銅綠假單胞桿菌核酸傳感器及邏輯門(mén)的研究
本文關(guān)鍵詞:銅綠假單胞桿菌核酸傳感器及邏輯門(mén)的研究
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【摘要】:銅綠假單胞桿菌造成的污染問(wèn)題日趨嚴(yán)重,而傳統(tǒng)培養(yǎng)基培養(yǎng)和PCR檢測(cè)銅綠假單胞桿菌的方法所需時(shí)間長(zhǎng)、操作復(fù)雜,不能滿足現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)的要求。因此,尋求更加經(jīng)濟(jì)高效的檢測(cè)方法非常有必要。本研究針對(duì)銅綠假單胞桿菌的內(nèi)標(biāo)及毒素基因進(jìn)行引物設(shè)計(jì)篩選,并通過(guò)多重LAMP反應(yīng)和膠體金核酸傳感器結(jié)合對(duì)銅綠假單胞桿菌及其毒素進(jìn)行多重檢測(cè)。系統(tǒng)優(yōu)化后該方法可以在50分鐘內(nèi)不依賴復(fù)雜的大型儀器對(duì)銅綠假單胞桿菌及其毒素進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)限為20 CFU/mL,比PCR檢測(cè)技術(shù)更靈敏。同時(shí),將本研究開(kāi)發(fā)的方法應(yīng)用于分子邏輯門(mén),并進(jìn)行自然界水體的實(shí)際樣品檢測(cè)。本研究結(jié)果如下:1.建立銅綠假單胞桿菌及其毒素的等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)方法。篩選出針對(duì)銅綠假單胞桿菌兩種重要的外毒素基因和內(nèi)標(biāo)基因的特異性引物用于LAMP方法,結(jié)果證實(shí)該方法可以用來(lái)在突發(fā)情況下或者常規(guī)監(jiān)測(cè)研究中,鑒定飲用水和環(huán)境中銅綠假單胞桿菌外毒素的存在性,以判斷其毒性潛力和調(diào)查其致病性。2.建立了多重LAMP與膠體金核酸傳感器結(jié)合同時(shí)檢測(cè)多種基因的方法。將已篩選出的針對(duì)銅綠假單胞桿菌兩種重要的外毒素基因和內(nèi)標(biāo)基因的特異性引物應(yīng)用于多重LAMP體系,結(jié)合膠體金核酸傳感器檢測(cè),驗(yàn)證了該方法的可行性,并對(duì)傳感器的制備進(jìn)行優(yōu)化以提高檢測(cè)性能,最終達(dá)到現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)的目的。3. 建立多重膠體金核酸傳感器邏輯門(mén)。應(yīng)用已建立的多重LAMP與膠體金核酸傳感器結(jié)合同時(shí)檢測(cè)多種基因的方法,以銅綠假單胞桿菌內(nèi)標(biāo)基因及兩種毒素基因DNA為輸入條件,以膠體金核酸傳感器的紅色條帶信號(hào)為輸出,建立了YES、AND、OR、INHIBIT、NOR邏輯門(mén);應(yīng)用所建立的多重膠體金核酸傳感器OR邏輯門(mén),對(duì)飲用水進(jìn)行銅綠假單胞桿菌及其毒素基因的檢測(cè)。
【關(guān)鍵詞】:銅綠假單胞桿菌 毒素基因 多重LAMP 核酸傳感器 邏輯門(mén) 現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:R123.1;TP212
【目錄】:
- 摘要4-5
- Abstract5-6
- 主要儀器設(shè)備表6-7
- 縮略詞表7-10
- 第一章 緒論10-27
- 1.1 食品微生物安全現(xiàn)狀10-11
- 1.2 食品微生物檢測(cè)技術(shù)的研究概況11-20
- 1.2.1 微生物傳統(tǒng)檢測(cè)技術(shù)11
- 1.2.2 微生物試紙片檢測(cè)技術(shù)11-12
- 1.2.3 微生物代謝物檢測(cè)技術(shù)12-13
- 1.2.4 微生物免疫學(xué)檢測(cè)技術(shù)13-14
- 1.2.5 微生物DNA檢測(cè)技術(shù)14-18
- 1.2.6 微生物傳感器檢測(cè)技術(shù)18-20
- 1.3 銅綠假單胞桿菌污染及檢測(cè)現(xiàn)狀20-26
- 1.3.1 銅綠假單胞桿菌風(fēng)險(xiǎn)因子的研究21
- 1.3.2 銅綠假單胞桿菌感染機(jī)制途徑與癥狀21-22
- 1.3.3 銅綠假單胞桿菌耐藥性相關(guān)研究22-23
- 1.3.4 銅綠假單胞桿菌污染情況23-24
- 1.3.5 國(guó)內(nèi)外銅綠假單胞桿菌檢測(cè)方法的研究進(jìn)展24-26
- 1.4 研究目的和研究?jī)?nèi)容26-27
- 1.4.1 研究目的26
- 1.4.2 研究?jī)?nèi)容26-27
- 第二章 銅綠假單胞桿菌及其毒素的LAMP檢測(cè)方法的研究27-36
- 2.1 材料與試劑27-29
- 2.1.1 菌株27
- 2.1.2 主要試劑及配制27-29
- 2.2 實(shí)驗(yàn)方法29-32
- 2.2.1 微生物培養(yǎng)29
- 2.2.2 環(huán)境及飲用水中銅綠假單胞桿菌的分離及生化鑒定29-30
- 2.2.3 細(xì)菌基因組DNA的提取30-31
- 2.2.4 引物設(shè)計(jì)31
- 2.2.5 銅綠假單胞桿菌基因組的擴(kuò)增31-32
- 2.3 結(jié)果與分析32-35
- 2.3.1 銅綠假單胞桿菌基因組DNA的提取33
- 2.3.2 引物的驗(yàn)證33-34
- 2.3.3 引物特異性驗(yàn)證34
- 2.3.4 銅綠假單胞桿菌及非銅綠假單胞桿菌外毒素基因的LAMP檢測(cè)34
- 2.3.5 飲用水及環(huán)境樣本中銅綠假單胞桿菌外毒素基因的LAMP檢測(cè)34-35
- 2.4 討論35-36
- 第三章 多重LAMP與膠體金核酸傳感器結(jié)合的檢測(cè)方法的建立36-48
- 3.1 材料與試劑36-38
- 3.1.1 試劑與耗材36-37
- 3.1.2 試劑及引物37
- 3.1.3 相關(guān)溶液配置37-38
- 3.2 實(shí)驗(yàn)方法38-40
- 3.2.1 基因組的提取與擴(kuò)增38-39
- 3.2.2 核酸傳感器的制備39-40
- 3.2.3 銅綠假單胞桿菌內(nèi)標(biāo)基因及毒素基因的多重檢測(cè)40
- 3.3 結(jié)果與分析40-47
- 3.3.1 多重LAMP與核酸傳感器結(jié)合的方法建立40-43
- 3.3.2 核酸傳感器的優(yōu)化43-45
- 3.3.3 核酸傳感器性能檢測(cè)45-47
- 3.4 討論47-48
- 第四章 銅綠假單胞桿菌及其毒素膠體金核酸傳感器邏輯門(mén)的建立48-60
- 4.1 材料與試劑48-49
- 4.1.1 試劑與耗材48
- 4.1.2 儀器與器材48
- 4.1.3 相關(guān)溶液配置48-49
- 4.2 實(shí)驗(yàn)方法49-50
- 4.2.1 基因組的提取與擴(kuò)增49-50
- 4.2.2 核酸傳感器的制備50
- 4.3 結(jié)果與分析50-59
- 4.3.1 邏輯門(mén)的實(shí)驗(yàn)原理50-58
- 4.3.2 OR邏輯門(mén)在飲用水樣本中銅綠假單胞桿菌外毒素基因檢測(cè)中的應(yīng)用58-59
- 4.4 討論59-60
- 第五章 結(jié)論與展望60-62
- 參考文獻(xiàn)62-67
- 致謝67-68
- 個(gè)人簡(jiǎn)介68
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,本文編號(hào):670807
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