反向?qū)幼鳛橐环N靶標(biāo)預(yù)測(cè)的有效工具,有許多方面仍待探究。對(duì)反向?qū)榆浖目陀^評(píng)價(jià)可以幫助我們更好地了解這些工具的長(zhǎng)處與短處,并在靶標(biāo)預(yù)測(cè)的過程中起到指導(dǎo)作用。本研究中,我們?cè)u(píng)估了Glide（SP）針對(duì)選擇性抑制劑與非選擇性抑制劑的靶標(biāo)預(yù)測(cè)能力。結(jié)果說明針對(duì)不同配體,對(duì)接打分的傾向可能存在差異,因此總體打分抽樣對(duì)幫助我們更好地理解某對(duì)配體受體間的對(duì)接打分具有重要的意義。另外,對(duì)接時(shí)結(jié)合口袋的輸入構(gòu)象對(duì)對(duì)接結(jié)果存在一定的影響。Glide （SP）顯示出較好的對(duì)非選擇性抑制劑的靶標(biāo)預(yù)測(cè)能力。然而,其對(duì)于選擇性抑制劑的靶標(biāo)預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度相對(duì)較低,說明該軟件不適用于這方面的工作。針對(duì)COVID-19的案例研究表面凝血因子Xa可能是氯喹的潛在靶點(diǎn)。因此,我們認(rèn)為對(duì)反向?qū)榆浖倪M(jìn)一步開發(fā)與靶點(diǎn)間打分差異的修正十分必要。 

【文章來源】：Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences. 2020,29(10)CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1. Introduction
2. Materials and methods
    2.1. Evaluation of datasets
    2.2. Structure preparation
    2.3. Molecular descriptors
    2.4. Molecular docking
3. Results and discussion
    3.1. Physicochemical property analysis
    3.2. Overall scoring sampling
    3.3. Influence of protein conformation changes
    3.4. Prediction precision of the general inhibitors
    3.5. Prediction precision of the selective inhibitors
    3.6. A case study about COVID-19
4. Conclusions



本文編號(hào)：3219560