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基于矩陣填充算法對(duì)抗癌藥物敏感性缺失數(shù)據(jù)的預(yù)測(cè)

發(fā)布時(shí)間:2020-06-29 13:11
【摘要】:數(shù)據(jù)缺失為大數(shù)據(jù)的分析帶來(lái)諸多不便,矩陣填充作為處理缺失數(shù)據(jù)的重要手段已成為大數(shù)據(jù)分析的一個(gè)重要研究課題,F(xiàn)今,腫瘤已經(jīng)嚴(yán)重威脅人類健康,是致死的重要元兇之一。由于腫瘤的異質(zhì)性,在患者用藥前進(jìn)行臨床試驗(yàn),測(cè)量腫瘤細(xì)胞系對(duì)于抗腫瘤藥物的敏感性試驗(yàn)是選擇適合癌癥患者藥物的常規(guī)手段。然而,由于藥物敏感性試驗(yàn)經(jīng)常受到實(shí)驗(yàn)條件、實(shí)驗(yàn)設(shè)備、實(shí)驗(yàn)材料等的干擾與限制,使得獲取的藥物敏感性數(shù)據(jù)經(jīng)常存在缺失。本文根據(jù)生物學(xué)數(shù)據(jù)的特性,首先構(gòu)造計(jì)算模型挖掘生物學(xué)數(shù)據(jù)中癌細(xì)胞系的相似性以及抗腫瘤藥物的相似性等關(guān)聯(lián)信息;然后將這些信息融合到已有的矩陣填充模型提出了一個(gè)新的低秩矩陣填充模型;根據(jù)模型給出了相關(guān)的數(shù)學(xué)的證明和模型實(shí)現(xiàn)的具體算法;應(yīng)用該模型到抗腫瘤藥物敏感性數(shù)據(jù)庫(kù)的兩組具體數(shù)據(jù),預(yù)測(cè)它們的缺失數(shù)據(jù)。最后利用10倍交叉驗(yàn)證法和均方根誤差評(píng)估該模型的填充效果。本文所得結(jié)果與已有模型填充效果比較顯示本文的模型能有效的提高預(yù)測(cè)的效果。
【學(xué)位授予單位】:浙江理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:TP311.13;R979.1

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本文編號(hào):2733906

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