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潮汕漢族群體27個Y-STR基因座的單倍型及遺傳關系分析

發(fā)布時間:2018-09-11 12:26
【摘要】:目的調(diào)查Yfiler~?Plus試劑盒中所包含的27個Y-STR基因座在潮汕漢族男性群體中的單倍型數(shù)據(jù),探討其群體遺傳關系及法醫(yī)學應用價值。方法應用Yfiler~?Plus試劑盒對795名廣東潮汕漢族無關男性個體外周血樣進行27個Y-STR基因座分型檢測,統(tǒng)計分析各基因座的等位基因頻率及單倍型多樣性,并結合目前國內(nèi)外已公開發(fā)表的其他13個群體相同基因座的單倍型資料,分析潮汕漢族群體的遺傳距離和聚類關系。結果 795名無關男性個體中共觀察到787種單倍型,其中779種單倍型為唯一單倍型,8種單倍型分別出現(xiàn)兩次。單倍型多樣性(HD)為0.999975,系統(tǒng)識別能力(DC)達到98.99%。27個Y-STR基因座基因多態(tài)性(GD)范圍為0.3637(DYS391)~0.9559(DYS385a/b);遺傳距離Rst矩陣分析發(fā)現(xiàn),潮汕漢族與廣東漢族之間的遺傳距離最近(0.0036),與甘肅藏族(0.0935)之間的遺傳距離相對較遠;基于遺傳距離所構建的多維尺度分析MDS圖與聚類分析結果基本相符。結論 Yfiler~?Plus試劑盒中包含的27個Y-STR基因座在潮汕漢族群體中具有豐富的遺傳多態(tài)性,對建立Y染色體數(shù)據(jù)庫,研究群體遺傳學和進行法醫(yī)學應用有重要意義。
[Abstract]:Objective to investigate the haplotype data of 27 Y-STR loci contained in the Yfiler~?Plus kit in Chaoshan Han male population, and to explore the population genetic relationship and forensic application value. Methods the peripheral blood samples of 795 unrelated individuals of Chaoshan Han nationality in Guangdong province were detected by Yfiler~?Plus kit. The allelic frequencies and haplotypes of each locus were statistically analyzed. The genetic distance and clustering relationship of Chaoshan Han population were analyzed based on the haplotypes of the same loci of other 13 populations published at home and abroad. Results A total of 787 haplotypes were observed in 795 unrelated male individuals, of which 779 haplotypes were unique haplotypes and 8 haplotypes appeared twice. The haplotype diversity (HD) was 0.999975, and the system recognition ability (DC) was 98.99.27 Y-STR loci polymorphic (GD) ranged from 0.3637 (DYS391) to 0.9559 (DYS385a/b). The genetic distance between Chaoshan Han and Guangdong Han was the closest (0.0036), and the genetic distance between Gansu Tibetan (0.0935) and Gansu Tibetan (0.0935) was relatively long, and the MDS map based on genetic distance was basically consistent with cluster analysis. Conclusion the 27 Y-STR loci contained in the Yfiler~?Plus kit have abundant genetic polymorphisms in Chaoshan Han population, which is of great significance for the establishment of Y chromosome database, the study of population genetics and the application of forensic medicine.
【作者單位】: 中國政法大學證據(jù)科學教育部重點實驗室司法文明協(xié)同創(chuàng)新中心;河南省許昌市公安局刑事科學技術研究所;
【基金】:國家自然科學基金(81671874) 中國政法大學研究生創(chuàng)新實踐項目(2015SSCX160)~~
【分類號】:D919

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