識(shí)別化合物-蛋白質(zhì)相互作用在藥物發(fā)現(xiàn)和藥物設(shè)計(jì)中起到至關(guān)重要的作用,它為理解藥物的藥效、靶向以及不良副作用提供了有價(jià)值的參考。傳統(tǒng)的方法主要是通過(guò)實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證化合物和蛋白質(zhì)之間的相互作用關(guān)系,這種方法費(fèi)時(shí)、費(fèi)力,且不可能對(duì)所有的化合物、蛋白質(zhì)逐一驗(yàn)證,具有很大的局限性。而通過(guò)計(jì)算的方法預(yù)測(cè)化合物-蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系,可以利用計(jì)算機(jī)強(qiáng)大的計(jì)算能力以及并行計(jì)算算法大幅減少預(yù)測(cè)時(shí)間,而且預(yù)測(cè)過(guò)程具有快捷智能、成本低廉、覆蓋面廣的特點(diǎn),因此這類方法相比于實(shí)驗(yàn)方法具有獨(dú)特的應(yīng)用價(jià)值。識(shí)別化合物-蛋白質(zhì)相互作用的計(jì)算方法很多,目前主流是分子對(duì)接（Docking）技術(shù),其根據(jù)配體與受體作用的“鎖-鑰原理”,來(lái)模擬小分子配體與受體生物大分子相互作用。然而,該方法需要化學(xué)專業(yè)知識(shí)為背景,對(duì)于普通計(jì)算機(jī)專業(yè)人士難以勝任,并且準(zhǔn)確率不高。深度學(xué)習(xí)技術(shù)的發(fā)展,大大減輕了編程人員對(duì)專業(yè)背景知識(shí)的要求,為識(shí)別化合物-蛋白質(zhì)相互作用提供了新的可能性。本文的主要工作是構(gòu)建了一個(gè)深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,輸入層為2640維的向量,代表化合物的2640個(gè)特征數(shù)字,輸出層為10維的向量,代表10種不同的蛋白質(zhì)。模型采用反向傳播算法,... 

【文章來(lái)源】：蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：56 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

一張同時(shí)包括山景、海灘、小船的風(fēng)景圖

圖 2-2 人的神經(jīng)元結(jié)構(gòu)如圖，神經(jīng)元大致可以分為樹(shù)突（Dendrite）、突觸末梢（Synaptic term體（Cell body）和軸突（Axon）。樹(shù)突為神經(jīng)元的輸入通道，其功能經(jīng)元的動(dòng)作電位傳遞至細(xì)胞體。其他神經(jīng)元的動(dòng)作電位借由位于樹(shù)突個(gè)突觸傳遞至樹(shù)突上。神經(jīng)細(xì)胞有兩種狀態(tài)：激活和未激活。當(dāng)從其接收到的信號(hào)量超過(guò)某個(gè)閾值時(shí)，就會(huì)達(dá)到激活狀態(tài)，否則，就是未外，突觸的不同性質(zhì)：抑制或加強(qiáng)也會(huì)對(duì)激活與否造成影響。激活狀生電脈沖，電脈沖經(jīng)過(guò)軸突、突觸再傳遞到其它神經(jīng)元。在神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)元就好像人腦的一個(gè)神經(jīng)元：接收信息，經(jīng)過(guò)一系列函數(shù)，將輸入信后再發(fā)送出去。

圖 2-2 人的神經(jīng)元結(jié)構(gòu)，神經(jīng)元大致可以分為樹(shù)突（Dendrite）、突觸末梢（Synaptic tCell body）和軸突（Axon）。樹(shù)突為神經(jīng)元的輸入通道，其功的動(dòng)作電位傳遞至細(xì)胞體。其他神經(jīng)元的動(dòng)作電位借由位于樹(shù)觸傳遞至樹(shù)突上。神經(jīng)細(xì)胞有兩種狀態(tài)：激活和未激活。當(dāng)從到的信號(hào)量超過(guò)某個(gè)閾值時(shí)，就會(huì)達(dá)到激活狀態(tài)，否則，就是，突觸的不同性質(zhì)：抑制或加強(qiáng)也會(huì)對(duì)激活與否造成影響。激活脈沖，電脈沖經(jīng)過(guò)軸突、突觸再傳遞到其它神經(jīng)元。在神經(jīng)網(wǎng)好像人腦的一個(gè)神經(jīng)元：接收信息，經(jīng)過(guò)一系列函數(shù)，將輸入發(fā)送出去。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的藥物研發(fā)新模式[J]. 潘家祜.  中國(guó)新藥與臨床雜志. 2009(10)



本文編號(hào)：3544567