計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)對(duì)ALK磷酸激酶抑制劑的研究
發(fā)布時(shí)間:2017-05-09 09:12
本文關(guān)鍵詞:計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)對(duì)ALK磷酸激酶抑制劑的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)的高速發(fā)展,運(yùn)用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)(CADD)的方法研究開發(fā)新型治療肺癌的藥物不僅可以縮短藥物研發(fā)的周期,而且節(jié)省了大量的人力和財(cái)力。諾華公司生產(chǎn)的克唑替尼在治療非小細(xì)胞肺癌具有顯著的療效,可以延長患者的生存期。我們參考了克唑替尼的基本結(jié)構(gòu),利用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的方法分別對(duì)36個(gè)2-;被讲⑦溥蜓苌镆约49個(gè)2,4-二芳基氨基吡啶類似物的化合物進(jìn)行三維定量構(gòu)效關(guān)系(3D-QSAR)研究及蛋白質(zhì)分子對(duì)接(Docking)研究,主要進(jìn)行了以下五個(gè)部分的研究:論文第一章,我們對(duì)蛋白質(zhì)磷酸激酶進(jìn)行了一個(gè)比較詳細(xì)的闡述,通過各項(xiàng)研究表明ALK蛋白質(zhì)磷酸激酶的突變對(duì)各種重大疾病起著至關(guān)重要的作用,具有研究的重大意義。論文的第二章,比較詳細(xì)的介紹了計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的方法,包括三維定量構(gòu)效模型(3D-QSAR)的建立以及分子對(duì)接(Docking),并總結(jié)出結(jié)論計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方法對(duì)于ALK磷酸激酶抑制劑的研究以及新型抑制劑分子的設(shè)計(jì)具有里程碑式的的作用。論文的第三章,介紹了用三維定量構(gòu)效關(guān)系(3D-QSAR)和分子對(duì)接(Docking)方法研究簡單ALK磷酸激酶抑制劑。ALK磷酸激酶抑制劑對(duì)多種重大疾病可以起到良好的作用,ALK已經(jīng)成為藥物研究領(lǐng)域的一個(gè)新靶標(biāo)。本文選用新近發(fā)表的生物活性較好的36個(gè)2-;被讲⑦溥蜓苌镒鳛檠芯繉(duì)象,應(yīng)用三維定量構(gòu)效模型關(guān)系(3D-QSAR)方法和分子對(duì)接(Docking)對(duì)ALK磷酸激酶抑制劑的相互作用進(jìn)行了系統(tǒng)性的研究。研究了化合物的結(jié)構(gòu)與生物活性的關(guān)系,利用比較分子立場分析(CoMFA)方法以及比較分子相似性指數(shù)分析(CoMSIA)方法建立了兩個(gè)模型,更好的分析模型的優(yōu)良性,對(duì)于配體具有良好的可預(yù)測性。利用3D等高線圖以及蛋白質(zhì)的分子對(duì)接(Docking)結(jié)果顯示,不同的核心配體具有不同的生物活性,可以提高生物活性根據(jù)配體結(jié)構(gòu)的不同。利用設(shè)計(jì)的模型結(jié)果進(jìn)行新分子化合物的設(shè)計(jì),選擇性的進(jìn)行合成,篩選,提高生物活性。論文第四章,使用SYBYLX2.0軟件對(duì)49個(gè)2,4-二芳基氨基吡啶類似物化合物進(jìn)行三維定量構(gòu)效關(guān)系(3D-QSAR)研究及蛋白質(zhì)分子對(duì)接(Docking)研究,用數(shù)據(jù)闡述模型的可靠性,對(duì)后續(xù)類似ALK磷酸激酶抑制劑的研究起到至關(guān)重要的作用。論文第五章,對(duì)于文章的中心思想進(jìn)行了總結(jié),闡明用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的方法對(duì)于ALK磷酸激酶抑制劑的研究具有重大的意義。
【關(guān)鍵詞】:計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì) ALK磷酸激酶抑制劑 三維定量構(gòu)效關(guān)系 分子對(duì)接
【學(xué)位授予單位】:上海應(yīng)用技術(shù)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R91
【目錄】:
- 摘要5-6
- abstract6-10
- 第1章 蛋白質(zhì)激酶中的ALK磷酸激酶10-14
- 1.1 前言10-11
- 1.2 蛋白質(zhì)酪氨酸激酶11-12
- 1.2.1 蛋白質(zhì)酪氨酸激酶簡介11
- 1.2.2 受體型蛋白質(zhì)激酶11
- 1.2.3 問變性淋巴瘤激酶11-12
- 1.3 ALK融合蛋白質(zhì)與癌癥12-13
- 1.3.1 ALK及其融合蛋白12
- 1.3.2 間變性大細(xì)胞淋巴瘤12-13
- 1.3.3 非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)13
- 1.3.4 ALK與其他腫瘤13
- 1.4 ALK作為腫瘤治療的新靶點(diǎn)13-14
- 第2章 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)14-21
- 2.1 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的定義14
- 2.2 定量構(gòu)效關(guān)系簡介14-18
- 2.2.1 2D-QSAR簡介15-16
- 2.2.2 3D-QSAR的簡介16-17
- 2.2.3 3D-QSAR的基本步驟17
- 2.2.4 定量構(gòu)效關(guān)系模型穩(wěn)定性和可靠性評(píng)估17-18
- 2.3 分子對(duì)接18-19
- 2.3.1 分子對(duì)接方法原理18-19
- 2.3.2 分子對(duì)接方法的分類19
- 2.3.3 分子對(duì)接方法的基本步驟19
- 2.4 小結(jié)19-21
- 第3章 2-酰基氨基苯并咪唑衍生物的分子研究21-36
- 3.1 研究背景21-22
- 3.2 數(shù)據(jù)的來源22-23
- 3.3 2-;被讲⑦溥蜓苌锏慕Y(jié)構(gòu)與IC_(50)值23-26
- 3.4 化合物的疊合及基本骨架26
- 3.5 3D-QSAR模型26-28
- 3.6 分子對(duì)接28
- 3.7 結(jié)果分析以及新分子的設(shè)計(jì)28-30
- 3.7.1 CoMFA模型以及CoMSIA模型的數(shù)據(jù)結(jié)果分析28-30
- 3.8 3D-QSAR等高線圖30-33
- 3.8.1 CoMFA模型的等高線圖32
- 3.8.2 CoSIA模型的等高線圖32-33
- 3.8.3 3D-QSAR的結(jié)果分析33
- 3.9 分子對(duì)接結(jié)果分析33
- 3.10 新化合物的設(shè)計(jì)與活性預(yù)測33-35
- 3.11 總結(jié)35-36
- 第4章 2,4-二芳基氨基吡啶類似物的分子研究36-51
- 4.1 2,4-二芳基氨基吡啶類似物的結(jié)構(gòu)與生物活性36-40
- 4.2 化合物的骨架疊合40-41
- 4.3 3D-QSAR模型的建立41-43
- 4.4 分子對(duì)接43
- 4.5 結(jié)果分析43-46
- 4.6 3D等高線圖46-49
- 4.6.1 CoMFA模型的等高線圖48
- 4.6.2 CoMSIA模型的等高線圖48-49
- 4.7 3D-QSAR模型的預(yù)測能力49-50
- 4.8 總結(jié)50-51
- 第5章 全文總結(jié)51-52
- 參考文獻(xiàn)52-56
- 致謝56-57
- 攻讀學(xué)位期間所開展的科研項(xiàng)目和發(fā)表的學(xué)術(shù)論文57
【相似文獻(xiàn)】
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1 呂倩倩;計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)對(duì)ALK磷酸激酶抑制劑的研究[D];上海應(yīng)用技術(shù)學(xué)院;2015年
本文關(guān)鍵詞:計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)對(duì)ALK磷酸激酶抑制劑的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號(hào):352218
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