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冠狀動(dòng)脈立體分割算法研究

發(fā)布時(shí)間:2020-04-09 15:19
【摘要】:隨著冠心病診斷需求的不斷增加,基于醫(yī)學(xué)圖像的輔助診斷已成為提高診斷效率的重要手段;贑TA數(shù)據(jù)的冠狀動(dòng)脈立體分割是冠心病輔助診斷的關(guān)鍵技術(shù),已成為研究的熱點(diǎn)。受不同設(shè)備、不同病人和造影劑分布不均勻等因素的影響,冠狀動(dòng)脈在CTA數(shù)據(jù)中的清晰度不同,冠狀動(dòng)脈立體分割成為一項(xiàng)具有挑戰(zhàn)的任務(wù)。本文針對(duì)冠狀動(dòng)脈CTA數(shù)據(jù),從準(zhǔn)確性、自動(dòng)性和運(yùn)行速度三個(gè)方面,展開了對(duì)冠狀動(dòng)脈分割算法的研究,具體工作如下:(1)提出一種基于多特征約束的區(qū)域生長分割算法。該算法考慮到冠狀動(dòng)脈粗細(xì)不同的管狀特性,使用管狀濾波器提取不同尺度下的血管相似性特征,同時(shí)結(jié)合冠狀動(dòng)脈在CTA數(shù)據(jù)中的密度特征共同作為區(qū)域生長的約束條件。本算法很好的解決了單特征區(qū)域生長算法容易出現(xiàn)的欠分割現(xiàn)象,提高分割算法的精度。在有先驗(yàn)閾值的情況下,其測(cè)試Dice系數(shù)為0.88,比單特征方法提高0.2;在沒有先驗(yàn)閾值情況下,其測(cè)試Dice系數(shù)為0.6(同樣比單特征方法高),算法運(yùn)行時(shí)間為460秒左右。(2)提出一種結(jié)合3D全卷積網(wǎng)絡(luò)和生長思想的自動(dòng)分割算法。該分割算法主要有起始種子點(diǎn)定位、局部數(shù)據(jù)塊的分割和種子點(diǎn)搜索策略三個(gè)部分:●起始點(diǎn)定位:根據(jù)升主動(dòng)脈和冠狀動(dòng)脈的連通性質(zhì),通過分割升主動(dòng)脈來自動(dòng)定位冠狀動(dòng)脈根節(jié)點(diǎn),為實(shí)現(xiàn)冠狀動(dòng)脈自動(dòng)分割提供條件;●局部數(shù)據(jù)塊的分割:提出一種多感受野融合的3D分割網(wǎng)絡(luò)。該部分用尺寸為64×64×64的局部數(shù)據(jù)塊和Dice損失函數(shù)解決冠狀動(dòng)脈立體分割中出現(xiàn)的標(biāo)簽分布極不平衡的問題。在網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)上,該網(wǎng)絡(luò)在編碼器末端加入金字塔池化,多感受野融合的結(jié)構(gòu)更好的結(jié)合了數(shù)據(jù)塊中的全局信息和局部信息,很好的抑制了其他組織的干擾;此外,在編-解碼的全卷積網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)中加入殘差模塊、批歸一化、Dropout等操作,抑制網(wǎng)絡(luò)過擬合的同時(shí)保證網(wǎng)絡(luò)的快速收斂;●種子點(diǎn)搜索策略:提出一種基于生長思想的種子點(diǎn)搜索策略,通過分析上一次數(shù)據(jù)塊的分割結(jié)果確定下一次選擇數(shù)據(jù)塊的中心,提取冠狀動(dòng)脈附近的數(shù)據(jù)塊,實(shí)現(xiàn)了高效使用訓(xùn)練好的分割網(wǎng)絡(luò);該分割算法在測(cè)試集上平均Dice系數(shù)為0.76,運(yùn)行時(shí)間在40秒左右。(3)根據(jù)本文分割算法實(shí)現(xiàn)了冠狀動(dòng)脈的狹窄測(cè)量。通過對(duì)血管拉直、細(xì)化、分段、計(jì)算橫截面積等操作后,初步可以實(shí)現(xiàn)冠狀動(dòng)脈狹窄測(cè)量,為冠狀動(dòng)脈狹窄檢測(cè)和量化分級(jí)等應(yīng)用提供可行性分析。綜上所述,本文提出的兩種冠狀動(dòng)脈分割算法在測(cè)試集上的Dice系數(shù)從60%提升到了76%,運(yùn)行時(shí)間從460秒減少到40秒,同時(shí)實(shí)現(xiàn)了冠狀動(dòng)脈的自動(dòng)分割;诒疚姆指钏惴ǖ姆指罱Y(jié)果初步實(shí)現(xiàn)了血管狹窄測(cè)量,證明了算法的有效性。
【圖文】:

數(shù)據(jù),冠狀動(dòng)脈,樣本,血管成像


的信號(hào)經(jīng)過重建后形成CT圖像。當(dāng)需要研究血管成像時(shí),因?yàn)檠旱拿芏群退义虾芙咏蝗菀自谄胀ǎ茫詧D像上顯示,所以需要注射造影劑對(duì)血管進(jìn)行增強(qiáng),然逡逑后利用計(jì)算機(jī)重建算法恢復(fù)血管的立體影像。不同視角下的CTA如圖2-1所示。逡逑(d)樣本二橫斷位邐(e)樣本二矢狀位邐(f)樣本二冠狀位逡逑圖2-1不同視角下的CTA數(shù)據(jù)逡逑冠狀動(dòng)脈分為左冠狀動(dòng)脈和右冠狀動(dòng)脈兩個(gè)大的分支;目前大部分研究人員逡逑采用美國心臟病協(xié)會(huì)(AHA)提出的冠狀動(dòng)脈劃分標(biāo)準(zhǔn),該標(biāo)準(zhǔn)將直徑大于1.5mm逡逑7逡逑

分布圖,冠狀動(dòng)脈,分布圖,數(shù)據(jù)


第二章冠狀動(dòng)脈數(shù)據(jù)介紹逡逑的冠狀動(dòng)脈分成了邋17段,如圖2-2所示。逡逑OM?逡逑圖2-2冠狀動(dòng)脈劃分解剖圖逡逑左冠狀動(dòng)脈分支共丨2段,主要包括左循環(huán)支(1丨,13),左對(duì)角支(16),逡逑左前降支(6,邋7,,邋8)等大的分支;右冠狀動(dòng)脈分支共5段,主要包括后降支(4)、逡逑右冠(1,2,3)等大的分支。冠狀動(dòng)脈各個(gè)分支在CTA圖像橫斷位中如圖2-3逡逑所示。逡逑000逡逑圖2-3冠狀動(dòng)脈在CTA數(shù)據(jù)橫斷位中的分布圖逡逑為了存儲(chǔ)CTA數(shù)據(jù),通常使用固定的編碼方式將重建的圖像存儲(chǔ)在計(jì)算機(jī)逡逑中。醫(yī)學(xué)圖像常用的編碼格式有6種,分別為:ANALYZE(Mayo醫(yī)學(xué)成像)、NRRD逡逑(近原始柵格數(shù)據(jù))、DICOM(醫(yī)學(xué)數(shù)字成像核通訊)、NIFTI(神經(jīng)影像信息技術(shù))、逡逑PAR/REC(Philips磁共振掃描格式)和MNIC。下面對(duì)本文中常使用的兩種格式進(jìn)逡逑行介紹。逡逑NRRI):邋“國家醫(yī)學(xué)圖像計(jì)算聯(lián)盟”(NA-MIC)開發(fā)的一種存儲(chǔ)編碼方式,逡逑8逡逑
【學(xué)位授予單位】:北方工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R816.2;TP391.41

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本文編號(hào):2620928

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