目的:利用大鼠原代神經(jīng)細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng),采用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),觀察非結(jié)合膽紅素引起的神經(jīng)細(xì)胞基因差異表達(dá),揭示關(guān)鍵生物學(xué)過程或信號通路在膽紅素腦病發(fā)病中的機(jī)理,豐富膽紅素神經(jīng)毒性機(jī)理,為探討膽紅素腦病防治的新靶點和干預(yù)措施提供科學(xué)依據(jù)。方法:MTT檢測膽紅素處理組和對照組神經(jīng)細(xì)胞活力。經(jīng)膽紅素處理后對原代培養(yǎng)皮質(zhì)神經(jīng)元進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序分析。結(jié)果:(1)MTT實驗顯示膽紅素可降低神經(jīng)細(xì)胞活力,隨著膽紅素濃度升高,神經(jīng)細(xì)胞活力下降。(2)實驗組與對照組差異表達(dá)基因共有140個,其中117個是上調(diào)基因,23個是下調(diào)基因。共有135個基因得到數(shù)據(jù)庫注釋。COG分類中,脂質(zhì)運(yùn)輸和代謝所占比例最大,為14³4.15%。差異表達(dá)基因KEGG注釋中,類固醇生物合成這一代謝通路差異表達(dá)基因數(shù)目最多。KEGG通路富集分析顯示,類固醇生物合成這一通路涉及的差異表達(dá)基因富集水平最顯著。膽固醇屬于類固醇,這引起了研究膽固醇的興趣,為了避免遺漏,經(jīng)過仔細(xì)查找,又查找到其他參與膽固醇生物合成的差異表達(dá)基因。共有13個差異表達(dá)基因參與膽固醇生物合成,且這些基因都表達(dá)上調(diào)。結(jié)論:經(jīng)過數(shù)據(jù)庫注釋和富集分析,...

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-1不同濃度膽紅素處理后神經(jīng)細(xì)胞活力*表示各實驗組與對照組比較，P<0.001；#表示50μM、100μM組與25μM

研究生學(xué)位論文基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)檢測的膽紅素神經(jīng)細(xì)胞毒性第三章MTT及轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果濃度膽紅素處理后神經(jīng)細(xì)胞活力表3-1不同濃度膽紅素神經(jīng)細(xì)胞活力（x±s,n=3）μM）神經(jīng)細(xì)胞活力FP100.00±0.00202.9400.00080.18±8.2169.57....

圖3-2非結(jié)合膽紅素引起神經(jīng)細(xì)胞差異表達(dá)火山圖

下調(diào)基因相反）3.2.2非結(jié)合膽紅素引起神經(jīng)細(xì)胞差異表達(dá)火山圖圖3-2非結(jié)合膽紅素引起神經(jīng)細(xì)胞差異表達(dá)火山圖將按上述篩選標(biāo)準(zhǔn)確定的神經(jīng)細(xì)胞差異表達(dá)基因的信息，繪制成非結(jié)合膽紅

圖3-4非結(jié)合膽紅素引起差異表達(dá)基因GO分類統(tǒng)計結(jié)果

基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)檢測的膽紅素神經(jīng)細(xì)胞毒性分子機(jī)制研究17圖3-4非結(jié)合膽紅素引起差異表達(dá)基因GO分類統(tǒng)計結(jié)果橫坐標(biāo)紅色、綠色和藍(lán)色分別代表生物學(xué)過程、細(xì)胞組分和分子功能，縱坐標(biāo)左邊為基因數(shù)目所占百分比，右邊為基因數(shù)目。上圖只是富集分析的粗略劃分，具體劃分所占篇幅過大，由于這一限制，....

圖3-5非結(jié)合膽紅素引起神經(jīng)細(xì)胞差異表達(dá)基因COG分類統(tǒng)計結(jié)果

基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)檢測的膽紅素神經(jīng)細(xì)胞毒性分子機(jī)制研究18圖3-5非結(jié)合膽紅素引起神經(jīng)細(xì)胞差異表達(dá)基因COG分類統(tǒng)計結(jié)果橫坐標(biāo)為COG各分類內(nèi)容，縱坐標(biāo)為差異表達(dá)基因所占比例。由上圖可知，COG分類中按照各功能類所占比例從大到小依次羅列如下：脂質(zhì)運(yùn)輸和代謝（14~34.15%），一般....

本文編號：3893313