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抗腫瘤藥物靶蛋白:DUSP26和Tks4的結(jié)構(gòu)與反應(yīng)機(jī)制的研究

發(fā)布時(shí)間:2017-04-30 01:08

  本文關(guān)鍵詞:抗腫瘤藥物靶蛋白:DUSP26和Tks4的結(jié)構(gòu)與反應(yīng)機(jī)制的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:解析抗腫瘤藥物作用靶蛋白的結(jié)構(gòu)和功能的相互關(guān)系是開(kāi)展抗腫瘤新藥的篩選的前提。本項(xiàng)研究中開(kāi)展了人體內(nèi)的兩個(gè)抗腫瘤藥物靶點(diǎn)蛋白質(zhì):二重特異性去磷酸化酶26(Dual-specificity phosphatase 26,簡(jiǎn)稱DUSP26)口Tks4的結(jié)構(gòu)與功能研究。在本論文中,第一篇報(bào)道DUSP26的反應(yīng)機(jī)制研究和利用計(jì)算機(jī)輔助藥物篩選的DUSP26小分子抑制劑發(fā)現(xiàn)研究的結(jié)果,第二篇報(bào)道Tks4的C-端Src homology 3(SH3)結(jié)構(gòu)域的晶體學(xué)研究結(jié)果。DUSP26是近期確定的抗甲狀腺未分化癌等腫瘤藥物作用的新靶標(biāo)。作者的導(dǎo)師已經(jīng)成功測(cè)定了DUSP26的催化結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu),但DUSP26的反應(yīng)機(jī)理尚不明確。為了獲得靶向DUSP26的抗腫瘤新藥的先導(dǎo)化合物,本項(xiàng)研究首先利用對(duì)硝基苯磷酸為底物的酶促動(dòng)力學(xué)開(kāi)展DUSP26反應(yīng)機(jī)制研究,從研究結(jié)果中獲得可作為藥物作用靶位后,利用計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)技術(shù)構(gòu)建了用于分子對(duì)接篩選的藥效團(tuán)模型,而后利用分子對(duì)接法從中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院/北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所微生物來(lái)源天然化合物庫(kù)和百靈威公司化合物庫(kù)實(shí)施虛擬篩選,獲得了232種候選化合物。以對(duì)硝基苯磷酸為底物,驗(yàn)證這些候選化合物的對(duì)DUSP26的抑制活性,從中發(fā)現(xiàn)了8種化合物具有抑制活性,其中的化合物2-hydroxy-4-{6-[(5Z)-5-[(4-methylphenyl)methylidene]-4-oxo-2-sulfanylidene-1,3-thiazolidin-3-yl]hexanamido} ben zoic acid的抑制活性高于已知唯一的DUSP26的抑制劑NSC-87877。研究結(jié)果證明了本人推測(cè)的DUSP26反應(yīng)機(jī)制的準(zhǔn)確性,化合物可以作為靶向DUSP26的抗腫瘤藥物先導(dǎo)化合物開(kāi)展進(jìn)一步的研究。人體內(nèi)的抗腫瘤藥物靶蛋白Tks4的空間結(jié)構(gòu)尚不明確,為了解析它的結(jié)構(gòu)和功能的相互關(guān)系,開(kāi)展了Tks4的C端SH3結(jié)構(gòu)域的晶體學(xué)研究。迄今為止,完成了這個(gè)結(jié)構(gòu)域的大腸桿菌原核表達(dá)、純化、結(jié)晶化和X射線衍射數(shù)據(jù)的測(cè)定,獲得了Tks4的C端SH3結(jié)構(gòu)域晶體的結(jié)晶學(xué)參數(shù)。為了獲得晶體結(jié)構(gòu),利用同晶置換法的晶體結(jié)構(gòu)研究正在開(kāi)展。
【關(guān)鍵詞】:二重特異性去磷酸化酶26 反應(yīng)機(jī)理 計(jì)算機(jī)輔助藥物篩選 人體內(nèi)Tks4的C端 Src homology 3(SH3)結(jié)構(gòu)域 晶體學(xué)研究
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:R979.1
【目錄】:
  • 中英文縮略詞表4-5
  • 計(jì)量單位表5-7
  • 摘要7-8
  • Abstract8-9
  • 第一篇 二重特異性去磷酸化酶結(jié)構(gòu)與反應(yīng)機(jī)制研究9-55
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述9-16
  • 1.1 計(jì)算機(jī)輔助藥物篩選簡(jiǎn)介9-10
  • 1.2 Dual-specificity phosphatase 26(DUSP26)的研究現(xiàn)狀10-15
  • 1.3 本研究的目的和意義15-16
  • 第二章 DUSP26的藥物作用靶位研究16-39
  • 第一節(jié) DUSP26及截?cái)囿w表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建18-27
  • 1.1 材料與試劑18-19
  • 1.2 實(shí)驗(yàn)方法19-26
  • 1.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論26-27
  • 第二節(jié) 蛋白的表達(dá)與純化27-32
  • 2.1 材料與試劑27
  • 2.2 實(shí)驗(yàn)方法27-30
  • 2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論30-32
  • 第三節(jié) DUSP26酶動(dòng)力學(xué)研究32-39
  • 3.1 材料與試劑32
  • 3.2 實(shí)驗(yàn)方法32-34
  • 3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論34-39
  • 第三章 計(jì)算機(jī)輔助藥物篩選和小分子抑制活性驗(yàn)證39-52
  • 第一節(jié) DUSP26抑制劑藥效團(tuán)模型的建立及虛擬篩選39-45
  • 1.1 材料與方法39-40
  • 1.2 結(jié)果與討論40-45
  • 第二節(jié) 候選化合物生物活性測(cè)試研究45-52
  • 2.1 實(shí)驗(yàn)材料45
  • 2.2 實(shí)驗(yàn)方法45-47
  • 2.3 結(jié)果與討論47-52
  • 第一篇 研究結(jié)果52-53
  • 參考文獻(xiàn)53-55
  • 第二篇 人體內(nèi)Tks4蛋白質(zhì)的C端SH3結(jié)構(gòu)域初期蛋白質(zhì)晶體學(xué)研究55-63
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述55-56
  • 第二章 SH3結(jié)構(gòu)域的表達(dá)、純化、晶體化與X射線衍射數(shù)據(jù)收集56-61
  • 2.1 蛋白表達(dá)與純化56-57
  • 2.2 蛋白質(zhì)晶體的制備與X射線衍射數(shù)據(jù)的收集57-58
  • 2.3 結(jié)果與討論58-61
  • 參考文獻(xiàn)61-63
  • 附錄63-65
  • 致謝65-66
  • 作者簡(jiǎn)介66

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 嵇汝運(yùn);漫談藥物學(xué)與計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)[J];華東科技;1996年09期

2 袁身剛;;計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)[J];科學(xué);1995年05期

3 朱偉;陳可冀;徐筱杰;;計(jì)算機(jī)藥物虛擬篩選技術(shù)在中醫(yī)藥領(lǐng)域中的應(yīng)用前景[J];中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合雜志;2007年03期

4 史寧;韋林毅;吳久鴻;;小分子抗腫瘤蛋白激酶抑制劑的研究進(jìn)展[J];中國(guó)藥學(xué)雜志;2011年23期


  本文關(guān)鍵詞:抗腫瘤藥物靶蛋白:DUSP26和Tks4的結(jié)構(gòu)與反應(yīng)機(jī)制的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):335952

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