【摘要】：目的探索模擬失重下空間誘變大腸桿菌(T1-13)感染巨噬細胞RAW264.7后差異表達的microRNAs(miRNAs)及其意義。方法采用第二代測序技術(shù)檢測模擬失重染菌組與對照組巨噬細胞miRNAs差異表達,通過生物信息學(xué)預(yù)測差異miRNAs的靶基因,并對靶基因進行GO功能富集分析、KEGG信號通路分析以及STRING蛋白互作分析。結(jié)果模擬失重染菌組與對照組間篩選出33個差異miRNAs,下調(diào)23個,上調(diào)10個。這些miRNAs互補結(jié)合的靶基因參與了MAPK通路、WNT通路、軸突導(dǎo)向以及TGF-β等信號通路,其中關(guān)鍵下調(diào)的靶基因是MAPK9,MAPK14,MAP3K7,MAP3K14,PIK3CA,PIK3CB,PIK3CD,MYC,JUN,SMAD4;關(guān)鍵上調(diào)的靶基因是AKT3,MAPK8,MAPK9,MAPK10,MAP2K1,PIK3CD。結(jié)論模擬失重下空間誘變大腸桿菌感染巨噬細胞后miRNAs表達出現(xiàn)顯著差異,這些miRNAs可能通過調(diào)控MAPK,WNT以及TGF-β等通路參與失重條件下炎癥反應(yīng)的發(fā)生。
[Abstract]:Objective to explore the differential expression of microRNAs (miRNAs) in macrophages infected with space mutated Escherichia coli (T1-13) under simulated weightlessness and its significance. Methods the second generation sequencing technique was used to detect the differential expression of miRNAs in macrophages of simulated weightlessness group and control group. The target genes of differential miRNAs were predicted by bioinformatics, and the GO function enrichment analysis was carried out on the target genes. KEGG signal pathway analysis and STRING protein interaction analysis. Results 33 differences in miRNAs, were down-regulated by 23 and increased by 10 between the simulated weightlessness group and the control group. These complementary miRNAs binding target genes are involved in MAPK pathway, WNT pathway, axon orientation and TGF- 尾 signaling pathway. The key down-regulated target gene is MAPK9,MAPK14,MAP3K7,MAP3K14,PIK3CA,PIK3CB,PIK3CD,MYC,JUN,SMAD4;. The key up-regulated target gene is AKT3,MAPK8,MAPK9,MAPK10,MAP2K1,PIK3CD. Conclusion there is a significant difference in miRNAs expression in macrophages infected by space mutagenesis under simulated weightlessness. These miRNAs may be involved in inflammatory reaction under weightlessness through regulating MAPK,WNT and TGF- 尾 pathways.
【作者單位】： 石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院;石河子大學(xué)第一附屬醫(yī)院檢驗科;錦州醫(yī)科大學(xué);中國航天員科研訓(xùn)練中心航天醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)與應(yīng)用國家重點實驗室;解放軍總醫(yī)院南樓呼吸科;
【基金】：國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(2014CB744404)
【分類號】：R852.22

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本文編號：2375797