大鼠煙氣亞慢性暴露的蛋白水平差異表達研究
本文關鍵詞:大鼠煙氣亞慢性暴露的蛋白水平差異表達研究
【摘要】:[目的]本研究主要通過構建亞慢性暴露的大鼠模型來探究吸煙等因素對機體的影響,尤其是研究體內蛋白質表達水平的變化。[方法]首先采用160只Wistar大鼠構建煙氣染毒模型,將實驗大鼠隨機分成10%香煙煙氣濃度的低劑量組、20%煙氣濃度的中劑量組、60%煙氣濃度的高劑量組和對照組,染毒周期分別為3個月和6個月。然后分離大鼠的肺組織并將大鼠肺癌組織中蛋白質胰酶處理后進行蛋白質篩選和鑒定,iTRAQ進行定量分析,對照組(CM)、低劑量染毒組(LM)、中劑量染毒組(MM)、高劑量染毒組(HM),所提取的蛋白質樣品經(jīng)FASP酶解、iTRAQ試劑標記、高pHRPLC分離、RPLC-MS分離分析,獲取的串聯(lián)質譜數(shù)據(jù)通過軟件搜庫進行鑒定。[結果]成功構建了大鼠的煙氣亞慢性暴露模型,在通過質譜分析的數(shù)據(jù)中共收集到340258個光譜、19094個多肽和4483個蛋白。并根據(jù)肽段分子量的大小進行了統(tǒng)計分布的分析。通過蛋白的定量分析發(fā)現(xiàn),不同劑量組之間的蛋白在表達水平的上有明顯的差異。通過對蛋白進行聚類分析發(fā)現(xiàn),和對照組相比,3個染毒組樣本的上調或者下調有一定的劑量依賴性。G0功能的注釋聚類分析發(fā)現(xiàn),蛋白質主要集中在三個方面:分子功能、細胞位置、生物過程等;而COG的注釋分析發(fā)現(xiàn)蛋白質可以被歸為26個簇中。通過KEGG數(shù)據(jù)庫進行通路富集分析發(fā)現(xiàn),3個不同劑量組與對照組相比,在不同數(shù)量的信號通路有明顯的統(tǒng)計學意義。[結論]論文首先對Wistar大鼠進行構建煙氣亞慢性模型,分為三個劑量組和對照組,構建成功后取大鼠的肺組織,分離提取蛋白質,進行蛋白質質譜分析。通過統(tǒng)計學分析發(fā)現(xiàn),和對照組相比,三個不同劑量組的蛋白質有明顯的差異性表達。這些差異蛋白質在功能上主要涉及到蛋白質代謝、PPAR信號通路,這些差異性的蛋白除了會影響肺部疾病之外,還影響到肥大性心肌病、擴張性心肌病、心肌收縮等,同時我們的研究還發(fā)現(xiàn),這些蛋白質的差異存在一定程度上的依賴性。此蛋白質質譜方面的研究吸煙誘發(fā)的肺部疾病的機制方面的探索提供新的線索,同時也為尋找相關的腫瘤標志物提供重要的研究基礎數(shù)據(jù)。
【關鍵詞】:大鼠模型 香煙煙氣 蛋白質組學
【學位授予單位】:蘇州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R114
【目錄】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-9
- 引言9-11
- 第一部分 大鼠煙氣亞慢性暴露大鼠模型構建11-14
- 前言11
- 1. 材料與方法11-13
- 2. 結果13
- 3. 論論13-14
- 第二部分 煙氣亞慢性暴露大鼠肺部的蛋白質組學分析14-23
- 前言14
- 1. 材料與方法14-17
- 2. 實驗結果17-21
- 3. 討論21-23
- 參考文獻23-28
- 綜述28-43
- 參考文獻37-43
- 攻讀學位期間發(fā)表的論文43-44
- 致謝44
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本文編號:679805
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