云南省部分地區(qū)蜱攜帶彈狀病毒的調(diào)查研究
本文選題:云南省 + 高通量測(cè)序。 參考:《大理大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:目的:為了了解云南省蜱攜帶病毒的現(xiàn)狀,掌握蜱攜帶病毒的分布、感染和遺傳進(jìn)化情況,為相關(guān)疾病的防治提供科學(xué)指導(dǎo)。方法:首先采用高通量測(cè)序方法獲得樣品中的病毒譜,再根據(jù)病毒的核苷酸序列設(shè)計(jì)特異性引物,用RT-PCR的方法來(lái)檢測(cè)蜱攜帶病毒的感染現(xiàn)狀,并對(duì)陽(yáng)性樣品進(jìn)行病毒分離。對(duì)重要病毒擴(kuò)增病毒基因組序列,用生物信息學(xué)軟件進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析;原核細(xì)胞表達(dá)病毒核衣殼蛋白,并免疫兔子制備表達(dá)蛋白的抗體。結(jié)果:高通量測(cè)序獲得的樣品的核酸讀數(shù)總數(shù)為12596條,獲得6株病毒,其中1株病毒被命名為云南蜱攜帶病毒2(Yunnan Tick Virus2,YNTV2),其與在武漢發(fā)現(xiàn)的武漢蜱攜帶病毒1(Wuhan Tick virus 1,WHTV1)的同源性為96%,屬于未分類的迪瑪彈狀病毒1類(Unclassified Dimarhabdovirus 1);YNTV2在云南省4個(gè)縣蜱中的感染率由高到低分別為:怒江州瀘水縣45.24㳠(38/84)、大理州賓川縣16.13%(5/31)、紅河州瀘西縣9.09%(4/44)和大理州洱源縣5.26㳠(1/19)。對(duì)YNTV2進(jìn)行病毒分離,未獲得成功。用原核細(xì)胞表達(dá)和純化了YNTV2的核衣殼蛋白,并制備了抗體。結(jié)論:云南省4縣蜱攜帶的病毒主要是布尼亞病毒科、彈狀病毒科和其它一些未分類的病毒,呈現(xiàn)病毒遺傳多樣性的特點(diǎn)。YNTV2在云南4個(gè)調(diào)查的縣中,瀘水縣的感染率最高。原核細(xì)胞表達(dá)和純化的YNTV2核衣殼蛋白可用于血清流行病學(xué)調(diào)查。
[Abstract]:Objective : To understand the present situation of tick - borne viruses in Yunnan province , to grasp the distribution , infection and genetic evolution of tick - borne viruses , and to provide scientific guidance for the prevention and treatment of related diseases .
【學(xué)位授予單位】:大理大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R181.3
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1817343
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