2011-2014年福建省手足口病相關病原柯薩奇病毒A組4型的分子流行病學分析
本文選題:手足口病 + 柯薩奇病毒A ; 參考:《中國人獸共患病學報》2017年09期
【摘要】:目的分析福建省手足口病患者中柯薩奇病毒A組4型(Coxsackievirus A4,CVA4)的流行病學、基因變異及遺傳進化等特征。方法應用細胞培養(yǎng)方法獲得病毒分離株,RT-PCR方法進行分子分型及擴增CVA4血清型完整VP1區(qū)全長序列,并進行序列變異及遺傳進化分析。結果 2011-2014年,從福建省手足口病其它腸道病毒病例標本中分子分型33例CVA4病例,在407例的其它腸道病毒病例中的構成比為8.1%,其中2012年31例,2014年2例。CVA4病例在性別、年齡組分布特征,與一般手足口病流行特征相比,沒有特異性。VP1區(qū)序列差異比較表明,2011-2014年福建省CVA4分離株之間VP1核苷酸及氨基酸序列相似性分別在92.6%~100%、95.7%~100%;與原型株及國外地方株的核苷酸序列相似性較低,分別為83.7%~85.4%、82.1%~89.1%,氨基酸序列相似性分別為96.1%~99.0%、90.4%~99.6%;與國內(nèi)地方株核苷酸及氨基酸序列相似性較高,分別為87.9%~99.2%、96.1%~100%。進化樹結果表明福建CVA4分離株與原型株及國外代表株的遺傳距離遠,與國內(nèi)代表株的遺傳距離近。福建CVA4分離株在進化樹的分布呈多個分支。結論 CVA4已成為近年來福建省除EV71、CVA16、CVA6、CVA10外導致手足口病的又一重要病原體。福建CVA4分離株與國內(nèi)地方株同進化共循環(huán),在福建省各個地區(qū)同時流行多條親緣關系接近的傳播鏈。
[Abstract]:Objective to analyze the epidemiology, genetic variation and genetic evolution of coxsackievirus A group 4 (Coxsackievirus A4) in patients with hand, foot and mouth disease (HFMD) in Fujian Province. Methods the full-length VP1 region of CVA4 serotype was amplified by RT-PCR with cell culture method, and the sequence variation and genetic evolution were analyzed. Results from 2011 to 2014, 33 cases of CVA4 were classified from other enterovirus specimens of hand, foot and mouth disease in Fujian Province, and the constituent ratio of other enterovirus cases was 8.1 in 407 cases, including 31 cases in 2012 and 2 cases in 2014. Compared with the epidemic characteristics of hand, foot and mouth disease, the distribution of age group, There was no specific sequence difference in VP1 region. The results showed that the similarity of nucleotide and amino acid sequence of VP1 among CVA4 isolates in Fujian Province from 2011 to 2014 was 92.6% and 95.775%, respectively, and the nucleotide sequence similarity was low with the prototype strain and foreign local strain. The similarity of amino acid sequence was 96.1 and 99.0, 99.0 and 99.6, respectively, and the similarity of nucleotide and amino acid sequence with local strains was 87.9 and 99.21, respectively. The results of phylogenetic tree showed that the genetic distance between Fujian CVA4 isolates and prototypes and foreign representative strains was long and close to that of domestic representative strains. The distribution of Fujian CVA4 isolates in phylogenetic tree showed multiple branches. Conclusion CVA4 has become an important pathogen of HFMD in Fujian Province in recent years, in addition to EV71, CVA16, CVA6, CVA10. The CVA4 isolates of Fujian and the local strains in China have the same evolution and cocirculation, and there are many transmission chains with close genetic relationship in different areas of Fujian Province.
【作者單位】: 福建省疾病預防控制中心;
【基金】:福建省自然科學基金(No.2016J01350) 福建省衛(wèi)計委青年科研課題(No.2014-1-25)聯(lián)合資助~~
【分類號】:R181.3;R725.1
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,本文編號:1780787
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