機房環(huán)境表面金黃色葡萄球菌的表型和分子特征連續(xù)監(jiān)測研究
發(fā)布時間:2023-04-11 18:12
目的:本研究旨在掌握某高校機房環(huán)境表面金黃色葡萄球菌(簡稱金葡菌)和耐甲氧西林金葡菌(簡稱MRSA)污染的流行特征及其持續(xù)污染情況,評估環(huán)境MRSA污染對人群的潛在威脅;掌握金葡菌和MRSA菌株的耐藥譜、分子分型及毒素基因等分子特征,并分析菌株分子分型和分子特征間的潛在關(guān)聯(lián),掌握菌株的遺傳背景。探索環(huán)境菌株與人群菌株遺傳背景的相似性,揭示潛在的交叉?zhèn)鞑ワL(fēng)險。方法:采取連續(xù)監(jiān)測研究設(shè)計,連續(xù)4天對某高校計算機實驗室155臺計算機的鍵盤和鼠標表面進行棉拭子采樣。對所有金葡菌進行抗菌藥物敏感性實驗,通過多位點序列(MLST)進行分子分型,通過全基因測序拼接序列后進行毒素基因、耐藥基因、Spa分型和SCCmec分型檢測。組別間率的比較采用χ2檢驗。采用UPGMA聚類分析和χ2關(guān)聯(lián)性檢驗探索菌株的分子型別與表型特征、分子特征之間的潛在關(guān)聯(lián)。結(jié)果:(1)污染率:本項目共采集1240份樣本,物體表面金葡菌的總污染率為4.1%(51/1240),MRSA的總污染率為0.5%(6/1240),多重耐藥金葡菌(MDRSA)的總污染率為1.5%(19/1240);...
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 前言
第二章 對象與方法
2.1 研究設(shè)計
2.1.1 采樣時間和采樣方法
2.1.2 樣本量估算
2.2 樣本采集
2.3 金葡菌的分離鑒定
2.3.1 主要實驗材料
2.3.2 分離鑒定過程
2.4 抗菌藥物敏感性試驗
2.4.1 藥敏試驗方法
2.4.2 藥敏紙片選取
2.4.3 實驗過程
2.5 金葡菌基因組DNA的提取
2.5.1 主要實驗材料
2.5.2 實驗步驟
2.6 金葡菌生物學(xué)分析
2.6.1 PCR擴增特異性基因
2.6.2 全基因組測序
2.6.3 MLST分型
2.6.4 Spa分型
2.6.5 耐藥基因檢測
2.6.6 毒素基因檢測
2.7 質(zhì)量控制
2.7.1 采樣員培訓(xùn)
2.7.2 采樣前物資準備
2.7.3 實驗室質(zhì)量控制
2.8 相關(guān)定義
2.9 統(tǒng)計分析
第三章 結(jié)果
3.1 機房環(huán)境鼠標和鍵盤表面金葡菌污染情況
3.2 金葡菌耐藥情況
3.2.1 金葡菌對11類藥物的耐藥情況
3.2.2 連續(xù)污染部位耐藥情況
3.2.3 鍵盤表面與鼠標表面的耐藥情況比較
3.2.4 機房環(huán)境表面51株金葡菌的多重耐藥情況
3.2.5 MDRSA與 non-MDRSA的耐藥情況比較
3.3 機房環(huán)境表面金葡菌分子分型
3.3.1 SCCmec分型
3.3.2 MLST分型
3.3.3 Spa分型
3.3.4 所有分型
3.3.5 連續(xù)污染部位分子分型情況
3.4 機房環(huán)境表面金葡菌分子特征
3.4.1 耐藥基因
3.4.2 毒素基因
3.5 關(guān)聯(lián)性分析
3.5.1 分子分型和耐藥表型之間的關(guān)聯(lián)
3.5.2 分子分型和腸毒素基因之間的關(guān)聯(lián)
3.5.3 分子分型和其他毒素基因之間的關(guān)聯(lián)
3.6 機房環(huán)境與人群金葡菌株之間的比較
3.6.1 一般情況
3.6.2 機房環(huán)境與人群金葡菌株之間耐藥情況的比較
3.6.3 機房環(huán)境與人群金葡菌株之間分子特征的比較
3.6.4 機房環(huán)境與人群金葡菌株之間的聚類分析
第四章 討論
4.1 機房環(huán)境金葡菌連續(xù)污染情況
4.2 耐藥情況
4.3 分子分型
4.4 分子特征的關(guān)聯(lián)
4.5 本研究的優(yōu)缺點
第五章 結(jié)論
參考文獻
綜述
參考文獻
致謝
攻讀碩士期間發(fā)表的論文
本文編號:3789531
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 前言
第二章 對象與方法
2.1 研究設(shè)計
2.1.1 采樣時間和采樣方法
2.1.2 樣本量估算
2.2 樣本采集
2.3 金葡菌的分離鑒定
2.3.1 主要實驗材料
2.3.2 分離鑒定過程
2.4 抗菌藥物敏感性試驗
2.4.1 藥敏試驗方法
2.4.2 藥敏紙片選取
2.4.3 實驗過程
2.5 金葡菌基因組DNA的提取
2.5.1 主要實驗材料
2.5.2 實驗步驟
2.6 金葡菌生物學(xué)分析
2.6.1 PCR擴增特異性基因
2.6.2 全基因組測序
2.6.3 MLST分型
2.6.4 Spa分型
2.6.5 耐藥基因檢測
2.6.6 毒素基因檢測
2.7 質(zhì)量控制
2.7.1 采樣員培訓(xùn)
2.7.2 采樣前物資準備
2.7.3 實驗室質(zhì)量控制
2.8 相關(guān)定義
2.9 統(tǒng)計分析
第三章 結(jié)果
3.1 機房環(huán)境鼠標和鍵盤表面金葡菌污染情況
3.2 金葡菌耐藥情況
3.2.1 金葡菌對11類藥物的耐藥情況
3.2.2 連續(xù)污染部位耐藥情況
3.2.3 鍵盤表面與鼠標表面的耐藥情況比較
3.2.4 機房環(huán)境表面51株金葡菌的多重耐藥情況
3.2.5 MDRSA與 non-MDRSA的耐藥情況比較
3.3 機房環(huán)境表面金葡菌分子分型
3.3.1 SCCmec分型
3.3.2 MLST分型
3.3.3 Spa分型
3.3.4 所有分型
3.3.5 連續(xù)污染部位分子分型情況
3.4 機房環(huán)境表面金葡菌分子特征
3.4.1 耐藥基因
3.4.2 毒素基因
3.5 關(guān)聯(lián)性分析
3.5.1 分子分型和耐藥表型之間的關(guān)聯(lián)
3.5.2 分子分型和腸毒素基因之間的關(guān)聯(lián)
3.5.3 分子分型和其他毒素基因之間的關(guān)聯(lián)
3.6 機房環(huán)境與人群金葡菌株之間的比較
3.6.1 一般情況
3.6.2 機房環(huán)境與人群金葡菌株之間耐藥情況的比較
3.6.3 機房環(huán)境與人群金葡菌株之間分子特征的比較
3.6.4 機房環(huán)境與人群金葡菌株之間的聚類分析
第四章 討論
4.1 機房環(huán)境金葡菌連續(xù)污染情況
4.2 耐藥情況
4.3 分子分型
4.4 分子特征的關(guān)聯(lián)
4.5 本研究的優(yōu)缺點
第五章 結(jié)論
參考文獻
綜述
參考文獻
致謝
攻讀碩士期間發(fā)表的論文
本文編號:3789531
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