廣東地區(qū)漢族人群VEGF基因5′端SNP位點(diǎn)遺傳多態(tài)性
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【摘要】:目的調(diào)查廣東地區(qū)漢族人群VEGF基因5′端SNP位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性,為法醫(yī)學(xué)應(yīng)用及群體遺傳學(xué)研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。方法 DNA微測序技術(shù)SNaPshot分析184例廣東地區(qū)無關(guān)個(gè)體VEGF基因5′端4個(gè)SNP位點(diǎn)(rs699947、rs1570360、rs833061、rs2010963)的遺傳多態(tài)性。應(yīng)用PowerMarker v3.25軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。結(jié)果 184例廣東地區(qū)漢族無關(guān)個(gè)體VEGF基因5′端4個(gè)SNP位點(diǎn)基因分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05),每個(gè)位點(diǎn)均檢出3種基因型。rs833061和rs699947位點(diǎn)緊密連鎖。共檢出6種單倍型,其中C-G-T-C、C-G-T-G、A-A-C-G、A-G-C-G頻率均10%,為主要單倍型。rs699947、rs833061、rs2010963位點(diǎn)的個(gè)人識(shí)別率為0.583~0.634,非父排除率為0.133~0.144;4個(gè)SNP構(gòu)成單倍型的個(gè)人識(shí)別率為0.868,非父排除率為0.438。結(jié)論廣東地區(qū)漢族人群VEGF基因5′端序列呈現(xiàn)出高度遺傳多態(tài)性,可作為個(gè)人識(shí)別和親權(quán)鑒定的遺傳學(xué)指標(biāo),同時(shí)可用于相關(guān)疾病關(guān)聯(lián)分析。
【作者單位】: 廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第三醫(yī)院法醫(yī)物證司法鑒定所廣東省產(chǎn)科重大疾病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:上海市法醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題資助項(xiàng)目(KF1305) 廣東省省級(jí)科技計(jì)劃項(xiàng)目(2013B022000023)
【分類號(hào)】:D919
【正文快照】: 血管內(nèi)皮生長因子(vascular endothelial growthfactor,VEGF)是血管內(nèi)皮細(xì)胞特異性的肝素結(jié)合生長因子,可在體內(nèi)誘導(dǎo)血管新生[1-2]。VEGF屬血小板源生長因子超家族,目前主要包括VEGF-A、胎盤生長因子、VEGF-B、VEGF-C、VEGF-D和VEGF-E[3]。VEGF基因位于6p21.3,啟動(dòng)子區(qū)及5′非
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