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MALDI-TOF-MS對(duì)DAI大鼠腦干蛋白質(zhì)組學(xué)的分析

發(fā)布時(shí)間:2018-10-12 17:38
【摘要】:目的應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解吸/電離-飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization timeof-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技術(shù)建立彌漫性軸索損傷(diffuse axonal injury,DAI)診斷模型,篩選DAI相關(guān)蛋白或多肽,為尋找DAI的分子標(biāo)志物提供理論基礎(chǔ)。方法將15只雄性SD大鼠隨機(jī)分為DAI組(n=10)和對(duì)照組(n=5),采用MALDI-TOF-MS技術(shù)對(duì)兩組大鼠腦干組織的蛋白或多肽表達(dá)譜進(jìn)行檢測(cè),運(yùn)用Clin Pro Tools 2.2分析軟件篩選出具有差異的分子峰,應(yīng)用遺傳算法建立診斷模型。結(jié)果篩選出有差異的分子峰61個(gè)(P0.05),其中DAI組有9個(gè)分子峰下調(diào),52個(gè)分子峰上調(diào)。篩選出5個(gè)分子峰建立診斷模型,交叉驗(yàn)證的特異性為96.14%、敏感性為95.98%,盲法驗(yàn)證結(jié)果的特異性為73.33%、敏感性為70.00%。結(jié)論應(yīng)用MALDI-TOF-MS技術(shù)不僅能夠建立特異性和敏感性較高的DAI診斷模型,還可以篩選差異蛋白或多肽,為DAI的法醫(yī)學(xué)鑒定奠定理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to establish a diagnostic model of diffuse axonal injury (diffuse axonal injury,DAI) by matrix assisted laser desorption / ionization / time of flight mass spectrometry (matrix-assisted laser desorption/ionization timeof-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS), and to screen DAI related proteins or peptides, and to provide a theoretical basis for searching for molecular markers of DAI. Methods Fifteen male SD rats were randomly divided into DAI group (n = 10) and control group (n = 5). The expression profiles of protein or polypeptide in brain stem tissue of two groups were detected by MALDI-TOF-MS technique. The molecular peaks were screened by Clin Pro Tools 2.2 analysis software. Genetic algorithm is used to establish diagnostic model. Results there were 61 different molecular peaks (P0.05). In DAI group, there were 9 down-regulated molecular peaks and 52 up-regulated molecular peaks. Five molecular peaks were screened to establish diagnostic models. The specificity of cross-validation was 96.14, the sensitivity was 95.98, the specificity of blind test was 73.33, and the sensitivity was 70.00. Conclusion MALDI-TOF-MS can not only establish a specific and sensitive diagnostic model for DAI, but also screen differentially expressed proteins or peptides, thus laying a theoretical foundation for forensic identification of DAI.
【作者單位】: 南方醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院法醫(yī)學(xué)系;司法部司法鑒定科學(xué)技術(shù)研究所上海市法醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:中央級(jí)科研院所科研專項(xiàng)(GY2013Z-3,GY2015G-2)
【分類號(hào)】:D919

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本文編號(hào):2267016

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