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熒光標記LDR-PCR復合擴增方法對高度降解DNA檢材的SNPs分型研究

發(fā)布時間:2020-08-27 10:01
【摘要】:目的構建一套基于連接酶檢測反應(LDR)的熒光標記PCR復合擴增體系,為解決高度降解DNA法醫(yī)學分析提供新的策略。方法選擇8個單核苷酸多態(tài)性(SNPs)位點(rs10802248、rs10516197、rs10488372、rs2278945、rs4757318、rs4887255、rs4889002和rs9304473),設計合成各SNPs位點的LDR探針和連接產物PCR引物,通過LDR將連接產物進行PCR擴增,并將擴增產物進行毛細管凝膠電泳,構建復合擴增SNPs分型體系。結果使用熒光標記LDR-PCR復合擴增方法,對不同個體的8個SNPs位點進行分型,分型結果與測序結果完全一致;對于甲醛固定石蠟包埋組織(FFPET)檢材高度降解的DNA樣品,熒光標記LDR-PCR復合擴增體系能夠實現(xiàn)8個SNPs位點的準確分型。結論熒光標記LDR-PCR復合擴增方法能夠對8個SNPs位點進行一次性分型,結果準確、可靠,是一種簡單、高效并且較為實用的SNPs分型新方法,適用于高度降解檢材的檢測。

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本文編號:2805955

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