目的:利用大鼠原代神經細胞培養(yǎng)系統(tǒng),采用轉錄組測序技術,觀察非結合膽紅素引起的神經細胞基因差異表達,揭示關鍵生物學過程或信號通路在膽紅素腦病發(fā)病中的機理,豐富膽紅素神經毒性機理,為探討膽紅素腦病防治的新靶點和干預措施提供科學依據。方法:MTT檢測膽紅素處理組和對照組神經細胞活力。經膽紅素處理后對原代培養(yǎng)皮質神經元進行轉錄組測序分析。結果:(1)MTT實驗顯示膽紅素可降低神經細胞活力,隨著膽紅素濃度升高,神經細胞活力下降。(2)實驗組與對照組差異表達基因共有140個,其中117個是上調基因,23個是下調基因。共有135個基因得到數(shù)據庫注釋。COG分類中,脂質運輸和代謝所占比例最大,為14³4.15%。差異表達基因KEGG注釋中,類固醇生物合成這一代謝通路差異表達基因數(shù)目最多。KEGG通路富集分析顯示,類固醇生物合成這一通路涉及的差異表達基因富集水平最顯著。膽固醇屬于類固醇,這引起了研究膽固醇的興趣,為了避免遺漏,經過仔細查找,又查找到其他參與膽固醇生物合成的差異表達基因。共有13個差異表達基因參與膽固醇生物合成,且這些基因都表達上調。結論:經過數(shù)據庫注釋和富集分析,...

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-1不同濃度膽紅素處理后神經細胞活力*表示各實驗組與對照組比較，P<0.001；#表示50μM、100μM組與25μM

研究生學位論文基于轉錄組學檢測的膽紅素神經細胞毒性第三章MTT及轉錄組測序結果濃度膽紅素處理后神經細胞活力表3-1不同濃度膽紅素神經細胞活力（x±s,n=3）μM）神經細胞活力FP100.00±0.00202.9400.00080.18±8.2169.57....

圖3-2非結合膽紅素引起神經細胞差異表達火山圖

下調基因相反）3.2.2非結合膽紅素引起神經細胞差異表達火山圖圖3-2非結合膽紅素引起神經細胞差異表達火山圖將按上述篩選標準確定的神經細胞差異表達基因的信息，繪制成非結合膽紅

圖3-4非結合膽紅素引起差異表達基因GO分類統(tǒng)計結果

基于轉錄組學檢測的膽紅素神經細胞毒性分子機制研究17圖3-4非結合膽紅素引起差異表達基因GO分類統(tǒng)計結果橫坐標紅色、綠色和藍色分別代表生物學過程、細胞組分和分子功能，縱坐標左邊為基因數(shù)目所占百分比，右邊為基因數(shù)目。上圖只是富集分析的粗略劃分，具體劃分所占篇幅過大，由于這一限制，....

圖3-5非結合膽紅素引起神經細胞差異表達基因COG分類統(tǒng)計結果

基于轉錄組學檢測的膽紅素神經細胞毒性分子機制研究18圖3-5非結合膽紅素引起神經細胞差異表達基因COG分類統(tǒng)計結果橫坐標為COG各分類內容，縱坐標為差異表達基因所占比例。由上圖可知，COG分類中按照各功能類所占比例從大到小依次羅列如下：脂質運輸和代謝（14~34.15%），一般....

本文編號：3893313