Phoma sp.XZ068的基因組分析及其雜萜產(chǎn)物的生物合成研究
發(fā)布時間:2020-12-16 11:48
真菌次級代謝產(chǎn)物作為藥物先導(dǎo)化合物的重要來源,近年來成為藥物研發(fā)的熱點領(lǐng)域之一。本課題組前期從低溫來源莖點霉屬真菌Phoma sp.XZ068中獲得了一系列具有環(huán)庚三烯酚酮-倍半萜骨架結(jié)構(gòu)的雜萜類化合物,體外活性評價表明該類化合物具有良好的細胞毒活性,其中eupenifeldin對神經(jīng)膠質(zhì)瘤細胞的增殖具有顯著的抑制活性,有望成為治療神經(jīng)膠質(zhì)瘤藥物的先導(dǎo)分子。為深入研究該類化合物的生物合成,本研究對產(chǎn)生菌Phoma sp.XZ068進行了全基因組測序及生物信息學(xué)分析,并在此基礎(chǔ)上開展了 eupenifeldin類雜萜的生物合成研究。本研究基于Phoma sp.XZ068的全基因組數(shù)據(jù)對其基因組特征進行了描述,并分析預(yù)測了該菌株可能的生存策略,同時對該菌株次級代謝產(chǎn)物的生物合成基因簇進行了預(yù)測及轉(zhuǎn)錄驗證,揭示了該菌株在大米培養(yǎng)基上合成的次級代謝產(chǎn)物結(jié)構(gòu)類型較為豐富。在此基礎(chǔ)上,結(jié)合生物信息學(xué)分析、基因敲除實驗及發(fā)酵產(chǎn)物的化學(xué)分析,鑒定了 eupenifeldin的生物合成基因簇eup,并對簇內(nèi)各基因的功能進行了預(yù)測及驗證。通過體外酶學(xué)功能驗證及體內(nèi)基因高表達實驗,對簇中與eupenifel...
【文章來源】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:131 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.7在構(gòu)巢曲霉中進行青霉素生物合成途徑的重構(gòu)[25]??對于現(xiàn)有真菌次級代謝產(chǎn)物基因簇的信息進行統(tǒng)計分析,結(jié)果表明真菌體內(nèi)??大部分次級代謝產(chǎn)物由于培養(yǎng)條件的限制、分離方法的不適以及自身代謝網(wǎng)絡(luò)的??
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大部分該類化合物都具有較強的生理活性及藥用價值,對于麥角生物??堿的合成生物學(xué)研宄也己開展,其中麥角堿cycloclavine的生物合成己在釀酒酵??母中實現(xiàn)(圖1.9),并通過優(yōu)化其前體化合物的合成途徑將其產(chǎn)量提高至500??mg/L[32],為后續(xù)基于化合物cycloclavine的藥物研發(fā)奠定了堅實的基礎(chǔ)。??a)?Cl?Y?。陽w?j?f'????S>PP?^??X/->c〇2h??L-Tryptophan?DMAPP?HjN?HN??DMAT?/V-Me-OMAT??1??h、?,〇〇?[M???HI*?=?255?Ea?E/E**C?\?Oxkkxeductasa/??u,?A?I?Catalase??|?j?Chanoclavtne-I?aldehyde?j?^?.OH??,?T39?^??ii?I?V??hLT??Chanodavine-4??,〇〇?T?卜241?;??EasD?!?Oxidase??Chanoda>nnd-l??f|?I?A|_Ea*A?Reductase?.??w?.?A*_A???ALG?*?A(_H?by-proAje*?J?\?丄?Aj_EasH?Ooxygenase??°*???一???H?廣、|?A|_EwG?Reductase?h??:
【參考文獻】:
期刊論文
[1]特殊生境真菌來源的新結(jié)構(gòu)活性物質(zhì)研究[J]. 車永勝. 國際藥學(xué)研究雜志. 2011(01)
[2]從南方山荷葉分離出一株產(chǎn)鬼臼毒素類似物的內(nèi)生真菌[J]. 曾松榮,邵華,張玲琪. 微生物學(xué)雜志. 2004(04)
[3]一株產(chǎn)長春新堿內(nèi)生真菌的初步研究[J]. 楊顯志,張玲琪,郭波,郭仕平. 中草藥. 2004(01)
[4]長春花內(nèi)生真菌的分離及其發(fā)酵產(chǎn)生藥用成分的初步研究[J]. 張玲琪,郭波,李海燕,曾松榮,邵華谷蘇,魏蓉城. 中草藥. 2000(11)
博士論文
[1]兩株海洋真菌來源的混源萜類次級代謝產(chǎn)物研究[D]. 張國建.中國海洋大學(xué) 2011
碩士論文
[1]兩株地中海海鞘和海綿來源的內(nèi)生真菌次級代謝產(chǎn)物及其生物活性研究[D]. 李莉.中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院海洋研究所) 2018
本文編號:2920090
【文章來源】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:131 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.7在構(gòu)巢曲霉中進行青霉素生物合成途徑的重構(gòu)[25]??對于現(xiàn)有真菌次級代謝產(chǎn)物基因簇的信息進行統(tǒng)計分析,結(jié)果表明真菌體內(nèi)??大部分次級代謝產(chǎn)物由于培養(yǎng)條件的限制、分離方法的不適以及自身代謝網(wǎng)絡(luò)的??
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大部分該類化合物都具有較強的生理活性及藥用價值,對于麥角生物??堿的合成生物學(xué)研宄也己開展,其中麥角堿cycloclavine的生物合成己在釀酒酵??母中實現(xiàn)(圖1.9),并通過優(yōu)化其前體化合物的合成途徑將其產(chǎn)量提高至500??mg/L[32],為后續(xù)基于化合物cycloclavine的藥物研發(fā)奠定了堅實的基礎(chǔ)。??a)?Cl?Y?。陽w?j?f'????S>PP?^??X/->c〇2h??L-Tryptophan?DMAPP?HjN?HN??DMAT?/V-Me-OMAT??1??h、?,〇〇?[M???HI*?=?255?Ea?E/E**C?\?Oxkkxeductasa/??u,?A?I?Catalase??|?j?Chanoclavtne-I?aldehyde?j?^?.OH??,?T39?^??ii?I?V??hLT??Chanodavine-4??,〇〇?T?卜241?;??EasD?!?Oxidase??Chanoda>nnd-l??f|?I?A|_Ea*A?Reductase?.??w?.?A*_A???ALG?*?A(_H?by-proAje*?J?\?丄?Aj_EasH?Ooxygenase??°*???一???H?廣、|?A|_EwG?Reductase?h??:
【參考文獻】:
期刊論文
[1]特殊生境真菌來源的新結(jié)構(gòu)活性物質(zhì)研究[J]. 車永勝. 國際藥學(xué)研究雜志. 2011(01)
[2]從南方山荷葉分離出一株產(chǎn)鬼臼毒素類似物的內(nèi)生真菌[J]. 曾松榮,邵華,張玲琪. 微生物學(xué)雜志. 2004(04)
[3]一株產(chǎn)長春新堿內(nèi)生真菌的初步研究[J]. 楊顯志,張玲琪,郭波,郭仕平. 中草藥. 2004(01)
[4]長春花內(nèi)生真菌的分離及其發(fā)酵產(chǎn)生藥用成分的初步研究[J]. 張玲琪,郭波,李海燕,曾松榮,邵華谷蘇,魏蓉城. 中草藥. 2000(11)
博士論文
[1]兩株海洋真菌來源的混源萜類次級代謝產(chǎn)物研究[D]. 張國建.中國海洋大學(xué) 2011
碩士論文
[1]兩株地中海海鞘和海綿來源的內(nèi)生真菌次級代謝產(chǎn)物及其生物活性研究[D]. 李莉.中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院海洋研究所) 2018
本文編號:2920090
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