基于方差—協(xié)方差結(jié)構(gòu)校正的孟德爾隨機化方法及其在因果關(guān)聯(lián)研究中的應(yīng)用
發(fā)布時間:2023-03-14 19:08
觀察性研究作為流行病學(xué)中常見的一種設(shè)計形式,較之隨機對照研究,在研究時長、成本、可行性等方面具有明顯優(yōu)勢,被廣泛應(yīng)用于病因的初步探索中。但由于潛在混雜因素、反向因果關(guān)聯(lián)等問題,觀察性研究的結(jié)果往往存在爭議。近年來迅猛發(fā)展的孟德爾隨機化方法,利用遺傳變異作為工具變量,在傳統(tǒng)流行病學(xué)存在混雜因素的情況下,推斷暴露因素與結(jié)局之間的因果關(guān)聯(lián),為解決上述問題提供了有效的途徑。由于全基因組關(guān)聯(lián)研究的飛速發(fā)展,遺傳變異數(shù)據(jù)資源得以大大豐富,為工具變量提供了更大的選擇空間。基于全基因組關(guān)聯(lián)研究結(jié)果數(shù)據(jù)的多工具變量孟德爾隨機化方法因檢驗效能高、數(shù)據(jù)易獲取等特點,目前被廣泛用于因果關(guān)聯(lián)的探索,GSMR法和IVW法是此類方法的代表。但是關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果來源于單位點分析,無法得到工具變量的真實效應(yīng)值,因此GSMR法和IVW法的估計可能是有偏的。針對此問題,本研究提出基于方差-協(xié)方差結(jié)構(gòu)校正的多工具變量孟德爾隨機化方法,MR-RIVER。通過模擬試驗,比較MR-RIVER法、GSMR法和IVW法在不同參數(shù)設(shè)置下的統(tǒng)計學(xué)性質(zhì),包括:一類錯誤、檢驗效能、估計偏差以及均方誤差。模擬實驗結(jié)果顯示,在不同的參數(shù)設(shè)置下,MR...
【文章頁數(shù)】:95 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
2 研究目的與方法
2.1 研究目的
2.2 IVW法
2.3 GSMR法
2.4 MR-RIVER法
3 MR-RIVER方法效應(yīng)估計
3.1 基于方差-協(xié)方差結(jié)構(gòu)校正關(guān)聯(lián)分析中的效應(yīng)估計
3.2 MR-RIVER法估計因果效應(yīng)值
4 模擬實驗與結(jié)果
4.1 模擬實驗一
4.1.1 模擬實驗?zāi)康?br> 4.1.2 模擬數(shù)據(jù)產(chǎn)生方法
4.1.3 模擬實驗流程
4.1.4 模擬實驗結(jié)果
4.2 模擬實驗二
4.2.1 模擬實驗二目的
4.2.2 模擬數(shù)據(jù)產(chǎn)生方法
4.2.3 模擬實驗流程
4.2.4 模擬實驗結(jié)果
5 實例分析
5.1 研究背景
5.2 資料來源
5.3 實例分析流程
5.4 實例分析結(jié)果
5.5 實例分析討論
6 討論
6.1 關(guān)于工具變量的假設(shè)
6.2 關(guān)于變量之間的相關(guān)結(jié)構(gòu)
6.3 關(guān)于檢驗效能
6.4 關(guān)于估計偏差和均方誤差
7 總結(jié)
7.1 研究結(jié)論
7.2 研究特點
7.3 研究局限
7.4 研究展望
參考文獻
文獻綜述
1 前言
2 孟德爾隨機化研究基本假設(shè)
3 基于匯總數(shù)據(jù)的兩樣本孟德爾隨機化方法
3.1 IVW法
3.2 MR-Egger法
3.3 GSMR法
4 總結(jié)
參考文獻
附錄
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文情況
致謝
本文編號:3762577
【文章頁數(shù)】:95 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
2 研究目的與方法
2.1 研究目的
2.2 IVW法
2.3 GSMR法
2.4 MR-RIVER法
3 MR-RIVER方法效應(yīng)估計
3.1 基于方差-協(xié)方差結(jié)構(gòu)校正關(guān)聯(lián)分析中的效應(yīng)估計
3.2 MR-RIVER法估計因果效應(yīng)值
4 模擬實驗與結(jié)果
4.1 模擬實驗一
4.1.1 模擬實驗?zāi)康?br> 4.1.2 模擬數(shù)據(jù)產(chǎn)生方法
4.1.3 模擬實驗流程
4.1.4 模擬實驗結(jié)果
4.2 模擬實驗二
4.2.1 模擬實驗二目的
4.2.2 模擬數(shù)據(jù)產(chǎn)生方法
4.2.3 模擬實驗流程
4.2.4 模擬實驗結(jié)果
5 實例分析
5.1 研究背景
5.2 資料來源
5.3 實例分析流程
5.4 實例分析結(jié)果
5.5 實例分析討論
6 討論
6.1 關(guān)于工具變量的假設(shè)
6.2 關(guān)于變量之間的相關(guān)結(jié)構(gòu)
6.3 關(guān)于檢驗效能
6.4 關(guān)于估計偏差和均方誤差
7 總結(jié)
7.1 研究結(jié)論
7.2 研究特點
7.3 研究局限
7.4 研究展望
參考文獻
文獻綜述
1 前言
2 孟德爾隨機化研究基本假設(shè)
3 基于匯總數(shù)據(jù)的兩樣本孟德爾隨機化方法
3.1 IVW法
3.2 MR-Egger法
3.3 GSMR法
4 總結(jié)
參考文獻
附錄
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文情況
致謝
本文編號:3762577
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