應用微衛(wèi)星位點研究安徽、江蘇地區(qū)湖北釘螺的群體遺傳結構
發(fā)布時間:2020-12-19 20:01
目的:湖北釘螺是日本血吸蟲唯一中間宿主,在血吸蟲病傳播過程中起關鍵作用。湖北釘螺微衛(wèi)星DNA庫建立之后,為后續(xù)微衛(wèi)星位點的篩選提供了豐富的儲存庫,但庫中的位點卻未被充分利用。因此,本文利用生物信息學方法篩選多態(tài)性的微衛(wèi)星位點,設計并合成相應的引物,為后續(xù)的群體遺傳學分析提供有效的分子標志。湖北釘螺的地理分布與日本血吸蟲病的流行區(qū)具有嚴格的一致性,主要分布在我國的長江流域以及南部地區(qū)。受到分布范圍廣、地理隔離以及滋生環(huán)境復雜等因素的影響,不同地理群體的湖北釘螺發(fā)生了明顯的分化和變異。因此,本研究通過對不同地區(qū)的湖北釘螺進行群體遺傳學研究,以期找出遺傳變異的規(guī)律,為低流行水平狀態(tài)下評價湖北釘螺控制措施效果和監(jiān)測釘螺擴散提供科學依據(jù)。方法:從公共數(shù)據(jù)庫(Genbank)中下載湖北釘螺的核苷酸序列,使用SciRoKo3.3軟件查找微衛(wèi)星序列,從中挑選微衛(wèi)星位點(以3核苷酸重復片段為主),同時從已發(fā)表文獻中挑取多態(tài)性的微衛(wèi)星位點。然后,利用軟件Primer premier和Oligo來進行引物的設計和評價,并外送合成。鑒定引物擴增的效果,最終構建擴增效果較好的多重反應體系1。從安徽石臺、和縣、樅...
【文章來源】:蘇州大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
GenBank數(shù)據(jù)庫中湖北釘螺的核苷酸序列數(shù)
SciRoKo軟件篩選出的含有完全重復序列片段的位點
圖 2-1 湖北釘螺樣本采集點(綠色菱形為采樣地點,藍色區(qū)域為湖泊)1.2 實驗室逸蚴經(jīng)實驗室逸蚴無血吸蟲尾蚴逸出的釘螺,室內無水乙醇保存用于后續(xù)分析。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2016年全國血吸蟲病監(jiān)測點疫情分析[J]. 金嘉寧,黨輝,張利娟,錢穎駿,呂山,李石柱,周曉農,孫軍玲,許靜. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2017(06)
[2]2016年安徽省血吸蟲病疫情分析[J]. 高風華,張世清,汪天平,何家昶,許曉娟,李婷婷,張功華,汪昊. 熱帶病與寄生蟲學. 2017(03)
[3]2005~2014年江蘇省血吸蟲病疫情分析[J]. 楊秀芹,張鍵鋒. 熱帶病與寄生蟲學. 2017(01)
[4]2015年全國血吸蟲病疫情通報[J]. 張利娟,徐志敏,錢穎駿,黨輝,呂山,許靜,李石柱,周曉農. 中國血吸蟲病防治雜志. 2016(06)
[5]基于微衛(wèi)星DNA標記的山東微山湖區(qū)放養(yǎng)釘螺遺傳結構分析[J]. 何健,繆峰,楊坤,趙長磊,劉新. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2016(03)
[6]湖沼型血吸蟲病流行區(qū)氣候因素與釘螺分布的空間回歸分析[J]. 陳艷艷,蔡順祥,劉建兵,肖瑛,蔣湧,代凌峰. 中華疾病控制雜志. 2015(03)
[7]消除血吸蟲病——我國血吸蟲病防治工作的新目標與新任務[J]. 雷正龍,周曉農. 中國血吸蟲病防治雜志. 2015(01)
[8]分子生態(tài)學的研究技術和方法及其在植物種群遺傳學中的應用[J]. 金海峰. 環(huán)境與發(fā)展. 2014(08)
[9]基于微衛(wèi)星標記的不同殼型湖北釘螺小尺度景觀群體遺傳結構研究[J]. 崔斌,官威,尤平,李石柱. 中國人獸共患病學報. 2014(07)
[10]長江下游3省湖北釘螺不同地理種群的群體遺傳結構研究[J]. 崔斌,霍志萍,楊坤,張麗,楊頻,尤平,李石柱. 中國血吸蟲病防治雜志. 2013(06)
碩士論文
[1]基于時空與遺傳信息的江蘇省江灘釘螺分布規(guī)律研究[D]. 何健.江蘇省血吸蟲病防治研究所 2016
[2]湖北釘螺(Oncomelania hupensis)微衛(wèi)星DNA文庫的建立及多態(tài)性位點的篩選[D]. 王藝秀.陜西師范大學 2009
本文編號:2926489
【文章來源】:蘇州大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
GenBank數(shù)據(jù)庫中湖北釘螺的核苷酸序列數(shù)
SciRoKo軟件篩選出的含有完全重復序列片段的位點
圖 2-1 湖北釘螺樣本采集點(綠色菱形為采樣地點,藍色區(qū)域為湖泊)1.2 實驗室逸蚴經(jīng)實驗室逸蚴無血吸蟲尾蚴逸出的釘螺,室內無水乙醇保存用于后續(xù)分析。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2016年全國血吸蟲病監(jiān)測點疫情分析[J]. 金嘉寧,黨輝,張利娟,錢穎駿,呂山,李石柱,周曉農,孫軍玲,許靜. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2017(06)
[2]2016年安徽省血吸蟲病疫情分析[J]. 高風華,張世清,汪天平,何家昶,許曉娟,李婷婷,張功華,汪昊. 熱帶病與寄生蟲學. 2017(03)
[3]2005~2014年江蘇省血吸蟲病疫情分析[J]. 楊秀芹,張鍵鋒. 熱帶病與寄生蟲學. 2017(01)
[4]2015年全國血吸蟲病疫情通報[J]. 張利娟,徐志敏,錢穎駿,黨輝,呂山,許靜,李石柱,周曉農. 中國血吸蟲病防治雜志. 2016(06)
[5]基于微衛(wèi)星DNA標記的山東微山湖區(qū)放養(yǎng)釘螺遺傳結構分析[J]. 何健,繆峰,楊坤,趙長磊,劉新. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2016(03)
[6]湖沼型血吸蟲病流行區(qū)氣候因素與釘螺分布的空間回歸分析[J]. 陳艷艷,蔡順祥,劉建兵,肖瑛,蔣湧,代凌峰. 中華疾病控制雜志. 2015(03)
[7]消除血吸蟲病——我國血吸蟲病防治工作的新目標與新任務[J]. 雷正龍,周曉農. 中國血吸蟲病防治雜志. 2015(01)
[8]分子生態(tài)學的研究技術和方法及其在植物種群遺傳學中的應用[J]. 金海峰. 環(huán)境與發(fā)展. 2014(08)
[9]基于微衛(wèi)星標記的不同殼型湖北釘螺小尺度景觀群體遺傳結構研究[J]. 崔斌,官威,尤平,李石柱. 中國人獸共患病學報. 2014(07)
[10]長江下游3省湖北釘螺不同地理種群的群體遺傳結構研究[J]. 崔斌,霍志萍,楊坤,張麗,楊頻,尤平,李石柱. 中國血吸蟲病防治雜志. 2013(06)
碩士論文
[1]基于時空與遺傳信息的江蘇省江灘釘螺分布規(guī)律研究[D]. 何健.江蘇省血吸蟲病防治研究所 2016
[2]湖北釘螺(Oncomelania hupensis)微衛(wèi)星DNA文庫的建立及多態(tài)性位點的篩選[D]. 王藝秀.陜西師范大學 2009
本文編號:2926489
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