[背景]磷酸三苯酯（TPHP）是目前應用最廣泛的有機磷酸酯類阻燃劑之一,已在多種環(huán)境介質中被檢測到。由于該化合物的多重毒性,近年來TPHP的健康風險引起了廣泛的關注。然而,有關TPHP暴露對肝臟代謝影響的研究較少。[目的]基于轉錄組測序數據,采用生物信息學方法探討TPHP暴露對大鼠肝臟代謝紊亂的效應。[方法]基于基因表達數據庫（GEO）獲得基因表達譜數據集。采用主成分分析和層次聚類分析方法,依據不同劑量組的基因表達模式的相似程度將樣本歸類至對照組（0 mg·kg-1,含5個樣本）、低劑量組（55.0、110.0、220.0 mg·kg-1,含9個樣本）和高劑量組（441.0、881.0 mg·kg-1,含6個樣本）;利用R 3.5.3軟件中l(wèi)imma包篩選差異表達基因（DEGs）。運用cluster Profiler包對DEGs進行基因本體（GO）、京都基因和基因組數據庫（KEGG）富集分析。利用STRING網絡數據庫建立蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）網絡,并運用Cytoscape 3.7.1軟件的網絡分析插件Cyto Hubba篩選中心基因。最后,運用cluster Profile... 

【文章來源】：環(huán)境與職業(yè)醫(yī)學. 2020,37(02)北大核心CSCD

【文章頁數】：10 頁

【部分圖文】：

GSE121134數據集樣本分組信息

Arntl基因高表達組和低表達組的GSEA結果顯示，一共有25條通路被富集，其中Arntl基因高表達組有19條通路，涉及精氨酸和脯氨酸代謝、背腹軸線形成、朊病毒疾病、擴張型心肌病、造血細胞系、致病性大腸桿菌感染、細胞外基質受體相互作用、黏著斑、細胞黏附分子、細胞間隙連接、利什曼原蟲感染、轉化生長因子-β（transforming growth factor-beta,TGF-β）信號通路、血管平滑肌收縮、哮喘、不飽和脂肪酸的生物合成、PPAR信號通路、細胞因子-受體相互作用、白細胞跨內皮遷移、系統(tǒng)性紅斑狼瘡生物途徑；低表達組有6條通路，包括甾體生物合成、同源重組合、DNA復制、其他甘氨酸降解、萜類骨架生物合成和丁酸甲酯代謝生物途徑，詳見圖6。GSEA結果提示，Arntl基因可能通過以上生物學通路影響TPHP的代謝紊亂效應。圖4 低劑量組（A）和高劑量組（B）的KEGG通路富集分析結果

低劑量組（A）和高劑量組（B）的KEGG通路富集分析結果

【參考文獻】：
期刊論文
[1]塑膠跑道中有機磷酸酯的含量及健康風險[J]. 印紅玲,劉琴,廖林群,王震,羅怡,鄧旭,丁浚剛,唐銘.  環(huán)境科學. 2017(11)



本文編號：3425766