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廣東地區(qū)漢族人群VEGF基因5′端SNP位點遺傳多態(tài)性

發(fā)布時間:2017-12-13 19:31

  本文關鍵詞:廣東地區(qū)漢族人群VEGF基因5′端SNP位點遺傳多態(tài)性


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【摘要】:目的調(diào)查廣東地區(qū)漢族人群VEGF基因5′端SNP位點的遺傳多態(tài)性,為法醫(yī)學應用及群體遺傳學研究提供基礎數(shù)據(jù)。方法 DNA微測序技術SNaPshot分析184例廣東地區(qū)無關個體VEGF基因5′端4個SNP位點(rs699947、rs1570360、rs833061、rs2010963)的遺傳多態(tài)性。應用PowerMarker v3.25軟件進行統(tǒng)計分析。結(jié)果 184例廣東地區(qū)漢族無關個體VEGF基因5′端4個SNP位點基因分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05),每個位點均檢出3種基因型。rs833061和rs699947位點緊密連鎖。共檢出6種單倍型,其中C-G-T-C、C-G-T-G、A-A-C-G、A-G-C-G頻率均10%,為主要單倍型。rs699947、rs833061、rs2010963位點的個人識別率為0.583~0.634,非父排除率為0.133~0.144;4個SNP構成單倍型的個人識別率為0.868,非父排除率為0.438。結(jié)論廣東地區(qū)漢族人群VEGF基因5′端序列呈現(xiàn)出高度遺傳多態(tài)性,可作為個人識別和親權鑒定的遺傳學指標,同時可用于相關疾病關聯(lián)分析。
【作者單位】: 廣州醫(yī)科大學附屬第三醫(yī)院法醫(yī)物證司法鑒定所廣東省產(chǎn)科重大疾病重點實驗室;
【基金】:上海市法醫(yī)學重點實驗室開放課題資助項目(KF1305) 廣東省省級科技計劃項目(2013B022000023)
【分類號】:D919
【正文快照】: 血管內(nèi)皮生長因子(vascular endothelial growthfactor,VEGF)是血管內(nèi)皮細胞特異性的肝素結(jié)合生長因子,可在體內(nèi)誘導血管新生[1-2]。VEGF屬血小板源生長因子超家族,目前主要包括VEGF-A、胎盤生長因子、VEGF-B、VEGF-C、VEGF-D和VEGF-E[3]。VEGF基因位于6p21.3,啟動子區(qū)及5′非

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