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大鼠煙氣亞慢性暴露的蛋白水平差異表達(dá)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-08-15 19:09

  本文關(guān)鍵詞:大鼠煙氣亞慢性暴露的蛋白水平差異表達(dá)研究


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【摘要】:[目的]本研究主要通過(guò)構(gòu)建亞慢性暴露的大鼠模型來(lái)探究吸煙等因素對(duì)機(jī)體的影響,尤其是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)表達(dá)水平的變化。[方法]首先采用160只Wistar大鼠構(gòu)建煙氣染毒模型,將實(shí)驗(yàn)大鼠隨機(jī)分成10%香煙煙氣濃度的低劑量組、20%煙氣濃度的中劑量組、60%煙氣濃度的高劑量組和對(duì)照組,染毒周期分別為3個(gè)月和6個(gè)月。然后分離大鼠的肺組織并將大鼠肺癌組織中蛋白質(zhì)胰酶處理后進(jìn)行蛋白質(zhì)篩選和鑒定,iTRAQ進(jìn)行定量分析,對(duì)照組(CM)、低劑量染毒組(LM)、中劑量染毒組(MM)、高劑量染毒組(HM),所提取的蛋白質(zhì)樣品經(jīng)FASP酶解、iTRAQ試劑標(biāo)記、高pHRPLC分離、RPLC-MS分離分析,獲取的串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)通過(guò)軟件搜庫(kù)進(jìn)行鑒定。[結(jié)果]成功構(gòu)建了大鼠的煙氣亞慢性暴露模型,在通過(guò)質(zhì)譜分析的數(shù)據(jù)中共收集到340258個(gè)光譜、19094個(gè)多肽和4483個(gè)蛋白。并根據(jù)肽段分子量的大小進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分布的分析。通過(guò)蛋白的定量分析發(fā)現(xiàn),不同劑量組之間的蛋白在表達(dá)水平的上有明顯的差異。通過(guò)對(duì)蛋白進(jìn)行聚類(lèi)分析發(fā)現(xiàn),和對(duì)照組相比,3個(gè)染毒組樣本的上調(diào)或者下調(diào)有一定的劑量依賴(lài)性。G0功能的注釋聚類(lèi)分析發(fā)現(xiàn),蛋白質(zhì)主要集中在三個(gè)方面:分子功能、細(xì)胞位置、生物過(guò)程等;而COG的注釋分析發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)可以被歸為26個(gè)簇中。通過(guò)KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行通路富集分析發(fā)現(xiàn),3個(gè)不同劑量組與對(duì)照組相比,在不同數(shù)量的信號(hào)通路有明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。[結(jié)論]論文首先對(duì)Wistar大鼠進(jìn)行構(gòu)建煙氣亞慢性模型,分為三個(gè)劑量組和對(duì)照組,構(gòu)建成功后取大鼠的肺組織,分離提取蛋白質(zhì),進(jìn)行蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析。通過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析發(fā)現(xiàn),和對(duì)照組相比,三個(gè)不同劑量組的蛋白質(zhì)有明顯的差異性表達(dá)。這些差異蛋白質(zhì)在功能上主要涉及到蛋白質(zhì)代謝、PPAR信號(hào)通路,這些差異性的蛋白除了會(huì)影響肺部疾病之外,還影響到肥大性心肌病、擴(kuò)張性心肌病、心肌收縮等,同時(shí)我們的研究還發(fā)現(xiàn),這些蛋白質(zhì)的差異存在一定程度上的依賴(lài)性。此蛋白質(zhì)質(zhì)譜方面的研究吸煙誘發(fā)的肺部疾病的機(jī)制方面的探索提供新的線(xiàn)索,同時(shí)也為尋找相關(guān)的腫瘤標(biāo)志物提供重要的研究基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
【關(guān)鍵詞】:大鼠模型 香煙煙氣 蛋白質(zhì)組學(xué)
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:R114
【目錄】:
  • 中文摘要4-6
  • Abstract6-9
  • 引言9-11
  • 第一部分 大鼠煙氣亞慢性暴露大鼠模型構(gòu)建11-14
  • 前言11
  • 1. 材料與方法11-13
  • 2. 結(jié)果13
  • 3. 論論13-14
  • 第二部分 煙氣亞慢性暴露大鼠肺部的蛋白質(zhì)組學(xué)分析14-23
  • 前言14
  • 1. 材料與方法14-17
  • 2. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果17-21
  • 3. 討論21-23
  • 參考文獻(xiàn)23-28
  • 綜述28-43
  • 參考文獻(xiàn)37-43
  • 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的論文43-44
  • 致謝44

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本文編號(hào):679805


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