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上海市臨床鼠傷寒沙門氏菌耐藥性和食品載體溯源研究

發(fā)布時(shí)間:2017-09-29 12:10

  本文關(guān)鍵詞:上海市臨床鼠傷寒沙門氏菌耐藥性和食品載體溯源研究


  更多相關(guān)文章: 鼠傷寒沙門氏菌 藥敏性 耐藥基因 脈沖凝膠電泳(PFGE) 基因分型


【摘要】:研究了分離于2008年至2012年上海市腹瀉病人和依據(jù)問診信息在疾病爆發(fā)地或患者所在社區(qū)的不同零售食品和環(huán)境中鼠傷寒沙門氏菌的藥敏性、I類整合子和部分相關(guān)耐藥基因的攜帶等基本特性,進(jìn)行了產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(Extended Spectrumβ-lactmases,ESBLs)菌株的篩選及ESBLs基因亞型的確定,同時(shí)進(jìn)行了基于脈沖場凝膠電泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis,PFGE)的基因型研究,揭示了不同來源鼠傷寒沙門氏菌的分子流行病學(xué)特征,在分子水平上探討了臨床患者源沙門菌和同一時(shí)間段在沙門氏菌爆發(fā)地區(qū)或者患者所在社區(qū)分離的不同食品源菌株間的內(nèi)在聯(lián)系,探尋了引發(fā)食源性疾病爆發(fā)的沙門氏菌及其食品載體。主要結(jié)論如下:(1)使用臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)(the Clinical Laboratory Standard Institue,CLSI)推薦的瓊脂稀釋法測定沙門氏菌的藥敏性,145株鼠傷寒沙門氏菌對(duì)磺胺異惡唑耐藥率為100%,98(67.6%)株菌對(duì)萘啶酮酸產(chǎn)生抗性,對(duì)頭孢噻呋、氨芐西林、鏈霉素、四環(huán)素、慶大霉素、甲氧芐氨嘧啶-磺胺甲惡唑、卡那霉素、阿莫西林-克拉維酸和氯霉素產(chǎn)生抗性的菌株的比例分別為49.0%、47.6%、46.2%、45.5%、35.2%、32.4%、31.7%、27.6%和27.6%。有2株菌分別對(duì)環(huán)丙沙星和左氧氟沙星產(chǎn)生抗性。臨床鼠傷寒沙門氏菌和食源性鼠傷寒沙門氏菌對(duì)萘啶酮酸、氨芐西林、阿莫西林-克拉維酸、頭孢噻呋、頭孢曲松、氯霉素、慶大霉素、卡那霉素、鏈霉素、四環(huán)素、磺胺異惡唑和甲氧芐氨嘧啶-磺胺甲惡唑的耐藥率之間無顯著性差異(P0.05)。114(78.6%)株鼠傷寒沙門氏菌可耐至少3種抗生素,52(35.9%)株可耐至少7種抗生素。(2)145株沙門氏菌中,59(40.7%)株菌株攜帶aac(6′)-Ib基因,oqxAB、qnrS、qnrA和qnrB基因分別在42(30.0%)、12(8.3%)、11(7.6%)和8株(5.5%)菌株中檢出,未檢出qepA基因。qnrA、qnrB、qnrS、aac(6′)-Ib和oqxAB基因檢出率在臨床和食品源沙門氏菌間無顯著性差異(P0.05)。3株分別來源于病人、豬肉和鴨肉的沙門氏菌的gyr A基因發(fā)生突變,突變氨基酸類型為Asp87Asn(n=2)和Asp87Tyr(n=1);parC基因未發(fā)現(xiàn)突變。17株沙門氏菌被檢出攜帶Ⅰ類整合子,14株的Ⅰ類整合子大小是1.6 kb,3株整合子大小是2.0 kb。在其中15株攜帶的整合子中檢出耐藥基因盒aadA2,2株臨床菌的Ⅰ類整合子分別攜帶耐藥基因盒dfrA12-aadA2和aadA1。另外,檢出5株菌產(chǎn)生超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(ESBLs)。在3株菌株檢出ESBLs編碼基因blaOXA,2株分離于鴨肉和牛肉中菌株同時(shí)檢出blaTEM-blaOXA基因。(3)使用脈沖場凝膠電泳(PFGE)方法對(duì)菌株基因分型后,145株不同來源的鼠傷寒沙門氏菌總體上呈現(xiàn)為基因型的多樣性。分離于豬肉、雞肉和鴨肉的菌株與臨床菌株的基因型具有較高的一致性,3株豬源性鼠傷寒沙門氏菌與4株臨床菌株的PFGE基因型圖譜相似度達(dá)到100%,1株雞肉源性鼠傷寒沙門氏菌與1株臨床菌株的PFGE指紋圖譜相似度達(dá)到100%,部分鴨肉源菌株和雞肉、豬肉、臨床菌株具有高度相關(guān)的同源性。研究表明零售豬肉、雞肉和鴨肉很可能是導(dǎo)致人類食源性沙門氏菌爆發(fā)的食物載體,在處理豬肉、雞肉和鴨肉的過程中,需要采取必要的預(yù)防措施,來減少沙門氏菌感染的風(fēng)險(xiǎn)。
【關(guān)鍵詞】:鼠傷寒沙門氏菌 藥敏性 耐藥基因 脈沖凝膠電泳(PFGE) 基因分型
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R155.3
【目錄】:
  • 摘要5-7
  • ABSTRACT7-11
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述11-17
  • 1.1 沙門氏菌及其污染和傳播11-12
  • 1.2 沙門氏菌的耐藥情況12-13
  • 1.3 國內(nèi)外沙門氏菌耐藥機(jī)理研究進(jìn)展13-14
  • 1.3.1 抗生素靶位基因的突變13
  • 1.3.2 質(zhì)粒介導(dǎo)的沙門氏菌的耐藥性13-14
  • 1.3.3 整合子介導(dǎo)的沙門氏菌的耐藥性14
  • 1.4 PFGE分型技術(shù)在病原菌分型中的應(yīng)用14-15
  • 1.5 國內(nèi)外沙門氏菌分子流行病學(xué)研究進(jìn)展15-16
  • 1.6 研究目的與意義16-17
  • 第二章 鼠傷寒沙門氏菌藥敏性研究17-25
  • 2.1 材料與方法17-19
  • 2.1.1 材料17-18
  • 2.1.2 方法18-19
  • 2.2 結(jié)果與分析19-21
  • 2.3 討論21-23
  • 2.4 小結(jié)23-25
  • 第三章 鼠傷寒沙門氏菌耐藥相關(guān)基因的檢測25-32
  • 3.1 材料與方法25-27
  • 3.1.1 材料25-26
  • 3.1.2 方法26-27
  • 3.2 結(jié)果與分析27-29
  • 3.3 討論29-30
  • 3.4 小結(jié)30-32
  • 第四章 鼠傷寒沙門氏菌基于脈沖場凝膠電泳(PFGE)的基因型研究32-40
  • 4.1 材料與方法32-34
  • 4.1.1 材料32
  • 4.1.2 方法32-34
  • 4.2 結(jié)果與分析34-37
  • 4.3 討論37-39
  • 4.4 小結(jié)39-40
  • 第五章 結(jié)論與創(chuàng)新40-42
  • 5.1 結(jié)論40-41
  • 5.2 創(chuàng)新41-42
  • 參考文獻(xiàn)42-50
  • 致謝50-51
  • 作者簡介51

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8 朱森林;陳e,

本文編號(hào):941920


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