云南省部分地區(qū)蜱攜帶彈狀病毒的調(diào)查研究
本文選題:云南省 + 高通量測序; 參考:《大理大學》2017年碩士論文
【摘要】:目的:為了了解云南省蜱攜帶病毒的現(xiàn)狀,掌握蜱攜帶病毒的分布、感染和遺傳進化情況,為相關疾病的防治提供科學指導。方法:首先采用高通量測序方法獲得樣品中的病毒譜,再根據(jù)病毒的核苷酸序列設計特異性引物,用RT-PCR的方法來檢測蜱攜帶病毒的感染現(xiàn)狀,并對陽性樣品進行病毒分離。對重要病毒擴增病毒基因組序列,用生物信息學軟件進行遺傳進化分析;原核細胞表達病毒核衣殼蛋白,并免疫兔子制備表達蛋白的抗體。結果:高通量測序獲得的樣品的核酸讀數(shù)總數(shù)為12596條,獲得6株病毒,其中1株病毒被命名為云南蜱攜帶病毒2(Yunnan Tick Virus2,YNTV2),其與在武漢發(fā)現(xiàn)的武漢蜱攜帶病毒1(Wuhan Tick virus 1,WHTV1)的同源性為96%,屬于未分類的迪瑪彈狀病毒1類(Unclassified Dimarhabdovirus 1);YNTV2在云南省4個縣蜱中的感染率由高到低分別為:怒江州瀘水縣45.24㳠(38/84)、大理州賓川縣16.13%(5/31)、紅河州瀘西縣9.09%(4/44)和大理州洱源縣5.26㳠(1/19)。對YNTV2進行病毒分離,未獲得成功。用原核細胞表達和純化了YNTV2的核衣殼蛋白,并制備了抗體。結論:云南省4縣蜱攜帶的病毒主要是布尼亞病毒科、彈狀病毒科和其它一些未分類的病毒,呈現(xiàn)病毒遺傳多樣性的特點。YNTV2在云南4個調(diào)查的縣中,瀘水縣的感染率最高。原核細胞表達和純化的YNTV2核衣殼蛋白可用于血清流行病學調(diào)查。
[Abstract]:Objective : To understand the present situation of tick - borne viruses in Yunnan province , to grasp the distribution , infection and genetic evolution of tick - borne viruses , and to provide scientific guidance for the prevention and treatment of related diseases .
【學位授予單位】:大理大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:R181.3
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,本文編號:1817343
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