本文關(guān)鍵詞：抗腫瘤藥物靶蛋白:DUSP26和Tks4的結(jié)構(gòu)與反應(yīng)機(jī)制的研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：解析抗腫瘤藥物作用靶蛋白的結(jié)構(gòu)和功能的相互關(guān)系是開展抗腫瘤新藥的篩選的前提。本項研究中開展了人體內(nèi)的兩個抗腫瘤藥物靶點蛋白質(zhì)：二重特異性去磷酸化酶26(Dual-specificity phosphatase 26,簡稱DUSP26)口Tks4的結(jié)構(gòu)與功能研究。在本論文中,第一篇報道DUSP26的反應(yīng)機(jī)制研究和利用計算機(jī)輔助藥物篩選的DUSP26小分子抑制劑發(fā)現(xiàn)研究的結(jié)果,第二篇報道Tks4的C-端Src homology 3(SH3)結(jié)構(gòu)域的晶體學(xué)研究結(jié)果。DUSP26是近期確定的抗甲狀腺未分化癌等腫瘤藥物作用的新靶標(biāo)。作者的導(dǎo)師已經(jīng)成功測定了DUSP26的催化結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu),但DUSP26的反應(yīng)機(jī)理尚不明確。為了獲得靶向DUSP26的抗腫瘤新藥的先導(dǎo)化合物,本項研究首先利用對硝基苯磷酸為底物的酶促動力學(xué)開展DUSP26反應(yīng)機(jī)制研究,從研究結(jié)果中獲得可作為藥物作用靶位后,利用計算機(jī)輔助設(shè)計技術(shù)構(gòu)建了用于分子對接篩選的藥效團(tuán)模型,而后利用分子對接法從中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院／北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所微生物來源天然化合物庫和百靈威公司化合物庫實施虛擬篩選,獲得了232種候選化合物。以對硝基苯磷酸為底物,驗證這些候選化合物的對DUSP26的抑制活性,從中發(fā)現(xiàn)了8種化合物具有抑制活性,其中的化合物2-hydroxy-4-{6-[(5Z)-5-[(4-methylphenyl)methylidene]-4-oxo-2-sulfanylidene-1,3-thiazolidin-3-yl]hexanamido} ben zoic acid的抑制活性高于已知唯一的DUSP26的抑制劑NSC-87877。研究結(jié)果證明了本人推測的DUSP26反應(yīng)機(jī)制的準(zhǔn)確性,化合物可以作為靶向DUSP26的抗腫瘤藥物先導(dǎo)化合物開展進(jìn)一步的研究。人體內(nèi)的抗腫瘤藥物靶蛋白Tks4的空間結(jié)構(gòu)尚不明確,為了解析它的結(jié)構(gòu)和功能的相互關(guān)系,開展了Tks4的C端SH3結(jié)構(gòu)域的晶體學(xué)研究。迄今為止,完成了這個結(jié)構(gòu)域的大腸桿菌原核表達(dá)、純化、結(jié)晶化和X射線衍射數(shù)據(jù)的測定,獲得了Tks4的C端SH3結(jié)構(gòu)域晶體的結(jié)晶學(xué)參數(shù)。為了獲得晶體結(jié)構(gòu),利用同晶置換法的晶體結(jié)構(gòu)研究正在開展。
【關(guān)鍵詞】：二重特異性去磷酸化酶26 反應(yīng)機(jī)理 計算機(jī)輔助藥物篩選 人體內(nèi)Tks4的C端 Src homology 3(SH3)結(jié)構(gòu)域 晶體學(xué)研究
【學(xué)位授予單位】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R979.1
【目錄】：

• 中英文縮略詞表4-5
• 計量單位表5-7
• 摘要7-8
• Abstract8-9
• 第一篇 二重特異性去磷酸化酶結(jié)構(gòu)與反應(yīng)機(jī)制研究9-55
• 第一章 文獻(xiàn)綜述9-16
• 1.1 計算機(jī)輔助藥物篩選簡介9-10
• 1.2 Dual-specificity phosphatase 26(DUSP26)的研究現(xiàn)狀10-15
• 1.3 本研究的目的和意義15-16
• 第二章 DUSP26的藥物作用靶位研究16-39
• 第一節(jié) DUSP26及截斷體表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建18-27
• 1.1 材料與試劑18-19
• 1.2 實驗方法19-26
• 1.3 實驗結(jié)果與討論26-27
• 第二節(jié) 蛋白的表達(dá)與純化27-32
• 2.1 材料與試劑27
• 2.2 實驗方法27-30
• 2.3 實驗結(jié)果與討論30-32
• 第三節(jié) DUSP26酶動力學(xué)研究32-39
• 3.1 材料與試劑32
• 3.2 實驗方法32-34
• 3.3 實驗結(jié)果與討論34-39
• 第三章 計算機(jī)輔助藥物篩選和小分子抑制活性驗證39-52
• 第一節(jié) DUSP26抑制劑藥效團(tuán)模型的建立及虛擬篩選39-45
• 1.1 材料與方法39-40
• 1.2 結(jié)果與討論40-45
• 第二節(jié) 候選化合物生物活性測試研究45-52
• 2.1 實驗材料45
• 2.2 實驗方法45-47
• 2.3 結(jié)果與討論47-52
• 第一篇 研究結(jié)果52-53
• 參考文獻(xiàn)53-55
• 第二篇 人體內(nèi)Tks4蛋白質(zhì)的C端SH3結(jié)構(gòu)域初期蛋白質(zhì)晶體學(xué)研究55-63
• 第一章 文獻(xiàn)綜述55-56
• 第二章 SH3結(jié)構(gòu)域的表達(dá)、純化、晶體化與X射線衍射數(shù)據(jù)收集56-61
• 2.1 蛋白表達(dá)與純化56-57
• 2.2 蛋白質(zhì)晶體的制備與X射線衍射數(shù)據(jù)的收集57-58
• 2.3 結(jié)果與討論58-61
• 參考文獻(xiàn)61-63
• 附錄63-65
• 致謝65-66
• 作者簡介66

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 嵇汝運;漫談藥物學(xué)與計算機(jī)輔助藥物設(shè)計[J];華東科技;1996年09期

2 袁身剛;;計算機(jī)輔助藥物設(shè)計[J];科學(xué);1995年05期

3 朱偉;陳可冀;徐筱杰;;計算機(jī)藥物虛擬篩選技術(shù)在中醫(yī)藥領(lǐng)域中的應(yīng)用前景[J];中國中西醫(yī)結(jié)合雜志;2007年03期

4 史寧;韋林毅;吳久鴻;;小分子抗腫瘤蛋白激酶抑制劑的研究進(jìn)展[J];中國藥學(xué)雜志;2011年23期

  本文關(guān)鍵詞：抗腫瘤藥物靶蛋白:DUSP26和Tks4的結(jié)構(gòu)與反應(yīng)機(jī)制的研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號：335952