H19/SAHH調(diào)控OGG1甲基化對BaP致人肺源性細胞DNA氧化損傷的影響
發(fā)布時間:2021-11-18 03:11
目的:探討長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,lnc RNA)H19與S-腺苷高半胱氨酸水解酶(S-adenosylhomocysteine hydrolase,SAHH)相互作用調(diào)控8-羥基鳥嘌呤DNA糖苷酶1(8-oxoguanine DNA glycosylase 1,OGG1)甲基化水平在苯并[a]芘(Benzo[a]pyrene,Ba P)致人肺源性細胞(16HBE、BEAS-2B、VA13)DNA氧化損傷過程中的作用,以期為揭示Ba P暴露致DNA損傷的表觀遺傳調(diào)控機制提供相應線索。方法:通過si RNA技術降低人肺源性細胞中H19及SAHH的表達水平,構(gòu)建H19低表達、SAHH低表達和H19及SAHH雙低表達細胞模型,同時設置轉(zhuǎn)染陰性序列對照組;通過質(zhì)粒轉(zhuǎn)染技術(載體p CMV-GV141)過表達人肺源性細胞中SAHH的表達水平,構(gòu)建SAHH過表達細胞模型(wild type(WT)-SAHH、M1-SAHH,M2-SAHH,M3-SAHH),同時設置轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒對照組。用不同濃度Ba P(0、1、2、4、8、16、32μmol/L)染毒24h,以16...
【文章來源】:山西醫(yī)科大學山西省
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
腺苷標準曲線
圖 2 OGG1 甲基化檢測位點及序列將 110mL 70%乙醇、110mL 1×Wash Buffer、90mL Denaturation Buffer、10純水倒入相應的 5 個清洗槽;打開并設置 80℃金屬浴,將 Plate Holder 放;輕柔混勻 Sepharose Beads,配置 Sepharose Beads 和 Binding Buffer 的 M孔反應尖底板 80μL 體系(常溫 1400rpm 水平振蕩混勻 20min):Sephads 3μL,DNA 擴增樣品 15μL,Binding Buffer 40μL,Water 20μL。96 孔底板 40μL 體系:annealing Buffer 38.4μL,10μM 測序引物 1.6μL。PyroM6 軟件設置好運行程序,按照程序要求在試劑艙加入相應試劑,并把試劑PyroMark Q96 中;打開 vacuum prep workstation 的泵,將 vacuum prep to純水中清洗 3 次(最后一次抽干);vacuum prep tool 移到 96 孔反應尖底Sepharose Beads,然后依次放入 70%乙醇 5s、Denaturation Buffer 5s、1×Wffer 10s(注意需待液體順暢通過后進行計時);取出并豎直 vacuum prep
板中染毒結(jié)束后,D-hanks 平衡鹽溶液清至 1.5mL 離心管中,使用 8-OHdG樣,重復 3 次。DNA 20min,使用 1M Tris 將 pH 值調(diào)整為磷酸酶,37°C 孵育 30min;沸水煮 10min,按照表 3 配制標準曲線 8 個梯度樣品(倍為標準曲線稀釋標品 H 的 OD 值,根據(jù)標型標準曲線(見圖 3)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]DNA修復基因可變剪接及非編碼RNA調(diào)控網(wǎng)絡作為惡性腫瘤發(fā)生及預后生物學標志的意義[J]. 逯曉波. 沈陽醫(yī)學院學報. 2017(04)
[2]布魯菌半胱氨酸水解酶在甲硫氨酸循環(huán)中的催化活性研究[J]. 徐達,吳小卡,荊雅瑋,左佳坤,米榮升,黃燕,陳兆國,王成明,韓先干. 南京農(nóng)業(yè)大學學報. 2017(04)
[3]H19基因在腫瘤研究領域的研究進展[J]. 王曉東,王曉娟,趙鵬飛,陳文捷,吳慧哲,魏敏杰. 復旦學報(醫(yī)學版). 2017(02)
[4]苯并[a]芘誘發(fā)細胞惡性轉(zhuǎn)化過程中基因組總體DNA甲基化改變[J]. 陶功華,莊志雄,楊淋清,龔春梅,劉慶成,劉建軍,肖萍. 環(huán)境與職業(yè)醫(yī)學. 2014(05)
[5]DNA甲基化的研究進展[J]. 謝松松,王寶峰,周宗瑤. 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2009(17)
[6]DNA損傷修復過程表觀遺傳學改變[J]. 楊萍,李志芳,陳雯. 醫(yī)學分子生物學雜志. 2009 (05)
[7]DNA修復的表觀遺傳學調(diào)控[J]. 黃慶雷,焦仁杰. 生物化學與生物物理進展. 2008(10)
[8]應用基因芯片技術篩查肺癌變相關基因的研究[J]. 呂嘉春,陳家堃,紀衛(wèi)東,蔣義國,施侶元,吳中亮,何敏,曾波航. 中華醫(yī)學雜志. 2003(24)
[9]DNA甲基化及其影響因素[J]. 陳瑞琳,藺淑梅,陳天艷,張曦. 國際流行病學傳染病學雜志. 2007 (04)
[10]表觀遺傳學及其研究進展[J]. 張梅光. 中華勞動衛(wèi)生職業(yè)病雜志. 2008 (11)
本文編號:3502085
【文章來源】:山西醫(yī)科大學山西省
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
腺苷標準曲線
圖 2 OGG1 甲基化檢測位點及序列將 110mL 70%乙醇、110mL 1×Wash Buffer、90mL Denaturation Buffer、10純水倒入相應的 5 個清洗槽;打開并設置 80℃金屬浴,將 Plate Holder 放;輕柔混勻 Sepharose Beads,配置 Sepharose Beads 和 Binding Buffer 的 M孔反應尖底板 80μL 體系(常溫 1400rpm 水平振蕩混勻 20min):Sephads 3μL,DNA 擴增樣品 15μL,Binding Buffer 40μL,Water 20μL。96 孔底板 40μL 體系:annealing Buffer 38.4μL,10μM 測序引物 1.6μL。PyroM6 軟件設置好運行程序,按照程序要求在試劑艙加入相應試劑,并把試劑PyroMark Q96 中;打開 vacuum prep workstation 的泵,將 vacuum prep to純水中清洗 3 次(最后一次抽干);vacuum prep tool 移到 96 孔反應尖底Sepharose Beads,然后依次放入 70%乙醇 5s、Denaturation Buffer 5s、1×Wffer 10s(注意需待液體順暢通過后進行計時);取出并豎直 vacuum prep
板中染毒結(jié)束后,D-hanks 平衡鹽溶液清至 1.5mL 離心管中,使用 8-OHdG樣,重復 3 次。DNA 20min,使用 1M Tris 將 pH 值調(diào)整為磷酸酶,37°C 孵育 30min;沸水煮 10min,按照表 3 配制標準曲線 8 個梯度樣品(倍為標準曲線稀釋標品 H 的 OD 值,根據(jù)標型標準曲線(見圖 3)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]DNA修復基因可變剪接及非編碼RNA調(diào)控網(wǎng)絡作為惡性腫瘤發(fā)生及預后生物學標志的意義[J]. 逯曉波. 沈陽醫(yī)學院學報. 2017(04)
[2]布魯菌半胱氨酸水解酶在甲硫氨酸循環(huán)中的催化活性研究[J]. 徐達,吳小卡,荊雅瑋,左佳坤,米榮升,黃燕,陳兆國,王成明,韓先干. 南京農(nóng)業(yè)大學學報. 2017(04)
[3]H19基因在腫瘤研究領域的研究進展[J]. 王曉東,王曉娟,趙鵬飛,陳文捷,吳慧哲,魏敏杰. 復旦學報(醫(yī)學版). 2017(02)
[4]苯并[a]芘誘發(fā)細胞惡性轉(zhuǎn)化過程中基因組總體DNA甲基化改變[J]. 陶功華,莊志雄,楊淋清,龔春梅,劉慶成,劉建軍,肖萍. 環(huán)境與職業(yè)醫(yī)學. 2014(05)
[5]DNA甲基化的研究進展[J]. 謝松松,王寶峰,周宗瑤. 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2009(17)
[6]DNA損傷修復過程表觀遺傳學改變[J]. 楊萍,李志芳,陳雯. 醫(yī)學分子生物學雜志. 2009 (05)
[7]DNA修復的表觀遺傳學調(diào)控[J]. 黃慶雷,焦仁杰. 生物化學與生物物理進展. 2008(10)
[8]應用基因芯片技術篩查肺癌變相關基因的研究[J]. 呂嘉春,陳家堃,紀衛(wèi)東,蔣義國,施侶元,吳中亮,何敏,曾波航. 中華醫(yī)學雜志. 2003(24)
[9]DNA甲基化及其影響因素[J]. 陳瑞琳,藺淑梅,陳天艷,張曦. 國際流行病學傳染病學雜志. 2007 (04)
[10]表觀遺傳學及其研究進展[J]. 張梅光. 中華勞動衛(wèi)生職業(yè)病雜志. 2008 (11)
本文編號:3502085
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