手足口病主要流行于嬰幼兒群體,引起患者發(fā)熱、口腔潰瘍以及手腳出現(xiàn)皮疹。腸道病毒EV71是手足口病的主要病原體之一,與其他病原體相比,它還會引發(fā)神經(jīng)系統(tǒng)并發(fā)癥。目前并沒有特效的抗EV71病毒藥物。2A蛋白酶、3C蛋白酶是病毒自身編碼的兩個半胱氨酸蛋白酶,基于相同的酶切機制,但在病毒的生命周期中發(fā)揮不同的功能。2Apro切割病毒前體蛋白VP1-2A之間的位點,其余均由3Cpro負責(zé)。除此之外,它們在病毒復(fù)制、劫持宿主蛋白翻譯、抑制天然免疫機制等過程中扮演著十分關(guān)鍵但又不同的角色,因此被看做抗病毒藥物設(shè)計的切入口。基于片段的藥物設(shè)計是發(fā)現(xiàn)新穎先導(dǎo)化合物的有效方法之一,我們以EV713C蛋白酶晶體為基礎(chǔ)對片段庫進行篩選。在第一輪片段庫篩選中,發(fā)現(xiàn)片段953、片段2139疑似結(jié)合在3C蛋白酶的RNA結(jié)合區(qū)域與活性口袋(S1'),并通過一維核磁實驗驗證相互作用。通過連接或者融合片段2139與2-Phenylquinolone(位于口袋S1)設(shè)計若干個小分子化合物進行Docking。Schrodinger軟件包下載Glide做模擬對接,預(yù)測蛋白與小分子的結(jié)合模式和強弱。我們對具有催化活性的EV71 2...

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【學(xué)位級別】：碩士

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圖１．２：腸道病毒ＥＶ７１的流行基因型鑒定１７１??Ｆｉｇｕｒｅ?１．２：?Ｅｎｔｅｒｏｖｉｒｕｓ?７１?（ＥＶ７１）?ｇｅｎｏｔｙｐｅｓ?ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ?ｆｒｏｍ?ｏｕｔｂｒｅａｋｓ１７１．??２??

ＥＶ７１型感染逐漸成為手足口病致病致死的主要原因，伴隨ＣＮＳ并??發(fā)癥的患者在流行期間的死亡率可達到３０％－４０％。ＥＶ７１有不同亞型，它們在亞??太地區(qū)、歐洲出現(xiàn)的情況如圖１．２所示，Ｃ４型流行于中國大陸、香港、韓國、越??南，而日本、臺灣、馬來西亞等地區(qū)為８５型［７］。??Ｅ....

圖１．４：?ＥＶ７１病毒顆粒的結(jié)構(gòu)１７１??丨７丨．??

毒衣殼的內(nèi)部。??１．２．２?ＥＶ７１生活史與致病機制??ＥＶ７１?（小ＲＮＡ病毒）的生活史可概述為如圖１．５所示，主要包括吸附、脫??殼和進入、基因組ＲＮＡ合成、蛋白質(zhì)翻譯與加工、病毒顆粒組裝與釋放［１５］。首??先，病毒進入宿主細胞依賴于特異性識別受體，如人類清道夫受體Ｂ類２....

圖１．５：小ＲＮＡ病毒復(fù)制的圖形概述１１５１??Ｆｉｇｕｒｅ?１．５：?Ｇｒａｐｈｉｃａｌ?ｏｖｅｒｖｉｅｗ?ｏｆ?ｐｉｃｏｒｎａｖｉｒｕｓ?ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ１＾１．??＇

Ｉ?ＶＰ３－??Ｖｖ＿／Ｙ／??圖１．４：?ＥＶ７１病毒顆粒的結(jié)構(gòu)１７１??Ｆｉｇｕｒｅ?１．４：?Ｓｃｈｅｍａｔｉｃ?ｉｌｌｕｓｔｒａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｅｎｔｅｒｏｖｉｒｕｓ?７１?ｖｉｒｉｏｎ丨７丨．??ＥＶ７１的形狀為無包膜的正二十面體，由四種結(jié)構(gòu)蛋白形成一個原聚體，五個原?....

圖1.6:不同小RNA病毒3C蛋白酶序列比對I31]

Ｆｉｇｕｒｅ?１．６：?Ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ａｌｉｇｎｍｅｎｔ?ｏｆ３Ｃ?ｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ?ｆｒｏｍ?ｐｉｃｏｒｎａｖｉｒｕｓ?｜３）｜．??序列頂部標注顯示二級結(jié)構(gòu)，（３－ｒｉｂｂｏｎ?（星號表示鉸鏈兩端殘基Ｇｌｙ１２３、??Ｈｉｓｌ３３）；?３Ｃ蛋白酶中相同氨基酸用紅色背景....

本文編號：4026081