目的探討太赫茲（terahertz,THz）輻射暴露后視網(wǎng)膜組織基因表達(dá)變化的整體情況,揭示THz暴露所致視覺系統(tǒng)損傷效應(yīng)的關(guān)鍵信號(hào)通路及關(guān)鍵基因。方法通過平均功率密度80 mW/cm²的THz輻射暴露小鼠眼部,暴露時(shí)長2 min,取暴露后視網(wǎng)膜組織,采用RNA-seq測序分析基因表達(dá)變化的整體差異,采用聚類分析及富集分析揭示差異基因富集的信號(hào)通路和所揭示的生物功能;并進(jìn)一步通過Real-time PCR揭示THz輻射暴露對視網(wǎng)膜損傷關(guān)鍵基因表達(dá)影響的時(shí)效關(guān)系。結(jié)果以P<0.05、|logFC|≥1為篩選條件對差異表達(dá)基因進(jìn)行篩選,共篩選出上調(diào)基因625個(gè),下調(diào)基因9個(gè)。GO分析差異基因主要分布于細(xì)胞外成分,分子功能主要為影響蛋白結(jié)合等,生物功能主要為細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)與細(xì)胞增殖等。KEGG信號(hào)通路分析結(jié)果顯示,差異基因主要影響PPAR信號(hào)通路、癌癥相關(guān)信號(hào)通路、鈣離子信號(hào)通路及PI3K-Akt信號(hào)通路。通過Real-time PCR對視網(wǎng)膜損傷相關(guān)基因進(jìn)行驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),在暴露后5 min及24 h,THz輻射暴露均上調(diào)Krt12、Cfd、Wnt3a及Adipoq表達(dá)... 

【文章來源】：第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,42(23)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

太赫茲輻射暴露后眼部升溫曲線

為深入分析太赫茲輻射暴露所致差異基因主要影響細(xì)胞哪些功能,將全部差異基因進(jìn)行了GO富集分析。GO富集分析結(jié)果按照分子功能、生物過程和細(xì)胞組分進(jìn)行GO 分類,圖3所示為每個(gè)GO分類中富集最顯著的前10個(gè)GO子集條目。從該結(jié)果可以看出,細(xì)胞組分分類中主要是細(xì)胞外成分(細(xì)胞外區(qū)域部分、細(xì)胞外區(qū)域),表明強(qiáng)太赫茲暴露所影響的基因主要是編碼細(xì)胞外成分的蛋白;分子功能分類中變化最為顯著的子集主要包括蛋白結(jié)合(同型蛋白結(jié)合、蛋白結(jié)合)、鈣離子通道蛋白結(jié)合以及蛋白二聚體活性等;生物過程分類中變化最為顯著的為發(fā)育相關(guān)子集(組織發(fā)育、發(fā)育過程、系統(tǒng)發(fā)育)、與外界有害因素刺激反應(yīng)相關(guān)子集(細(xì)胞外刺激反應(yīng)、應(yīng)激系統(tǒng))、細(xì)胞增殖、細(xì)胞黏附等(圖3)。圖3 太赫茲輻射暴露后差異基因GO分析

太赫茲輻射暴露后差異基因GO分析


本文編號(hào)：3527397