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基于適配體散射探針、CSDPR的食源性致病菌快速檢測

發(fā)布時間:2020-02-02 10:52
【摘要】:在全球化背景下,由食源性致病菌引起的疾病呈現(xiàn)高發(fā)態(tài)勢,嚴(yán)重威脅人們的健康,阻礙社會經(jīng)濟(jì)的發(fā)展,成為全球共同關(guān)注的問題。食品在生產(chǎn)加工、運(yùn)輸貯存以及銷售等各個環(huán)節(jié)都可能受到細(xì)菌的污染,而且食品工業(yè)門類多、產(chǎn)量大、流通廣,所以需要快速有效、成本友好、設(shè)計簡單的細(xì)菌檢測手段來確保食品過程的安全。隨著核酸研究的不斷發(fā)展,具有特異性識別能力的功能核酸,尤其是核酸適配體和分子信標(biāo),因其方便合成、易于修飾、穩(wěn)定性好、特異性高等特點(diǎn)在食品安全領(lǐng)域展現(xiàn)出巨大的應(yīng)用潛力。本論文分別基于核酸適配體對菌細(xì)胞表面特殊位點(diǎn)的識別和分子信標(biāo)對細(xì)菌特異性核酸的識別構(gòu)建了兩種不同的食源性致病菌快速檢測方法。(1)以36XC學(xué)生顯微鏡為基礎(chǔ),自制套筒式連接器安裝暗場聚光鏡,自制高度調(diào)節(jié)指針指示焦點(diǎn)高度,將36XC顯微鏡改造成便攜式暗場顯微鏡作為檢測設(shè)備。采用檸檬酸三鈉還原法合成粒徑60 nm的金納米顆粒,并用紫外可見光譜儀和透射電子顯微鏡表征。將修飾核酸適配體的金納米顆粒作為識別目標(biāo)和報告信號的功能化散射探針。使用透射電子顯微鏡表征散射探針對目標(biāo)的結(jié)合能力,發(fā)現(xiàn)細(xì)菌表面的完整性是細(xì)菌能和適配體結(jié)合的必要條件,證明功能化金納米顆粒散射探針檢測的是金黃色葡萄球菌活菌。暗場鏡檢采用10倍物鏡,分為直接暗場鏡檢和間接暗場鏡檢。直接暗場鏡檢通過觀察聚集在目標(biāo)表面的散射探針發(fā)出的葡萄串狀分布散射光點(diǎn)來實(shí)現(xiàn)對金黃色葡萄球菌的可視化識別;間接暗場鏡檢的第一步是過濾洗去未結(jié)合的功能化金納米探針,再將細(xì)菌表面結(jié)合的散射探針洗脫分離并對分離出的金納米顆粒進(jìn)行暗場鏡檢,通過多步特異性分離的方法檢驗(yàn)?zāi)繕?biāo)物的存在。對不同濃度的金黃色葡萄球菌分別采取間接暗場鏡檢法進(jìn)行定性的檢測分析,結(jié)果顯示對金黃色葡萄球菌的陽性判定檢測限為4.6×10~6CFU/m L。通過將分離步驟中使用的水系針式過濾器替換為核酸純化柱,優(yōu)化了過濾洗滌和洗脫的操作,將方法的檢測限降低為2.9×10~3 CFU/m L,實(shí)現(xiàn)三個數(shù)量級的靈敏度改進(jìn),而且通過簡單的前處理即可實(shí)現(xiàn)實(shí)際牛奶樣品中金黃色葡萄球菌的檢測。(2)基于循環(huán)鏈置換聚合酶反應(yīng)(CSDPR)原理,以金黃色葡萄球菌、沙門氏菌、腸出血性大腸埃希氏菌(EHEC)和志賀氏菌為目標(biāo)細(xì)菌,選取目標(biāo)細(xì)菌特異性的基因區(qū)間設(shè)計分子信標(biāo)熒光探針和循環(huán)引物,建立CSDPR反應(yīng)體系。通過優(yōu)化實(shí)驗(yàn)確定分子信標(biāo)熒光探針莖結(jié)構(gòu)的最佳長度為8 nt;探針和引物的最佳濃度均為200 nmol/L。針對以上四種目標(biāo)菌,以非致病性大腸埃希氏菌、表皮葡萄球菌、白色葡萄球菌等額外六種細(xì)菌為對照菌,探究CSDPR檢測方法下探針的特異性,結(jié)果顯示金黃色葡萄球菌探針能夠精確鑒定到相應(yīng)的菌種(species),EHEC探針能夠特異性鑒定EHEC,沙門氏菌和志賀氏菌探針則能鑒定到相應(yīng)的菌屬(genus)。以各稀釋梯度的四種目標(biāo)菌基因組DNA為模板,進(jìn)行CSDPR擴(kuò)增反應(yīng),建立定量CSDPR模型,實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)細(xì)菌的定量檢測。其中,對金黃色葡萄球菌的定量分析線性范圍為2×10~5~2.5×10~6 CFU/m L,檢測限為9.5×10~4 CFU/m L;對沙門氏菌、EHEC、志賀氏菌的定量分析線性范圍為1.0×10~4~1.0×10~6 CFU/m L,檢測限分別為4.8×10~4 CFU/m L、3.4×10~4 CFU/m L、3.0×10~4CFU/m L。以金黃色葡萄球菌為目標(biāo)菌,人工添加低濃度(9.2×10~1 CFU/m L、9.2×10~2CFU/m L、9.2×10~3 CFU/m L)的金黃色葡萄球菌至牛排、牛奶樣品中進(jìn)行增菌培養(yǎng),分別于4 h、6 h、8 h、10 h、12 h五個時間點(diǎn)對菌液進(jìn)行平板計數(shù)和定量CSDPR檢測,并比較平板計數(shù)和定量分析的結(jié)果。結(jié)果顯示通過最短6 h的增菌培養(yǎng)即可檢出國標(biāo)限量濃度下的金黃色葡萄球菌;在牛排樣品和牛奶樣品中金黃色葡萄球菌的平板計數(shù)結(jié)果和CSDPR定量檢測結(jié)果的平均相對誤差分別為14.5%和11.4%。
【圖文】:

暗場顯微鏡,實(shí)物,結(jié)構(gòu)示意圖,連接器


第二章 適配體功能化金納米散射探針檢測金黃色葡萄球菌光鏡相連后,通過接件外側(cè)自鎖性較好的三角形螺紋同螺帽式接件連接。因?yàn)槁菝笔浇蛹隙司哂泻洼d物臺中央螺旋接口吻合的三角螺紋,所以套筒式連接器可以整體連接在載物臺下。通過轉(zhuǎn)動螺栓式接件,可以調(diào)整暗場聚光鏡的高度,使其與載物臺上表面吻合,也可以輔助調(diào)節(jié)焦點(diǎn)高度。改裝后的暗場顯微鏡,既可以直接用肉眼通過目鏡觀察,也可以使用 CCD 接口連接的相機(jī)進(jìn)行觀察和拍攝。為了便于在樣品觀察時進(jìn)行快速聚焦調(diào)節(jié),,在圖 2-1(c)和(d)中圈出的位置標(biāo)上記號,用一片通過強(qiáng)力膠粘在載物臺邊緣的載玻片作為高度指針。在使用 10 倍物鏡觀察時,調(diào)節(jié)粗準(zhǔn)焦螺旋至高度指針上表面與圓圈處標(biāo)記持平,此時目鏡中觀察到的即為載玻片的上表面(蓋玻片的下表面)處的待觀測物,繼續(xù)調(diào)節(jié)細(xì)準(zhǔn)焦螺旋即可看清樣品。這個微小的設(shè)計可以有效縮短焦距調(diào)節(jié)時間,也可以避免錯誤對焦(比如焦點(diǎn)對準(zhǔn)的是載玻片下表面)引起的錯誤觀察。

透射電鏡,金納米顆粒,紫外可見吸收光譜,透射電鏡


江南大學(xué)碩士學(xué)位論文納米顆粒的表征外可見吸收光譜對前面合成的金納米顆粒進(jìn)行表征后得到如圖 2-2(a)所光譜中有一個單一吸收峰出現(xiàn)在 532 nm 附近,峰寬較窄,證明金納米顆徑大小較為接近,可以作為良好載體進(jìn)行核酸適配體修飾。根據(jù) Haiss 等米粒徑與紫外可見吸收峰的關(guān)系可以得出當(dāng)峰值在 532 nm 時,其粒徑大。圖 2-2(b)是金納米顆粒的透射電鏡圖,由圖可知,金納米顆粒的粒徑分散性較好,粒徑分布較為均一,符合預(yù)期,也與紫外可見吸收光譜圖的
【學(xué)位授予單位】:江南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R155.3

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2575687

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