深圳地區(qū)環(huán)境水體和人群中諾如病毒監(jiān)測與分析
發(fā)布時間:2017-08-12 21:06
本文關(guān)鍵詞:深圳地區(qū)環(huán)境水體和人群中諾如病毒監(jiān)測與分析
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【摘要】:【目的】檢測深圳地區(qū)環(huán)境水體和人群的諾如病毒(No Vs),探討其是否在兩者之間循環(huán)傳播!痉椒ā2014年3月至2015年2月檢測24份深圳茅洲河河水標本和287份腹瀉患者糞便標本。河水標本經(jīng)過混合纖維素酯膜和PEG法二次濃縮后提取核酸,糞便標本無需濃縮,稀釋離心后直接提取核酸。應用實時熒光逆轉(zhuǎn)錄PCR初步分型,RT-PCR擴增ORF2保守區(qū)域衣殼蛋白(VP1)基因后測序確定亞型、分析不同來源病毒的同源性;同時建立基因進化樹,進一步分析不同來源No Vs的親緣關(guān)系!窘Y(jié)果】在河水標本和腹瀉患者糞便標本中,No Vs陽性率分別為23.1%和17.4%,其中上下游河水標本陽性率分別為8.3%和41.7%,河水中No VGI型和No VGII型的陽性率為16.7%和8.3%。擴增陽性樣本發(fā)現(xiàn)茅洲河水中檢出No V主要是GI.6型,其次是GII.4 Sydney_2012型,而從腹瀉胃腸炎患者糞便標本中檢出No Vs主要是No VGII.4Sydney_2012型和少量的GII.3型。同時期水體和人群糞便標本來源的No VGII.4 Sydney_2012型VP1基因相似性98.2% 100.0%!窘Y(jié)論】No VGII.4 Sydney_2012型是深圳地區(qū)主要的流行株。No Vs在環(huán)境水體和人群中于某種程度上存在循環(huán)傳播。
【作者單位】: 華中科技大學同濟醫(yī)學院公共衛(wèi)生學院;深圳市光明新區(qū)疾病預防控制中心;深圳市疾病預防控制中心;
【關(guān)鍵詞】: 諾如病毒 環(huán)境水體 人群
【基金】:深圳市國家科技重大專項項目(No.GJHS20120628150935034)~~
【分類號】:R512.5;R181.3
【正文快照】: 諾如病毒(Noroviruses,No Vs)屬于杯狀病毒科、諾如病毒屬的非包膜單正鏈RNA(7.5-7.7 kb)病毒,其RNA由3個開放閱讀框(ORFs)組成[1]。根據(jù)由ORF2編碼的VP1氨基酸相似程度,將其分為以下6個基因組(Genogroup):GI、GII、GIII、GIV、GV和GVI,主要感染人的GI和GII又分別被分為9個和2
【相似文獻】
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1 吳立夢;林慶能;王文靜;許慧慧;張曦;;環(huán)境水體中感染性胃腸道病毒檢測方法研究進展[J];環(huán)境與職業(yè)醫(yī)學;2014年06期
2 徐雪華;滕登林;張乃杰;;萊州市2005年外環(huán)境水體霍亂監(jiān)測情況[J];中華預防醫(yī)學雜志;2006年05期
3 ;[J];;年期
,本文編號:663609
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