苯并芘暴露大鼠海馬組織的全基因組DNA甲基化差異分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-24 01:32
目的研究苯并芘暴露大鼠海馬組織的DNA甲基化差異,探討苯并芘對(duì)海馬功能損傷的機(jī)制。方法將大鼠分為對(duì)照組和苯并芘染毒組,每組10只;染毒結(jié)束后,采用Morris水迷宮檢測(cè)大鼠的空間記憶學(xué)習(xí)能力,隨后對(duì)大鼠海馬進(jìn)行HE染色與簡(jiǎn)化表觀亞硫酸氫鹽測(cè)序法(reduced representation bisulfite sequencing, RRBS)測(cè)序,對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行GO和KEGG分析,用qRT-PCR檢測(cè)Tnr基因與Pla2g2a基因mRNA的表達(dá)。結(jié)果 Morris水迷宮與HE染色發(fā)現(xiàn)苯并芘暴露導(dǎo)致了大鼠空間學(xué)習(xí)記憶能力的障礙與海馬組織損傷;RRBS測(cè)序后檢測(cè)到差異性甲基化區(qū)域32個(gè),GO分析富集到871條GO條目,KEGG分析得到52條通路,其中145條GO條目和11條通路顯著富集(P<0.05),苯并芘染毒組與對(duì)照組相比,Tnr基因相對(duì)表達(dá)量減少,而Pla2g2a基因相對(duì)表達(dá)量增加(P<0.05)。結(jié)論與未染毒的大鼠相比,苯并芘染毒后大鼠海馬組織存在一定數(shù)量的甲基化差異位點(diǎn),這些甲基化差異位點(diǎn)可能對(duì)研究苯并芘導(dǎo)致海馬損傷的機(jī)制具有重要指導(dǎo)意義。
【文章來源】:第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,42(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
不同功能元件區(qū)域的甲基化水平分布
表3 差異甲基化基因的KEGG富集分析 通路 通路編號(hào) 候選基因數(shù)量 P值 基因名稱 Ras信號(hào)通路 rno04014 3 0.001 Ikbkg; Fgf14; Pla2g2a B細(xì)胞受體信號(hào)通路 rno04662 2 0.002 Cr2; Ikbkg 凝血與補(bǔ)體級(jí)聯(lián)反應(yīng)信號(hào)通路 rno04610 2 0.003 Plg; Cr2 PI3K-Akt信號(hào)通路 rno04151 3 0.004 Ikbkg; Fgf14; Tnr EB病毒感染 rno05169 2 0.021 Cr2; Ikbkg α-亞麻酸代謝 rno00592 1 0.025 Pla2g2a MAPK信號(hào)通路 rno04010 2 0.026 Ikbkg; Fgf14 脂肪的消化吸收 rno04975 1 0.039 Pla2g2a 原發(fā)性免疫缺陷 rno05340 1 0.039 Ikbkg 亞油酸代謝 rno00591 1 0.040 Pla2g2a 醚脂質(zhì)代謝 rno00565 1 0.042 Pla2g2a2.5 Tnr與Pla2g2a基因甲基化狀態(tài)與mRNA的表達(dá)
通過Morris水迷宮實(shí)驗(yàn)觀察兩組大鼠的空間記憶和學(xué)習(xí)能力,結(jié)果顯示:隨著訓(xùn)練時(shí)間的增加,兩組大鼠的逃避潛伏期時(shí)間總體趨勢(shì)是減少的;從第3天開始,對(duì)照組比B[a]P染毒組逃避潛伏期縮短(P<0.05,圖1A),對(duì)照組與B[a]P染毒組在定位巡航實(shí)驗(yàn)時(shí)代表性的游泳路徑如圖1B所示;空間探索實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:對(duì)照組在目標(biāo)象限時(shí)間百分比明顯長于B[a]P染毒組(P<0.05,圖1C)。2.2 苯并芘對(duì)海馬的損害作用
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大鼠BMSCs與ADSCs全基因組DNA甲基化差異分析[J]. 陳旭濤,萬卓,韋夢(mèng)影,楊國棟,宋應(yīng)亮. 實(shí)用口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2019(02)
[2]長期負(fù)性情緒應(yīng)激對(duì)D-gal大鼠認(rèn)知功能及海馬NR2B基因甲基化表達(dá)的影響[J]. 李寧,劉紫陽,詹向紅,李偉,劉永,侯俊林. 中國中西醫(yī)結(jié)合雜志. 2019(06)
[3]苯并芘致肺癌的研究進(jìn)展[J]. 代文娟,黃海燕,胡恭華. 毒理學(xué)雜志. 2018(06)
[4]孕期外源物暴露致DNA甲基化異常與發(fā)育源性疾病的關(guān)系研究[J]. 金靈,張?jiān)? 中華生殖與避孕雜志. 2018(06)
[5]MAPKs信號(hào)通路與阿爾茲海默病的研究進(jìn)展[J]. 王一夫,劉爽. 世界中醫(yī)藥. 2016(09)
[6]人類基因組DNA甲基化數(shù)據(jù)分析的研究現(xiàn)狀[J]. 凡時(shí)財(cái),李承哲,裴云飛. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2015(05)
[7]間歇低氧大鼠細(xì)胞外信號(hào)調(diào)節(jié)激酶與認(rèn)知功能變化[J]. 張盼盼,韓曉慶,李琳,王紅陽,王玲,郭秀華,雷軍旗,楊林. 中國神經(jīng)精神疾病雜志. 2014(09)
[8]下一代測(cè)序技術(shù)在表觀遺傳學(xué)研究中的重要應(yīng)用及進(jìn)展[J]. 沈圣,屈彥純,張軍. 遺傳. 2014(03)
[9]分泌型磷脂酶A2亞家族:結(jié)構(gòu)與功能[J]. 楊武,郭薇,黃春洪. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2013(10)
[10]環(huán)境因素對(duì)DNA甲基化的影響[J]. 曹家雪,張紅平,杜立新. 遺傳. 2013(07)
本文編號(hào):3605566
【文章來源】:第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,42(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
不同功能元件區(qū)域的甲基化水平分布
表3 差異甲基化基因的KEGG富集分析 通路 通路編號(hào) 候選基因數(shù)量 P值 基因名稱 Ras信號(hào)通路 rno04014 3 0.001 Ikbkg; Fgf14; Pla2g2a B細(xì)胞受體信號(hào)通路 rno04662 2 0.002 Cr2; Ikbkg 凝血與補(bǔ)體級(jí)聯(lián)反應(yīng)信號(hào)通路 rno04610 2 0.003 Plg; Cr2 PI3K-Akt信號(hào)通路 rno04151 3 0.004 Ikbkg; Fgf14; Tnr EB病毒感染 rno05169 2 0.021 Cr2; Ikbkg α-亞麻酸代謝 rno00592 1 0.025 Pla2g2a MAPK信號(hào)通路 rno04010 2 0.026 Ikbkg; Fgf14 脂肪的消化吸收 rno04975 1 0.039 Pla2g2a 原發(fā)性免疫缺陷 rno05340 1 0.039 Ikbkg 亞油酸代謝 rno00591 1 0.040 Pla2g2a 醚脂質(zhì)代謝 rno00565 1 0.042 Pla2g2a2.5 Tnr與Pla2g2a基因甲基化狀態(tài)與mRNA的表達(dá)
通過Morris水迷宮實(shí)驗(yàn)觀察兩組大鼠的空間記憶和學(xué)習(xí)能力,結(jié)果顯示:隨著訓(xùn)練時(shí)間的增加,兩組大鼠的逃避潛伏期時(shí)間總體趨勢(shì)是減少的;從第3天開始,對(duì)照組比B[a]P染毒組逃避潛伏期縮短(P<0.05,圖1A),對(duì)照組與B[a]P染毒組在定位巡航實(shí)驗(yàn)時(shí)代表性的游泳路徑如圖1B所示;空間探索實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:對(duì)照組在目標(biāo)象限時(shí)間百分比明顯長于B[a]P染毒組(P<0.05,圖1C)。2.2 苯并芘對(duì)海馬的損害作用
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[4]孕期外源物暴露致DNA甲基化異常與發(fā)育源性疾病的關(guān)系研究[J]. 金靈,張?jiān)? 中華生殖與避孕雜志. 2018(06)
[5]MAPKs信號(hào)通路與阿爾茲海默病的研究進(jìn)展[J]. 王一夫,劉爽. 世界中醫(yī)藥. 2016(09)
[6]人類基因組DNA甲基化數(shù)據(jù)分析的研究現(xiàn)狀[J]. 凡時(shí)財(cái),李承哲,裴云飛. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2015(05)
[7]間歇低氧大鼠細(xì)胞外信號(hào)調(diào)節(jié)激酶與認(rèn)知功能變化[J]. 張盼盼,韓曉慶,李琳,王紅陽,王玲,郭秀華,雷軍旗,楊林. 中國神經(jīng)精神疾病雜志. 2014(09)
[8]下一代測(cè)序技術(shù)在表觀遺傳學(xué)研究中的重要應(yīng)用及進(jìn)展[J]. 沈圣,屈彥純,張軍. 遺傳. 2014(03)
[9]分泌型磷脂酶A2亞家族:結(jié)構(gòu)與功能[J]. 楊武,郭薇,黃春洪. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2013(10)
[10]環(huán)境因素對(duì)DNA甲基化的影響[J]. 曹家雪,張紅平,杜立新. 遺傳. 2013(07)
本文編號(hào):3605566
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