中國北方人群阿爾茨海默病易感基因的分子流行病學(xué)研究
本文關(guān)鍵詞:中國北方人群阿爾茨海默病易感基因的分子流行病學(xué)研究
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【摘要】:目的探索八個基因的變異在中國北方人群阿爾茨海默病中的分子流行病學(xué)特征。 方法經(jīng)文獻(xiàn)檢索和生物信息學(xué)研究分析,將歐美和日本人群中部分阿爾茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的易感SNPs位點(diǎn)確定為在北京人群中復(fù)制的候選位點(diǎn),選取8個基因的12個SNPs,分別是CR1(rs3818361, rs6656401)、SORCS3(rs10786828,rs7894737)、 FRMD4A (rs2446581)、 KCNMA1(rs16934131)、 SORL1(rs6589885,rs3781834)、PICALM (rs10792832, rs561655)、NTF3(rs6332)、AR (rs139374285)。通過病例-對照設(shè)計,使用PCR-HRM技術(shù)進(jìn)行基因分型并結(jié)合測序驗(yàn)證基因分型結(jié)果,對選自北京人群的250例AD患者和438例正常對照12個SNPs進(jìn)行基因分型檢測。比較各SNP基因型與等位基因在病例和對照組間的分布頻率,在不同遺傳模型中的基因型分布情況,確定可能與北京人群AD發(fā)生關(guān)聯(lián)的變異位點(diǎn)。通過累積效應(yīng)分析及采用廣義多因子降維法(GMDR)進(jìn)行基因-基因交互作用分析以期了解AD發(fā)生的遺傳流行病學(xué)病因。通過ApoE基因分層分析各關(guān)聯(lián)位點(diǎn)與其危險基因型是否有關(guān)。 結(jié)果1)CR1SNP rs3818361等位基因和基因型在病例和對照組間的分布均有顯著性差異(P=0.007,OR=1.374,,95%CI:1.090-1.733; P=2.3×10-6),等位基因G在病例組中的分布頻率顯著高于在對照組中的分布頻率。在遺傳模型分析中,隱性和超顯遺傳模型在病例和對照組間均有顯著性差異(P=4.9×10-6, OR=2.123,95%CI:1.533-2.940;P=4.6×10-7, OR=0.444,95%CI:0.323-0.611);加法模型也具有顯著性差異(P=0.003,OR=1.492,95%CI:1.149-1.937);共顯模型中AG/AA在兩組間有顯著性差異(P=0.018,OR=0.522,95%CI:0.302-0.901)。 2)SORCS3SNP rs7894737等位基因和基因型在病例和對照組間的分布均有顯著性差異(P=0.011,OR=1.470,95%CI:1.091-1.980;P=9.4×10-5)。在遺傳模型分析中,隱性遺傳模型在病例和對照組間有顯著性差異(P=1.8×10-5, OR=12.84,95%CI:2.893-56.970),加法模型也有顯著性差異(P=0.011, OR=1.474,95%CI:1.091-1.990);共顯模型中CC/AA在兩組間有顯著性差異(P=1.6×10-5, OR=13.09,95%CI:2.941-58.29),CC在病例中的頻率明顯高于對照。 3)AR SNP rs139374285等位基因和基因型在病例和對照組間的分布均有顯著性差異(P=0.001,OR=2.542,95%CI:1.406-4.597;P=0.037)。顯性和隱性遺傳模型在兩組間均有顯著性差異(P=0.010, OR=3.708,95%CI:1.275-10.779;P=0.043,OR=2.076,95%CI:1.010-4.268),加法模型也具有顯著性差異(P=0.037, OR=1.576,95%CI:1.027-2.420);共顯模型中TT/CC在兩組間有顯著性差異(P=0.010, OR=3.707,95%CI:1.275-10.779)。 4)本組前期工作中ApoE SNP rs429358等位基因和基因型在病例和對照組間的分布均有顯著性差異(P=1.2×10-9,OR=3.516,95%CI:2.302-5.369;P=3.4×10-8)。顯性、隱性和超顯遺傳模型在兩組間均有顯著性差異(P=8.0×10-9, OR=3.796,95%CI:2.374-6.069;P=0.004, OR=6.656,95%CI:1.504-29.45;P=1.8×10-6, OR=3.154,95%CI:1.942-5.122),加法模型也具有統(tǒng)計學(xué)差異(P=4.2×10-8,OR=3.296,95%CI:2.152-5.048);共顯模型中CC/TT在兩組間有顯著性差異(P=0.001, OR=8.783,95%CI:1.977-39.02);CT/TT在兩組間有顯著性差異(P=3.2×10-7, OR=3.426,95%CI:2.104-5.580)。 5)危險基因型累積效應(yīng)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn):隨著個體攜帶危險基因型數(shù)目的增多,OR值逐漸增大,即含有的危險基因型數(shù)目的越多,個體患AD的風(fēng)險越大。 6)采用GMDR方法分析CR1SORCS3和AR上三個多態(tài)性位點(diǎn)的交互作用,結(jié)果發(fā)現(xiàn):模型下未見明顯的基因-基因間的交互作用(P0.05)。 7)以ApoE SNP rs429358CC+CT和TT基因型進(jìn)行分層分析,3個關(guān)聯(lián)位點(diǎn)中只發(fā)現(xiàn)SORCS3rs7894737在不攜帶ApoE基因rs429358C等位基因的分層中CC/CA+AA有顯著性差異(P=0.048, OR=8.295,95%CI:1.009-68.20)。 結(jié)論1)CR1rs3818361, SORCS3rs7894737和AR基因rs139374285可能是AD的易感風(fēng)險位點(diǎn);2)患者攜帶的危險基因型數(shù)目越多,個體患AD的風(fēng)險越大;3)交互作用說明AR、CR1和SORCS3這三個基因之間可能不存在基因-基因的交互作用。
【關(guān)鍵詞】:北京人群 阿爾茨海默病 基因 分子流行病學(xué)
【學(xué)位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R749.16;R181.3
【目錄】:
- 摘要4-7
- ABSTRACT7-10
- 中英文縮略詞表10-13
- 前言13-17
- 材料與方法17-29
- 結(jié)果29-50
- 討論50-56
- 參考文獻(xiàn)56-61
- 文獻(xiàn)綜述61-68
- 參考文獻(xiàn)66-68
- 附錄68-75
- 致謝75-76
- 個人簡歷76
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前9條
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本文編號:585181
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