目的:湖北釘螺是日本血吸蟲唯一中間宿主,在血吸蟲病傳播過(guò)程中起關(guān)鍵作用。湖北釘螺微衛(wèi)星DNA庫(kù)建立之后,為后續(xù)微衛(wèi)星位點(diǎn)的篩選提供了豐富的儲(chǔ)存庫(kù),但庫(kù)中的位點(diǎn)卻未被充分利用。因此,本文利用生物信息學(xué)方法篩選多態(tài)性的微衛(wèi)星位點(diǎn),設(shè)計(jì)并合成相應(yīng)的引物,為后續(xù)的群體遺傳學(xué)分析提供有效的分子標(biāo)志。湖北釘螺的地理分布與日本血吸蟲病的流行區(qū)具有嚴(yán)格的一致性,主要分布在我國(guó)的長(zhǎng)江流域以及南部地區(qū)。受到分布范圍廣、地理隔離以及滋生環(huán)境復(fù)雜等因素的影響,不同地理群體的湖北釘螺發(fā)生了明顯的分化和變異。因此,本研究通過(guò)對(duì)不同地區(qū)的湖北釘螺進(jìn)行群體遺傳學(xué)研究,以期找出遺傳變異的規(guī)律,為低流行水平狀態(tài)下評(píng)價(jià)湖北釘螺控制措施效果和監(jiān)測(cè)釘螺擴(kuò)散提供科學(xué)依據(jù)。方法:從公共數(shù)據(jù)庫(kù)（Genbank）中下載湖北釘螺的核苷酸序列,使用SciRoKo3.3軟件查找微衛(wèi)星序列,從中挑選微衛(wèi)星位點(diǎn)（以3核苷酸重復(fù)片段為主）,同時(shí)從已發(fā)表文獻(xiàn)中挑取多態(tài)性的微衛(wèi)星位點(diǎn)。然后,利用軟件Primer premier和Oligo來(lái)進(jìn)行引物的設(shè)計(jì)和評(píng)價(jià),并外送合成。鑒定引物擴(kuò)增的效果,最終構(gòu)建擴(kuò)增效果較好的多重反應(yīng)體系1。從安徽石臺(tái)、和縣、樅... 

【文章來(lái)源】：蘇州大學(xué)江蘇省

【文章頁(yè)數(shù)】：68 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中湖北釘螺的核苷酸序列數(shù)

SciRoKo軟件篩選出的含有完全重復(fù)序列片段的位點(diǎn)

圖 2-1 湖北釘螺樣本采集點(diǎn)（綠色菱形為采樣地點(diǎn)，藍(lán)色區(qū)域?yàn)楹矗?.2 實(shí)驗(yàn)室逸蚴經(jīng)實(shí)驗(yàn)室逸蚴無(wú)血吸蟲尾蚴逸出的釘螺，室內(nèi)無(wú)水乙醇保存用于后續(xù)分析。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]2016年安徽省血吸蟲病疫情分析[J]. 高風(fēng)華,張世清,汪天平,何家昶,許曉娟,李婷婷,張功華,汪昊.  熱帶病與寄生蟲學(xué). 2017(03)
[3]2005～2014年江蘇省血吸蟲病疫情分析[J]. 楊秀芹,張鍵鋒.  熱帶病與寄生蟲學(xué). 2017(01)
[4]2015年全國(guó)血吸蟲病疫情通報(bào)[J]. 張利娟,徐志敏,錢穎駿,黨輝,呂山,許靜,李石柱,周曉農(nóng).  中國(guó)血吸蟲病防治雜志. 2016(06)
[5]基于微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的山東微山湖區(qū)放養(yǎng)釘螺遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 何健,繆峰,楊坤,趙長(zhǎng)磊,劉新.  中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2016(03)
[6]湖沼型血吸蟲病流行區(qū)氣候因素與釘螺分布的空間回歸分析[J]. 陳艷艷,蔡順祥,劉建兵,肖瑛,蔣湧,代凌峰.  中華疾病控制雜志. 2015(03)
[7]消除血吸蟲病——我國(guó)血吸蟲病防治工作的新目標(biāo)與新任務(wù)[J]. 雷正龍,周曉農(nóng).  中國(guó)血吸蟲病防治雜志. 2015(01)
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[10]長(zhǎng)江下游3省湖北釘螺不同地理種群的群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[J]. 崔斌,霍志萍,楊坤,張麗,楊頻,尤平,李石柱.  中國(guó)血吸蟲病防治雜志. 2013(06)

碩士論文
[1]基于時(shí)空與遺傳信息的江蘇省江灘釘螺分布規(guī)律研究[D]. 何健.江蘇省血吸蟲病防治研究所 2016
[2]湖北釘螺（Oncomelania hupensis）微衛(wèi)星DNA文庫(kù)的建立及多態(tài)性位點(diǎn)的篩選[D]. 王藝秀.陜西師范大學(xué) 2009



本文編號(hào)：2926489