延邊地區(qū)朝鮮族12個X-STR基因座遺傳多態(tài)性
本文關(guān)鍵詞: X染色體 短串聯(lián)重復(fù)序列 遺傳多態(tài)性 延邊地區(qū)朝鮮族 出處:《延邊大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:目的:為了獲取延邊地區(qū)朝鮮族12個X-STR基因座(DXS7132、DXS7423、DXS8378、DXS10074、DXS10079、DXS10101、DXS10103、DXS10134、DXS10135、DXS10146、DXS10148和HPRTB)的等位基因頻率分布、基因型頻率分布、單倍型等相關(guān)群體遺傳多態(tài)性指標(biāo),確認法醫(yī)學(xué)應(yīng)用價值。為中國朝鮮族群體的親子鑒定、個人識別及群體遺傳學(xué)研究提供基礎(chǔ)資料。評估Investigator Argus X-12試劑盒在延邊朝鮮族群體X-STR基因座研究中的實用效能方法:采集延邊地區(qū)朝鮮族無關(guān)個332名(女176,男156)健康無關(guān)個體的靜脈血樣。采用 Chelex-100 試劑提取 DNA,應(yīng)用 Investigator Argus X-12試劑盒(QIAGEN)使用手冊中介紹的方法對12個X-STR基因座進行PCR擴增。用310基因分析儀進行毛細管電泳和等位基因的判讀。用Power Stats Software軟件進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析,獲取等位基因頻率、雜合度(heterozygosity,H)、個體識別力(power of discrimination,PD)、多態(tài)性信息含量(polymorphism information content,PIC)等;用Genalex6.5軟件對女性群體數(shù)據(jù)作基因型頻率的統(tǒng)計,并且進行Hardy-Weinberg平衡吻合度(p-value)檢驗;對男性群體檢測結(jié)果,用Arlequin軟件進行單倍型多樣性(haplotype diversity,HD)統(tǒng)計,用P0PTREE2軟件進行群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù)的分析。結(jié)果:在延邊朝鮮族12個X-STR基因座上分別檢出6、6、7、19、9、18、25、4、20、9、5和23個等位基因,多態(tài)性信息含量分布為0.4306-0.9139;雜合度分布為0.5511-0.9318,除了 DXS7423之外均顯示為較高的遺傳特性。其中176名女性群體,觀測雜合度均大于0.5511,多態(tài)信息含量均大于0.4306,個人識別力均大于0.6667,除了多等位基因的DXS10134,DXS10135,DXS10148基因座外其余9個基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05);在男性群體,156名不同個體中檢測到155種單倍型,其中最多見的單倍型為16-10-15-39-17-32-21-14-27-19-14-20,單倍型多樣性為 0.9999。群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù)顯示,延邊朝鮮族與韓國人之間的遺傳距離最小,為0.004,與中部克羅地亞人遺傳距離最遠,為0.042。結(jié)論:12個X-STR基因座除DXS7423均顯示為較高的遺傳統(tǒng)計數(shù)據(jù),適合中國朝鮮族群體法醫(yī)學(xué)鑒定和群體遺傳學(xué)研究。本研究結(jié)果可為中國朝鮮族群體的親子鑒定、個人識別及群體遺傳學(xué)研究提供基礎(chǔ)資料。Investigator Argus X-12試劑盒在中國延邊地區(qū)朝鮮族人群12個X-STR基因座的遺傳多態(tài)性研究中,具有較高的實際應(yīng)用效能,該試劑盒可用于群體遺傳學(xué)、法醫(yī)學(xué)等相關(guān)領(lǐng)域
[Abstract]:Objective: to obtain 12 X-STR gene loci DXS7132DXS7423DXS8378DXS10074 DXS10079 from Korean nationality in Yanbian area. The allele frequency distribution of DXS10101 (DXS10103), DXS10134 (DXS10135), DXS10146 (DXS10148) and HPRTB. Genotypic frequency distribution, haplotype and other related population genetic polymorphism indicators, confirmed the value of forensic medicine, for Chinese Korean population paternity test. Provision of basic information for personal identification and population genetics research. Evaluation of Investigator Argus. The effectiveness of X-12 Kit in the study of X-STR Loci in Yanbian Korean population: 332 unrelated Korean population in Yanbian area (. Female 176. Chelex-100 reagent was used to extract DNA. Application of Investigator Argus X-12 Kit to QIAGEN. 12 X-STR loci were amplified by PCR using the method described in the manual. Capillary electrophoresis and allele interpretation using 310 gene analyzer. Power Stats. The data were analyzed by Software software. The frequency of alleles, heterozygosity of heterozygosity, and individual recognition power of discrimination were obtained. Polymorphic information content (information) and polymorphic information content (information); Genalex6.5 software was used to analyze the genotype frequency of female population data, and the Hardy-Weinberg equilibrium coincidence degree and p-valuetest were performed. The results of male population test were analyzed by Arlequin software. The population genetic data were analyzed by P0PTREE2 software. Results: the results showed that there were 6 X STR loci in 12 X-STR loci in Yanbian Korean nationality. The distribution of polymorphism information content was 0.4306-0.9139. The heterozygosity distribution was 0.5511-0.9318.The heterozygosity was higher than 0.5511 in 176 female populations except DXS7423. The polymorphic information content was greater than 0.4306, and the individual recognition power was higher than 0.6667, except for the polyallele DXS10134and DXS10135. The other 9 genotypes in the DXS10148 locus were all in accordance with the Hardy-Weinberg equilibrium law (P0.05A). 155 haplotypes were detected in 156 different individuals from male population. The most common haplotypes were 16-10-15-39-17-32-21-14-27-19-14-20. The diversity of haplotypes was 0.99999.The genetic data showed that the genetic distance between Korean and Korean was the smallest (0.004), and the genetic distance was the furthest from central Croat. Conclusion: all the 12 X-STR loci showed high genetic statistics except DXS7423. It is suitable for forensic identification and population genetics study of Korean population in China. The results of this study can be used for paternity identification of Korean population in China. Personal Identification and population Genetics Research provides basic data .Investigator Argus. The X-12 kit was used to study the genetic polymorphism of 12 X-STR loci in the Korean population in Yanbian area of China. The kit can be used in population genetics, forensic medicine and other related fields.
【學(xué)位授予單位】:延邊大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:D919
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,本文編號:1456512
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