浙江省寧波市2016年流行性腮腺炎病毒基因型特征分析
發(fā)布時間:2018-03-01 15:36
本文關(guān)鍵詞: 流行性腮腺炎病毒 基因型 進(jìn)化樹 出處:《中國疫苗和免疫》2017年04期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的了解寧波市2016年流行性腮腺炎病毒(Mumps virus,Mu V)基因型特征。方法采用Vero/SLAM細(xì)胞分離Mu V,對Mu V毒株小疏水蛋白(Small hydrophobic protein,SH)基因進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增和序列測定,與Gen Bank中參考株序列進(jìn)行比較。結(jié)果寧波市2016年共分離到5株Mu V,均為F基因型,核苷酸及氨基酸之間同源性分別為95.07%和94.74%;與F基因型參考株Z77161同源性分別為96.42%-97.09%和94.74%-96.49%;與中國疫苗株S79同源性分別為80.66%-81.52%和73.68%-75.44%;與中國其他地區(qū)F基因型之間同源性分別為95.05%-97.42%和91.23%-96.49%。結(jié)論 2016年寧波地區(qū)Mu V流行株均為F基因型,未發(fā)現(xiàn)SH基因變異。
[Abstract]:Objective to investigate the genotypic characteristics of mumps virus Mumps virus (Mumps virus) Mu V in Ningbo on 2016. Methods the small hydrophobic protein SHV gene of Mumps virus strain was isolated by Vero/SLAM cells and amplified by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and sequenced. Results in 2016, five strains of Mu V were isolated in Ningbo, all of which were F genotype. The homology between nucleotide and amino acid was 95.07% and 94.74, the homology with F genotype reference strain Z77161 was 96.42-97.09% and 94.74-96.49m, with Chinese vaccine strain S79 was 80.66-81.52% and 73.68-75.44g, respectively. Conclusion in 2016, the epidemic strains of Mu V in Ningbo were all F genotypes. No SH gene mutation was found.
【作者單位】: 寧波市疾病預(yù)防控制中心;
【基金】:浙江省醫(yī)學(xué)重點(diǎn)學(xué)科(編號:07-013) 寧波市自然科學(xué)基金(編號:2016A610020)
【分類號】:R181.3;R512.1
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,本文編號:1552566
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