iTRAQ串聯(lián)質(zhì)譜篩選尾吊小鼠感染空間誘變大腸桿菌后脾臟差異表達(dá)蛋白
本文選題:iTRAQ + 模擬失重; 參考:《航天醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)工程》2017年04期
【摘要】:目的應(yīng)用同重同位素標(biāo)記相對(duì)與絕對(duì)定量技術(shù)(iTRAQ),聯(lián)合液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS),檢測(cè)經(jīng)空間誘變大腸桿菌(T1-13)感染尾吊模擬失重小鼠后,其脾臟組織中的差異蛋白,并探討其生物學(xué)意義。方法 C57BL/6小鼠尾吊模擬失重后以空間誘變大腸桿菌灌胃建立感染模型,采用iTRAQ結(jié)合LC-MS/MS技術(shù)篩選脾臟組織差異表達(dá)蛋白,并對(duì)差異蛋白進(jìn)行GO、pathway富集分析和STRING蛋白互作分析。結(jié)果共鑒定出2589個(gè)蛋白,尾吊組與對(duì)照組相比篩選出378個(gè)差異表達(dá)蛋白。尾吊染菌后與對(duì)照組相比,共篩選出452個(gè)差異表達(dá)蛋白,STRING蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中有286個(gè)差異蛋白間存在相互作用,這些差異蛋白經(jīng)KEGG分析共得到32條存在顯著性的通路,主要為氧化磷酸化通路,代謝通路、蛋白消化和吸收通路、蛋白酶體通路。結(jié)論成功篩選出了模擬失重后空間誘變大腸桿菌感染脾臟組織差異表達(dá)蛋白,這些差異蛋白可能通過(guò)調(diào)控代謝通路、不同環(huán)境下微生物代謝、頡氨酸/亮氨酸/異亮氨酸降解、溶酶體、碳代謝、吞噬體、丙酸代謝、蛋白酶體參與失重條件下免疫和炎癥反應(yīng)的發(fā)生。
[Abstract]:Objective to detect the differential proteins in spleen tissue of mice infected by space mutated Escherichia coli T1-13, using the relative and absolute quantitative techniques of iso-isotopic labeling and absolute quantification, combined with liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC-MS / MS), to detect the differential proteins in the spleen of simulated weightlessness mice infected by space mutated Escherichia coli T1-13. Its biological significance was also discussed. Methods after simulated weightlessness in C57BL/6 mice, the infection model was established by space induced Escherichia coli. The differential expression proteins in spleen were screened by iTRAQ and LC-MS/MS technique, and the differential proteins were analyzed by GOA pathway enrichment and STRING protein interaction. Results A total of 2589 proteins were identified and 378 differentially expressed proteins were screened between the tail suspension group and the control group. In comparison with the control group, 286 differentially expressed proteins were found to interact with each other in a total of 452 differentially expressed proteins (STRING) interaction networks, and 32 of the differentially expressed proteins were found to have significant transduction pathways by KEGG analysis. It mainly includes oxidative phosphorylation pathway, metabolic pathway, protein digestion and absorption pathway and proteasome pathway. Conclusion the differentially expressed proteins of splenic tissue induced by simulated weightlessness were successfully screened. These differentially expressed proteins may be mediated by metabolic pathways, microbial metabolism and degradation of antagonic acid / leucine / isoleucine in different environments. Lysosomes, carbon metabolism, phagocytosis, propionic acid metabolism, proteasome participate in immune and inflammatory reaction under weightlessness.
【作者單位】: 錦州醫(yī)科大學(xué);中國(guó)人民解放軍火箭軍總醫(yī)院;中國(guó)航天員科研訓(xùn)練中心航天醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)與應(yīng)用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;解放軍總醫(yī)院南樓呼吸科;
【基金】:國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展(973)計(jì)劃(2014CB744404)
【分類(lèi)號(hào)】:R852.22
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1776803
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