀結(jié)合常數(shù)、結(jié)合位點(diǎn)數(shù)及主要作用力44-49
- 3.3.3 結(jié)合位點(diǎn)49-52
- 3.3.4 BSA構(gòu)象表征52-56
- 3.3.5 藥物分子與BSA之間的能量轉(zhuǎn)移56-58
- 3.4 分子模擬法58-62
- 3.5 本章小結(jié)62-64
- 第四章 結(jié)論與展望64-66
- 4.1 結(jié)論64
- 4.2 展望64-66
- 參考文獻(xiàn)66-72
- 致謝72-73
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄73
【相似文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 左之利,周魯,蘇怡,陳小全,趙蔡斌;部分鎮(zhèn)痛藥的分子模擬及其量化計(jì)算[J];生物物理學(xué)報(bào);2002年01期
2 郭明;范文翔;魯小旺;;光譜法結(jié)合分子模擬分析乳鐵蛋白與藥物恩諾沙星的互作分子機(jī)理[J];分析測試學(xué)報(bào);2013年09期
3 賈衛(wèi)平;焦勇;楊頻;;分子模擬研究銅、鋅與Aβ肽相互作用中的競爭取代效應(yīng)[J];化學(xué)學(xué)報(bào);2007年14期
4 ;臨床用免疫學(xué)關(guān)鍵詞100[J];日本醫(yī)學(xué)介紹;1999年07期
5 馮壯;分子模擬與兒科疾病[J];實(shí)用兒科臨床雜志;2004年02期
6 李恩,李燕;三維定量構(gòu)效關(guān)系和同源分子模擬在細(xì)胞色素P450研究中的應(yīng)用[J];國外醫(yī)學(xué).藥學(xué)分冊;2004年06期
7 盧雁;王運(yùn)來;王公軻;高勝華;;槲皮素與卵清蛋白相互作用的光譜和分子模擬研究[J];河南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2009年01期
8 李晶;趙海燕;李鯤鵬;;一種基于病毒三維重建進(jìn)行分子模擬研究的基本思路[J];中國醫(yī)療設(shè)備;2013年04期
9 王三躍;陽慶元;仲崇立;;柔性金屬-有機(jī)骨架材料中甲醇吸附和擴(kuò)散的分子模擬[J];化學(xué)學(xué)報(bào);2006年17期
10 許國友,韋苞洋,黃文龍,華維一,,彭司勛;化合物CPU 23,CPU 80與硝苯啶的分子模擬及其構(gòu)象分析[J];中國藥物化學(xué)雜志;1996年01期
中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 焦勇;韓大雄;楊頻;;金屬離子離子影響Aβ多肽聚集機(jī)理的分子模擬[A];中國化學(xué)會第二十五屆學(xué)術(shù)年會論文摘要集(上冊)[C];2006年
2 莫尊理;喬麗君;陳紅;郭瑞斌;孫亞玲;;纖維素/二氧化硅復(fù)合材料的分子模擬[A];中國化學(xué)會第26屆學(xué)術(shù)年會理論化學(xué)方法和應(yīng)用分會場論文集[C];2008年
3 徐為人;湯立達(dá);符海霞;劉冰妮;劉鵬;;分子模擬與新藥虛擬評價(jià)[A];全國第十一屆生化與分子藥理學(xué)學(xué)術(shù)會議論文集[C];2009年
4 高品;黃光速;張艷芳;王建;陳猛猛;;聚丙烯酰胺交聯(lián)反應(yīng)的分子模擬[A];2007年全國高分子學(xué)術(shù)論文報(bào)告會論文摘要集(上冊)[C];2007年
5 胡文兵;;蒙特卡羅分子模擬的物理背景探討[A];第十屆全國計(jì)算(機(jī))化學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2009年
6 劉清芝;楊登峰;胡仰棟;;水和鹽分子在反滲透膜內(nèi)擴(kuò)散過程的分子模擬[A];中國化學(xué)會第26屆學(xué)術(shù)年會理論化學(xué)方法和應(yīng)用分會場論文集[C];2008年
7 陸小華;;受限條件下流體的分子模擬[A];中國化學(xué)會第十五屆全國化學(xué)熱力學(xué)和熱分析學(xué)術(shù)會議論文摘要[C];2010年
8 李豐;楊春煒;孫淮;;力場參數(shù)的數(shù)據(jù)庫整合[A];中國化學(xué)會第27屆學(xué)術(shù)年會第15分會場摘要集[C];2010年
9 劉志平;吳曉萍;汪文川;黃世萍;;離子液體-乙腈混合物的分子模擬[A];第一屆全國化學(xué)工程與生物化工年會論文摘要集(上)[C];2004年
10 趙秦峰;王大喜;高金森;徐春明;;分子模擬于ZSM-5的應(yīng)用進(jìn)展[A];第九屆全國化學(xué)工藝學(xué)術(shù)年會論文集[C];2005年
中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 石克軒;石科院分子模擬研究掀新頁[N];中國石化報(bào);2000年
2 蔣華良 中國科學(xué)院上海藥物研究所研究員;分子模擬的普及和應(yīng)用[N];文匯報(bào);2013年
中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 沈明云;基于Rho激酶的藥物設(shè)計(jì)和分子模擬研究[D];蘇州大學(xué);2015年
2 宋夢;丁腈橡膠復(fù)合材料的動態(tài)力學(xué)性能分析及分子模擬研究[D];北京化工大學(xué);2015年
3 洪燕君;分子模擬在藥物代謝和血漿蛋白結(jié)合中的應(yīng)用[D];浙江大學(xué);2011年
4 孫命;分子模擬在生命有機(jī)磷化學(xué)中的應(yīng)用[D];清華大學(xué);2004年
5 王三躍;金屬—有機(jī)骨架材料中流體吸附性質(zhì)的量化計(jì)算與分子模擬研究[D];北京化工大學(xué);2007年
6 劉光增;金、鉑、銅單晶面上自組裝單層膜的ECSTM與分子模擬研究[D];山東大學(xué);2006年
7 薛春瑜;金屬—有機(jī)骨架材料中流體吸附與擴(kuò)散的分子模擬研究[D];北京化工大學(xué);2009年
8 朱紅;G-quadruplex結(jié)構(gòu)和穩(wěn)定性的分子模擬研究[D];中國科學(xué)技術(shù)大學(xué);2015年
9 戴偉民;人類苦味受體的分子模擬研究[D];南京大學(xué);2011年
10 韓大雄;分子模擬研究老年癡呆致病蛋白結(jié)構(gòu)以及基于酶結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)[D];山西大學(xué);2004年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 解媛哲;量熱法及分子模擬研究藥物結(jié)構(gòu)類似物與蛋白的相互作用[D];鄭州大學(xué);2015年
2 王海鴻;含氧雜環(huán)的噻唑—吡唑類衍生物設(shè)計(jì)、修飾與生物活性評價(jià)[D];南京大學(xué);2014年
3 李一;中結(jié)合苯乙烯含量丁苯橡膠的結(jié)構(gòu)性能分析及分子模擬研究[D];北京化工大學(xué);2015年
4 劉婷婷;光譜法和分子模擬研究替尼類藥物與生物大分子的相互作用[D];浙江工業(yè)大學(xué);2015年
5 牟曉輝;丁二酰亞胺無灰分散劑作用機(jī)理的分子模擬研究[D];石油化工科學(xué)研究院;2000年
6 穆椺;金屬—有機(jī)骨架材料中氣體吸附與分離的分子模擬研究[D];北京化工大學(xué);2008年
7 王瑩;計(jì)算機(jī)分子模擬中并行計(jì)算的研究[D];北京化工大學(xué);2001年
8 張偉濤;吸附與擴(kuò)散過程的分子模擬[D];中國海洋大學(xué);2009年
9 張翔;流體在碳材料中吸附分離的實(shí)驗(yàn)及分子模擬[D];北京化工大學(xué);2010年
10 孔曉光;黃酮等三類藥物的合成及分子模擬[D];南京師范大學(xué);2011年
本文關(guān)鍵詞:光譜法和分子模擬研究替尼類藥物與生物大分子的相互作用,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:372740
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/yxlw/372740.html